More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3073 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3073  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
211 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel  84.1 
 
 
211 aa  344  6e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.04 
 
 
222 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  57.35 
 
 
220 aa  228  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.94 
 
 
217 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2957  biopolymer transport proteins-like  52.24 
 
 
242 aa  204  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.5 
 
 
235 aa  204  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894281  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1228  putative adventurous gliding motility protein R  49.25 
 
 
217 aa  194  9e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258731  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1598  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.11 
 
 
221 aa  192  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.26 
 
 
226 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.75 
 
 
224 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.75 
 
 
224 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.75 
 
 
224 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.35 
 
 
216 aa  119  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3392  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.22 
 
 
223 aa  108  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0363447  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.84 
 
 
576 aa  93.2  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.91 
 
 
480 aa  90.9  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.43 
 
 
238 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.64 
 
 
243 aa  88.2  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  29.38 
 
 
474 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.61 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.39 
 
 
241 aa  86.3  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  29.86 
 
 
234 aa  86.3  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.33 
 
 
246 aa  86.3  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.9 
 
 
208 aa  85.5  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.88 
 
 
235 aa  85.5  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.77 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  33.16 
 
 
465 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.14 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.99 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  33.02 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.97 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.47 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.14 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.14 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.48 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.52 
 
 
216 aa  78.2  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  28.57 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  28.99 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  30.37 
 
 
470 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  28.57 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.5 
 
 
478 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.29 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.86 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.04 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  26 
 
 
204 aa  74.7  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.05 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.74 
 
 
449 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.07 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.3 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.56 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  29.56 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.14 
 
 
208 aa  72  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  26.53 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.98 
 
 
212 aa  72  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0287  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.4 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.98 
 
 
212 aa  72  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.54 
 
 
202 aa  71.2  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  25.6 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  25.6 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3579  biopolymer transport protein  26.5 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.159406  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34.65 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.26 
 
 
469 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297335  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  29.28 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.21 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.51 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.7 
 
 
469 aa  68.9  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.23 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  26.67 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.9 
 
 
236 aa  68.2  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1426  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.4 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  30.29 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.9 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.29 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2651  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.86 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12619  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.67 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03434  putative Tol protein  31.02 
 
 
454 aa  67.4  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1518  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.46 
 
 
451 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.298092  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3755  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  26.94 
 
 
449 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1825  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.78 
 
 
451 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.92 
 
 
451 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0356539  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.36 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.85 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  35.78 
 
 
453 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.11 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.78 
 
 
453 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0782  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  24.76 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  34.75 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.9 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.1 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.43 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.73 
 
 
192 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  36.63 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.54 
 
 
248 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.47 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  26.9 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0549  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.8 
 
 
247 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23318  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.84 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1255  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.94 
 
 
451 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  unclonable  0.0000153929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>