More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1153 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  100 
 
 		 457 aa  911    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  63.88 
 
 		 455 aa  555  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  64.16 
 
 		 455 aa  527  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  57.88 
 
 		 451 aa  505  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  59.9 
 
 		 453 aa  500  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1518  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.55 
 
 		 451 aa  280  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.298092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.19 
 
 		 451 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0356539  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2651  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.19 
 
 		 451 aa  276  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12619  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2477  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.32 
 
 		 451 aa  273  6e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.373641  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1641  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.27 
 
 		 451 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0893157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3755  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.24 
 
 		 449 aa  270  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1626  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.27 
 
 		 451 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.171295  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1825  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.22 
 
 		 451 aa  270  5e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.27 
 
 		 451 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0125203  decreased coverage  0.0000000188451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1663  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.04 
 
 		 451 aa  269  8e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204687  normal  0.14505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2463  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.19 
 
 		 451 aa  263  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080951  hitchhiker  0.00000350745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.32 
 
 		 451 aa  263  6e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00501831  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2625  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.77 
 
 		 451 aa  262  8e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00264646  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2533  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.41 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0106655  unclonable  0.0000291193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2625  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.96 
 
 		 451 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000348965  hitchhiker  0.00000191471 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2424  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.93 
 
 		 450 aa  258  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00633842  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.34 
 
 		 478 aa  258  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1255  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.99 
 
 		 451 aa  257  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  unclonable  0.0000153929 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03434  putative Tol protein  35.91 
 
 		 454 aa  257  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2989  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.82 
 
 		 450 aa  257  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.347147  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.1 
 
 		 449 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  35.98 
 
 		 453 aa  242  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.24 
 
 		 453 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.36 
 
 		 469 aa  236  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297335  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0869  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.27 
 
 		 462 aa  233  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.89 
 
 		 457 aa  232  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02813  TonB system biopolymer transport component  40.12 
 
 		 343 aa  223  6e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000924577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0353  TonB system biopolymer transport component  31.49 
 
 		 460 aa  216  7e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.899068  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.99 
 
 		 469 aa  200  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0436  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.13 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0887055  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  30.29 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.98 
 
 		 480 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.08 
 
 		 576 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  31.17 
 
 		 470 aa  119  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.29 
 
 		 469 aa  113  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  26.93 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.06 
 
 		 488 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2815  biopolymer transport proteins-like  35.48 
 
 		 464 aa  96.7  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00525326  hitchhiker  0.00000294383 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2154  biopolymer transport protein (ExbB)-like  48.28 
 
 		 208 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.18 
 
 		 253 aa  89.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.54 
 
 		 218 aa  87.8  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38 
 
 		 214 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.81 
 
 		 206 aa  85.5  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34.54 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.9 
 
 		 210 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.81 
 
 		 206 aa  85.5  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.04 
 
 		 206 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.49 
 
 		 243 aa  82.4  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.4 
 
 		 209 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1152  TonB system transport protein ExbB2  45.05 
 
 		 180 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0349  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.09 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.931428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  39.84 
 
 		 201 aa  79.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000846  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  34.13 
 
 		 184 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  38.28 
 
 		 211 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  38.28 
 
 		 211 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1737  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.05 
 
 		 201 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.36 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  46.24 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.23 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.92 
 
 		 324 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06758  hypothetical protein  48.72 
 
 		 184 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  33.73 
 
 		 220 aa  76.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.33 
 
 		 238 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0782  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.48 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.94 
 
 		 240 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0903  TonB system transport protein ExbB3  47.37 
 
 		 177 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0113  TonB system transport protein ExbB2  40.52 
 
 		 169 aa  74.3  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  44.44 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0608  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.95 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00236146  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.28 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.64 
 
 		 208 aa  72.8  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2393  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.1 
 
 		 197 aa  72.4  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2130  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.47 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0769434  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0437  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.27 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383605  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  36.72 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  36.72 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2957  biopolymer transport proteins-like  33 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34.06 
 
 		 204 aa  69.7  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.72 
 
 		 243 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  35.94 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.23 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1826  TonB system transport protein ExbB2  41.67 
 
 		 160 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.61 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.58 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  39.36 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00635  biopolymer transport protein  40.22 
 
 		 175 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.82 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  43.82 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001858  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  40.22 
 
 		 175 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.79 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  42.86 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  36 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.86 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  44.87 
 
 		 220 aa  67  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>