More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0442 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
211 aa  427  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3073  MotA/TolQ/ExbB proton channel  84.1 
 
 
211 aa  344  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.59 
 
 
222 aa  234  8e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  55.88 
 
 
220 aa  227  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.46 
 
 
217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1598  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.57 
 
 
221 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506582  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1228  putative adventurous gliding motility protein R  50.76 
 
 
217 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258731  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.43 
 
 
235 aa  201  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894281  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2957  biopolymer transport proteins-like  51.01 
 
 
242 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.5 
 
 
226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.63 
 
 
216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3392  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.73 
 
 
223 aa  111  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0363447  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
576 aa  90.9  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28 
 
 
243 aa  89.4  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.18 
 
 
206 aa  89  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  33.67 
 
 
465 aa  88.2  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.09 
 
 
480 aa  88.2  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.95 
 
 
241 aa  87.8  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.82 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.37 
 
 
246 aa  87  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  32.29 
 
 
470 aa  86.3  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.37 
 
 
235 aa  85.5  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.93 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.29 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.65 
 
 
208 aa  82  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.24 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  31.18 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  26.18 
 
 
474 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.59 
 
 
469 aa  80.1  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.1 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.24 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  32.99 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  32.99 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.65 
 
 
230 aa  78.2  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.29 
 
 
478 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  29.08 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.94 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.94 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  27.98 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3579  biopolymer transport protein  27.46 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.159406  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.99 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.4 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.99 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.74 
 
 
449 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2651  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.06 
 
 
451 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.82 
 
 
238 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1426  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.42 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.9 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.5 
 
 
451 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0356539  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  26.9 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1518  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.42 
 
 
451 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.298092  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.63 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.03 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1255  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.65 
 
 
451 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  unclonable  0.0000153929 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  39.6 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  39.6 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.69 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0869  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.81 
 
 
462 aa  69.3  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.81 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  38.61 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  30.33 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.51 
 
 
469 aa  68.6  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297335  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3755  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.63 
 
 
449 aa  68.2  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.45 
 
 
457 aa  68.2  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1825  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.78 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.8 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.53 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  28.18 
 
 
275 aa  67  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.9 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0287  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.38 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0549  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.67 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23318  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.59 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.51 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.95 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156891  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  25.48 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  25.48 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.25 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2463  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.78 
 
 
451 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080951  hitchhiker  0.00000350745 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.55 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.03 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2424  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.78 
 
 
450 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00633842  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2625  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.78 
 
 
451 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000348965  hitchhiker  0.00000191471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  34.95 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.78 
 
 
453 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.67 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.65 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2533  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.78 
 
 
451 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0106655  unclonable  0.0000291193 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1898  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.19 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000558815 
 
 
-
 
NC_002950  PG0782  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.48 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  35.78 
 
 
453 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.92 
 
 
243 aa  65.1  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1626  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.78 
 
 
451 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.171295  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1663  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.78 
 
 
451 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204687  normal  0.14505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1641  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.78 
 
 
451 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0893157  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.16 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  30.32 
 
 
231 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2625  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.66 
 
 
451 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00264646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>