More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1521 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
238 aa  474  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.12 
 
 
204 aa  190  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  42.36 
 
 
229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.8 
 
 
237 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  41.31 
 
 
228 aa  179  4.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.16 
 
 
226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156891  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.64 
 
 
236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.62 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.34 
 
 
234 aa  159  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.06 
 
 
230 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3579  biopolymer transport protein  36.06 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.159406  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.5 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.61 
 
 
246 aa  128  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.15 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.17 
 
 
206 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.1 
 
 
339 aa  125  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.36 
 
 
243 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.44 
 
 
209 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  35.35 
 
 
234 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.31 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.68 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.1 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.82 
 
 
208 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.75 
 
 
224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.18 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34.18 
 
 
206 aa  116  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.18 
 
 
206 aa  116  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  34.33 
 
 
211 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  34.33 
 
 
211 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.75 
 
 
224 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1898  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.81 
 
 
224 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000558815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.59 
 
 
208 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.14 
 
 
206 aa  111  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.82 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.1 
 
 
207 aa  108  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.56 
 
 
206 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.96 
 
 
238 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  38.42 
 
 
470 aa  106  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.24 
 
 
231 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.82 
 
 
210 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.77 
 
 
263 aa  105  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.426551  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
202 aa  105  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.82 
 
 
211 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  35.62 
 
 
465 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  33.66 
 
 
474 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  33 
 
 
220 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.01 
 
 
204 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.31 
 
 
210 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  32 
 
 
201 aa  102  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.32 
 
 
216 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.2 
 
 
218 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.35 
 
 
224 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.35 
 
 
224 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.35 
 
 
224 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.78 
 
 
208 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.41 
 
 
480 aa  102  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.17 
 
 
206 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0782  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.96 
 
 
270 aa  101  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.87 
 
 
226 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.11 
 
 
248 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.84 
 
 
221 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.65 
 
 
201 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.65 
 
 
212 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.65 
 
 
212 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.99 
 
 
220 aa  99.8  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.17 
 
 
220 aa  99.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  33.99 
 
 
220 aa  99.8  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  31.71 
 
 
206 aa  99  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.5 
 
 
203 aa  99.4  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  31.37 
 
 
220 aa  99.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.28 
 
 
222 aa  99  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
216 aa  98.2  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.21 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.6 
 
 
216 aa  97.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.48 
 
 
209 aa  97.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.17 
 
 
200 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0542744  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.71 
 
 
206 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.78 
 
 
248 aa  96.3  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.7 
 
 
204 aa  96.3  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.08 
 
 
192 aa  94.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.67 
 
 
210 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.31 
 
 
235 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894281  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.77 
 
 
576 aa  93.2  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.68 
 
 
200 aa  92.8  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.94 
 
 
324 aa  93.2  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.26 
 
 
214 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.79 
 
 
308 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1963  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.9 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075566  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.21 
 
 
209 aa  90.9  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.79 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3762  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.57 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.457209  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4237  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.88 
 
 
308 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.05 
 
 
235 aa  88.6  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.76 
 
 
252 aa  88.2  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.1 
 
 
230 aa  88.2  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728472  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.82 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  31.31 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.42 
 
 
252 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.37 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.42 
 
 
252 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>