More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0966 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0966  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
206 aa  409  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271628  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.22 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
208 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.18 
 
 
200 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.17 
 
 
253 aa  101  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.83 
 
 
202 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.03 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.21 
 
 
220 aa  97.4  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  32.21 
 
 
220 aa  97.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.83 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.65 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  31.28 
 
 
211 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  31.28 
 
 
211 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.18 
 
 
207 aa  94  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.66 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.34 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.15 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.68 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  30.69 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  32.16 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  33.02 
 
 
234 aa  88.6  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.55 
 
 
204 aa  88.2  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.84 
 
 
206 aa  88.2  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.35 
 
 
478 aa  87.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.14 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.68 
 
 
212 aa  85.1  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.84 
 
 
209 aa  85.5  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.65 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.43 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.43 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  32.16 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.7 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  34.97 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.62 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  32 
 
 
236 aa  82  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.02 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  27.23 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  27.23 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.07 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  29.8 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  29.8 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
480 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  29.95 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  30.15 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.5 
 
 
238 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.05 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.11 
 
 
232 aa  79  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0585  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.85 
 
 
263 aa  79  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127539  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  30.48 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34 
 
 
231 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.5 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.86 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  30.96 
 
 
275 aa  77  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.63 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  29.15 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1898  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.76 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000558815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.21 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0792  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.38 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.72 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2678  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.38 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.5 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  30.41 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.29 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  29.69 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  29.69 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  29.69 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.69 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.69 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  29.69 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.27 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  29.69 
 
 
262 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.53 
 
 
339 aa  75.1  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.23 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.29 
 
 
221 aa  74.7  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.57 
 
 
263 aa  74.7  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.426551  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  32.46 
 
 
240 aa  74.7  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  28.29 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  31.22 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.29 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  31.37 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  31.37 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.39 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.81 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  27.18 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.23 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.53 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.86 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.61 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0542744  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.57 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.41 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.07 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.53 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.53 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  29.44 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.98 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>