More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5087 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
277 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0347861  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4055  MotA/TolQ/ExbB proton channel  68.87 
 
 
279 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.072513  hitchhiker  0.00000250214 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  60 
 
 
275 aa  309  4e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1426  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.64 
 
 
286 aa  277  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.96 
 
 
280 aa  271  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0493  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.21 
 
 
274 aa  231  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.13 
 
 
248 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.46 
 
 
248 aa  192  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.66 
 
 
267 aa  192  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.38391  normal  0.963461 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0729  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.13 
 
 
248 aa  192  5e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.535753  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.66 
 
 
248 aa  191  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.320188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1963  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.78 
 
 
248 aa  187  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.99 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0549  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.09 
 
 
247 aa  155  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23318  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.65 
 
 
208 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.02 
 
 
218 aa  85.9  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  30.13 
 
 
465 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  31.47 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.16 
 
 
209 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.69 
 
 
209 aa  84  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.33 
 
 
206 aa  81.6  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.33 
 
 
206 aa  81.6  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.71 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.66 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.29 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  30.29 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.5 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.5 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.5 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.15 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  30.81 
 
 
474 aa  79  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.8 
 
 
235 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.72 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.65 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.14 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.54 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.65 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  30.61 
 
 
224 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  31 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.43 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.28 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  28.74 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.24 
 
 
576 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.26 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.978169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2261  protein TolQ  28.57 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.41 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  31.16 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.49 
 
 
253 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.3 
 
 
251 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108923  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.84 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.37 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.22 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.22 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.16 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.72 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  37.96 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.5 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265292  hitchhiker  0.00010169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.44 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  29.38 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  24.22 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.73 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  37.37 
 
 
237 aa  71.6  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.29 
 
 
230 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728472  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  37.37 
 
 
237 aa  71.6  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.86 
 
 
230 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2672  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.86 
 
 
230 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.866778  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  25 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.63 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.52 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.3 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.93 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  30.99 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.16 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.92 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.53 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.37 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2130  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.32 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0769434  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.8 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.76 
 
 
478 aa  68.9  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  40.59 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.32 
 
 
221 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.13 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2089  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000689785  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.71 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.34 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.05 
 
 
480 aa  68.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.29 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.29 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.9 
 
 
214 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  25.74 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  37 
 
 
224 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  37 
 
 
224 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.28 
 
 
221 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.22 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2273  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.71 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>