More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3755 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3755  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  100 
 
 
449 aa  903    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2989  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.4 
 
 
450 aa  485  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.347147  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2651  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49 
 
 
451 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12619  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.55 
 
 
451 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0356539  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1518  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.44 
 
 
451 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.298092  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2463  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.78 
 
 
451 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080951  hitchhiker  0.00000350745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1641  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.33 
 
 
451 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0893157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1626  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.33 
 
 
451 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.171295  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1663  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.33 
 
 
451 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204687  normal  0.14505 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2477  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49 
 
 
451 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.373641  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.11 
 
 
451 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0125203  decreased coverage  0.0000000188451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1825  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  49 
 
 
451 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2533  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.33 
 
 
451 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0106655  unclonable  0.0000291193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2625  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.55 
 
 
451 aa  411  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000348965  hitchhiker  0.00000191471 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.89 
 
 
451 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00501831  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2625  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.78 
 
 
451 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00264646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2424  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.21 
 
 
450 aa  395  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00633842  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1255  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.88 
 
 
451 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  unclonable  0.0000153929 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02813  TonB system biopolymer transport component  56.05 
 
 
343 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000924577  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.45 
 
 
478 aa  353  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.02 
 
 
457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03434  putative Tol protein  39.78 
 
 
454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0353  TonB system biopolymer transport component  39.17 
 
 
460 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.899068  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.09 
 
 
453 aa  315  9e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.52 
 
 
449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  40.85 
 
 
453 aa  313  5.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.28 
 
 
469 aa  309  8e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297335  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0869  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.36 
 
 
462 aa  266  8e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.24 
 
 
457 aa  265  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  36.73 
 
 
453 aa  263  6e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  34.82 
 
 
455 aa  249  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  34.95 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34 
 
 
455 aa  226  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0436  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.72 
 
 
403 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0887055  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.36 
 
 
469 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  28.78 
 
 
474 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.18 
 
 
576 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  26.93 
 
 
470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.65 
 
 
480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  26.72 
 
 
465 aa  127  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.82 
 
 
469 aa  99.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2815  biopolymer transport proteins-like  30.19 
 
 
464 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00525326  hitchhiker  0.00000294383 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.75 
 
 
253 aa  91.3  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.56 
 
 
218 aa  88.6  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.82 
 
 
488 aa  88.2  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  28.43 
 
 
220 aa  86.7  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
206 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.29 
 
 
206 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.33 
 
 
206 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.15 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.05 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1737  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.26 
 
 
201 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.86 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.23 
 
 
214 aa  81.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.15 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.84 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2154  biopolymer transport protein (ExbB)-like  40.17 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.93 
 
 
224 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2957  biopolymer transport proteins-like  29.47 
 
 
242 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.93 
 
 
224 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.93 
 
 
224 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  30.21 
 
 
220 aa  77  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.21 
 
 
220 aa  77  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.09 
 
 
209 aa  77  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  34.88 
 
 
201 aa  76.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  32.88 
 
 
211 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.06 
 
 
204 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  32.88 
 
 
211 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  26.94 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0782  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.08 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.42 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.96 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.65 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.75 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1152  TonB system transport protein ExbB2  26.97 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1598  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.35 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506582  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.61 
 
 
235 aa  72.4  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  29.53 
 
 
206 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.5 
 
 
235 aa  72.4  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.2 
 
 
206 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.75 
 
 
207 aa  72  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.79 
 
 
217 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0608  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.82 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00236146  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0903  TonB system transport protein ExbB3  26.95 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.63 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.86 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000846  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  27.49 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.95 
 
 
206 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06758  hypothetical protein  27.06 
 
 
184 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2988  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.87 
 
 
174 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.649663  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0113  TonB system transport protein ExbB2  27.78 
 
 
169 aa  68.6  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.9 
 
 
218 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.3 
 
 
199 aa  68.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001858  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  27.12 
 
 
175 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0349  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 
226 aa  68.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.931428  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.17 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.04 
 
 
339 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00635  biopolymer transport protein  25.99 
 
 
175 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  33.33 
 
 
253 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  30.12 
 
 
220 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>