More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5123 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5123  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
234 aa  443  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.45 
 
 
204 aa  105  8e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0349  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.57 
 
 
226 aa  101  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.931428  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.29 
 
 
257 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1848  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.1 
 
 
239 aa  98.6  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.775268  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.53 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  29.08 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.93 
 
 
214 aa  92  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.79 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.51 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.65 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.56 
 
 
220 aa  85.1  8e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  36.56 
 
 
220 aa  85.1  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.93 
 
 
237 aa  85.1  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.47 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.74 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  34.97 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  31.58 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.61 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728472  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  36.65 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.51 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.41 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0454  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.76 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0157661  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.32 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.72 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.27 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2393  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.79 
 
 
197 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.94 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  34.18 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.56 
 
 
202 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.68 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.16 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.29 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  37.23 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  37.23 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.02 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.38 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.43 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156891  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.77 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.69 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.41 
 
 
210 aa  72  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.2 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.1 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2130  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.07 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0769434  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.29 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  32.49 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3579  biopolymer transport protein  29.02 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.159406  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.22 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.39 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.43 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.29 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.2 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.4 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2957  biopolymer transport proteins-like  32.45 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.98 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.72 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.37 
 
 
192 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.72 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.98 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.72 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.89 
 
 
218 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.01 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.86 
 
 
457 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05243  biopolymer transport protein  28.5 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1865  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.26 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.646793 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  27.38 
 
 
228 aa  63.2  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4237  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.74 
 
 
308 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34.48 
 
 
607 aa  62.4  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.18 
 
 
226 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  41.76 
 
 
453 aa  62  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.74 
 
 
308 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  40.66 
 
 
455 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.66 
 
 
455 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4089  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.24 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.369389  normal  0.337836 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0287  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.51 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2947  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.66 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.35 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  40.66 
 
 
451 aa  60.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
308 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.17 
 
 
234 aa  60.1  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
555 aa  60.1  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.41 
 
 
204 aa  59.7  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.46 
 
 
243 aa  59.3  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.22 
 
 
308 aa  58.9  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.31 
 
 
247 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.02 
 
 
324 aa  58.9  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0436  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.94 
 
 
403 aa  58.5  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0887055  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.35 
 
 
235 aa  58.9  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.79 
 
 
206 aa  58.9  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.4 
 
 
576 aa  58.9  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.79 
 
 
206 aa  58.9  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.24 
 
 
594 aa  58.5  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0718  tonB-system energizer ExbB  37.5 
 
 
142 aa  58.5  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.29 
 
 
598 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.26 
 
 
449 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.54 
 
 
585 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0353  TonB system biopolymer transport component  40.91 
 
 
460 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.899068  normal  0.349209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>