More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2393 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2393  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 197 aa  397  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4089  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.02 
 
 		 236 aa  164  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.369389  normal  0.337836 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.13 
 
 		 249 aa  134  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.22 
 
 		 233 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4237  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.75 
 
 		 308 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.25 
 
 		 308 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1848  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.22 
 
 		 239 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.775268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.75 
 
 		 308 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.33 
 
 		 257 aa  121  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.83 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0454  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.53 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0157661  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0349  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.43 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.931428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.22 
 
 		 232 aa  99.4  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2130  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.31 
 
 		 228 aa  95.5  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0769434  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.19 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.43 
 
 		 216 aa  91.3  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  32.93 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.56 
 
 		 480 aa  79  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.52 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  44.83 
 
 		 474 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.35 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.49 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.26 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5123  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.95 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1853  biopolymer transport exbB protein  35.58 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.19 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.14 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.1 
 
 		 457 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  45.98 
 
 		 465 aa  71.2  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.94 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.82 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  26.74 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  41.94 
 
 		 470 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.65 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.22 
 
 		 457 aa  68.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  46.05 
 
 		 455 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.07 
 
 		 576 aa  68.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.78 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  31.61 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  45.95 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  31.29 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.95 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.36 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4594  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.55 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  33.92 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  33.92 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  30.97 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  44.59 
 
 		 451 aa  66.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3382  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.5 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000129068 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  38.55 
 
 		 453 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  35.05 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2815  biopolymer transport proteins-like  45.57 
 
 		 464 aa  65.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00525326  hitchhiker  0.00000294383 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.55 
 
 		 453 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  30.05 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  38.27 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3788  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.07 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.84 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0118  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.22 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0409  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.29 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  27.75 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.31 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 555 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.5 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 		 488 aa  63.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03434  putative Tol protein  43.24 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0186  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.22 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.715904  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.96 
 
 		 469 aa  62.8  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.29 
 
 		 469 aa  63.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297335  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.41 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0782  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.86 
 
 		 270 aa  62  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.49 
 
 		 226 aa  62  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.91 
 
 		 234 aa  62  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0353  TonB system biopolymer transport component  29 
 
 		 460 aa  62  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.899068  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.2 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0436  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.11 
 
 		 403 aa  61.6  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0887055  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.21 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1825  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36 
 
 		 451 aa  61.2  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4355  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.97 
 
 		 262 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.76 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4552  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.62 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.14 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.67 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.46 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0756  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.96 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.39 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.81 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  27.01 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.15 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05243  biopolymer transport protein  30.6 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.37 
 
 		 680 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  31.5 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2590  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.27 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000318132 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.05 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.14 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>