More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3579 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3579  biopolymer transport protein  100 
 
 
234 aa  466  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.159406  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.03 
 
 
237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.27 
 
 
226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156891  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.3 
 
 
236 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.77 
 
 
236 aa  193  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.26 
 
 
230 aa  178  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.3 
 
 
204 aa  171  9e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  40.93 
 
 
228 aa  166  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.06 
 
 
238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.25 
 
 
234 aa  157  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  38.38 
 
 
229 aa  153  2e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.08 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.63 
 
 
209 aa  123  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.86 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0782  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.16 
 
 
270 aa  119  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.33 
 
 
246 aa  120  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.11 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  33.5 
 
 
234 aa  112  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.66 
 
 
253 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.5 
 
 
208 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.5 
 
 
206 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.47 
 
 
210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.49 
 
 
218 aa  108  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  30.56 
 
 
474 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.5 
 
 
208 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.77 
 
 
576 aa  96.7  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.21 
 
 
480 aa  97.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.5 
 
 
235 aa  96.7  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.04 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.99 
 
 
263 aa  95.1  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.426551  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.34 
 
 
204 aa  95.1  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.88 
 
 
218 aa  95.1  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.93 
 
 
339 aa  94.7  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.93 
 
 
220 aa  94  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  28.93 
 
 
220 aa  94  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.5 
 
 
204 aa  93.6  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.15 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
200 aa  92.8  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.43 
 
 
207 aa  92.8  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  28.71 
 
 
211 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  28.71 
 
 
211 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.46 
 
 
220 aa  92.4  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28 
 
 
199 aa  92  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.53 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.29 
 
 
221 aa  89  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.92 
 
 
255 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  29.49 
 
 
470 aa  88.6  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.16 
 
 
308 aa  88.6  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  31.47 
 
 
220 aa  88.2  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
221 aa  87  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.8 
 
 
251 aa  87  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.91 
 
 
257 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4034  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.02 
 
 
233 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.133642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.02 
 
 
233 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.02 
 
 
233 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143236  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.79 
 
 
227 aa  85.9  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.04 
 
 
206 aa  85.9  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.4 
 
 
216 aa  85.5  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.12 
 
 
209 aa  85.1  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.5 
 
 
211 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.06 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.08 
 
 
217 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  29.55 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.27 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.85 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.27 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.85 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.38 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.68 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.44 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0287  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.57 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.85 
 
 
252 aa  82  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  28.36 
 
 
220 aa  82  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.85 
 
 
229 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265292  hitchhiker  0.00010169 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.76 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.92 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0347861  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.76 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.81 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.5 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5123  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.87 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.13 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1426  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.77 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.98 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.55 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.12 
 
 
202 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.33 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  28.98 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  27.88 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  31.3 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  27.14 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2357  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.81 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243878  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.4 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.87 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.87 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.87 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  26.94 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.53 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  32.17 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>