More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1721 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
241 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  65.02 
 
 
246 aa  262  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.02 
 
 
243 aa  250  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0782  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  55.98 
 
 
270 aa  234  7e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.15 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.08 
 
 
237 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.02 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  33.18 
 
 
229 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.29 
 
 
257 aa  111  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.88 
 
 
236 aa  109  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3579  biopolymer transport protein  35.08 
 
 
234 aa  109  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.159406  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.16 
 
 
204 aa  109  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.7 
 
 
234 aa  108  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  32.62 
 
 
201 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  36.21 
 
 
228 aa  106  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.68 
 
 
206 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.06 
 
 
217 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.55 
 
 
218 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  31.88 
 
 
211 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  31.88 
 
 
211 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.55 
 
 
203 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.31 
 
 
235 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  29.07 
 
 
220 aa  99.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.63 
 
 
253 aa  98.6  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.51 
 
 
199 aa  97.4  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.18 
 
 
480 aa  97.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.38 
 
 
208 aa  95.5  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  30.21 
 
 
465 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.02 
 
 
206 aa  95.1  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.84 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.2 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
202 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.86 
 
 
216 aa  93.2  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.05 
 
 
576 aa  93.2  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.25 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  33.8 
 
 
455 aa  92.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.46 
 
 
218 aa  92.4  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  29.8 
 
 
474 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.23 
 
 
339 aa  90.1  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.12 
 
 
204 aa  89.7  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.77 
 
 
224 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.77 
 
 
224 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.77 
 
 
224 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.43 
 
 
248 aa  88.6  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.37 
 
 
455 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.86 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  30.85 
 
 
470 aa  87.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.23 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156891  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0493  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.35 
 
 
274 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30 
 
 
206 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4055  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28 
 
 
279 aa  86.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.072513  hitchhiker  0.00000250214 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.47 
 
 
209 aa  87  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
206 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.73 
 
 
222 aa  86.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  30.93 
 
 
234 aa  86.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2957  biopolymer transport proteins-like  30.84 
 
 
242 aa  86.3  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1426  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.91 
 
 
286 aa  86.3  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.06 
 
 
280 aa  85.9  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.82 
 
 
248 aa  85.9  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  33 
 
 
453 aa  85.1  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.47 
 
 
206 aa  85.1  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.63 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.78 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  39.37 
 
 
451 aa  84.7  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1963  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.32 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075566  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34.29 
 
 
457 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.35 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  30.52 
 
 
206 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03434  putative Tol protein  32.98 
 
 
454 aa  82  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.85 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.31 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.25 
 
 
206 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  29.8 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.32 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2130  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.73 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0769434  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.02 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0542744  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.11 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894281  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.29 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0347861  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.68 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.15 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.12 
 
 
451 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0356539  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1518  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.57 
 
 
451 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.298092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.44 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.56 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.15 
 
 
209 aa  78.2  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.37 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.64 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.56 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.56 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1848  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.91 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.775268  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.23 
 
 
457 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.84 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.89 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0549  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.11 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23318  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  39.34 
 
 
453 aa  77  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  30 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.46 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.4 
 
 
469 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>