More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06758 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06758  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000846  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  90.76 
 
 
184 aa  348  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0113  TonB system transport protein ExbB2  72.56 
 
 
169 aa  243  9e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0903  TonB system transport protein ExbB3  69.82 
 
 
177 aa  229  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1152  TonB system transport protein ExbB2  68.82 
 
 
180 aa  218  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02812  TonB system biopolymer transport component  55.94 
 
 
174 aa  185  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00324688  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2716  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.43 
 
 
175 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00531183  decreased coverage  0.0000000102251 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.43 
 
 
175 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399285  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1642  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.43 
 
 
175 aa  175  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188502  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2988  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.27 
 
 
174 aa  174  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.649663  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1664  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.8 
 
 
175 aa  174  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0648284  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1573  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.8 
 
 
174 aa  174  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119512  hitchhiker  0.00360168 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2462  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.8 
 
 
175 aa  174  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.055341  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2624  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.8 
 
 
175 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00200443  hitchhiker  0.00000116003 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1519  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.8 
 
 
175 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2532  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.8 
 
 
175 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0137546  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3077  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.53 
 
 
175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00037771  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2650  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.16 
 
 
174 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.026005  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2624  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.8 
 
 
175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000822503  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2476  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.53 
 
 
175 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.428605  hitchhiker  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1826  TonB system transport protein ExbB2  58.33 
 
 
160 aa  171  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1256  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.16 
 
 
175 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.80948  hitchhiker  0.000146738 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3754  biopolymer transport exbB protein  50 
 
 
174 aa  169  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2423  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.9 
 
 
175 aa  168  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00161058  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3974  biopolymer transport exbB protein  48.1 
 
 
175 aa  161  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001858  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  42.94 
 
 
175 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 
173 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.641565  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00635  biopolymer transport protein  42.94 
 
 
175 aa  147  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0870  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.12 
 
 
178 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0608  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.57 
 
 
174 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00236146  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0354  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  40.36 
 
 
175 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0226486  normal  0.429001 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03433  TonB system biopolymer transport component  48.82 
 
 
132 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3870  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.12 
 
 
182 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2651  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.25 
 
 
451 aa  87  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12619  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.13 
 
 
469 aa  85.5  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297335  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03434  putative Tol protein  32.76 
 
 
454 aa  83.6  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1617  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.96 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.223503  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.38 
 
 
451 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0356539  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1255  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  58.9 
 
 
451 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  unclonable  0.0000153929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1518  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.77 
 
 
451 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.298092  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2625  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.34 
 
 
451 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000348965  hitchhiker  0.00000191471 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  50.63 
 
 
453 aa  79.3  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  32.4 
 
 
455 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2463  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.34 
 
 
451 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080951  hitchhiker  0.00000350745 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2533  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.34 
 
 
451 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0106655  unclonable  0.0000291193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1641  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.34 
 
 
451 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0893157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1663  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.34 
 
 
451 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204687  normal  0.14505 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2477  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.34 
 
 
451 aa  79  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.373641  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.34 
 
 
451 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0125203  decreased coverage  0.0000000188451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1626  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.34 
 
 
451 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.171295  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.7 
 
 
457 aa  78.6  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.93 
 
 
451 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00501831  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2424  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.93 
 
 
450 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00633842  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2625  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.52 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00264646  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.31 
 
 
455 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  50 
 
 
451 aa  76.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  48.72 
 
 
457 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.76 
 
 
469 aa  75.9  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1825  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  53.42 
 
 
451 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  46.74 
 
 
470 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2154  biopolymer transport protein (ExbB)-like  27.03 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0436  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.72 
 
 
403 aa  72.4  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0887055  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.92 
 
 
253 aa  72  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.11 
 
 
480 aa  71.6  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0437  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.08 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383605  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  29.63 
 
 
465 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1737  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.36 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3523  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
172 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.43 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3755  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.06 
 
 
449 aa  69.3  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.98 
 
 
478 aa  68.6  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.38 
 
 
453 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  41.38 
 
 
453 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0353  TonB system biopolymer transport component  31.01 
 
 
460 aa  67.8  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.899068  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.19 
 
 
576 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  29.21 
 
 
474 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.32 
 
 
449 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.21 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.393099  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  36.36 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  36.36 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0869  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.78 
 
 
462 aa  65.1  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.86 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.42 
 
 
218 aa  63.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.25 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.63 
 
 
214 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.33 
 
 
206 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.64 
 
 
209 aa  63.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.24 
 
 
241 aa  63.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.98 
 
 
246 aa  62.8  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.97 
 
 
469 aa  62.4  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.9 
 
 
488 aa  61.6  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.08 
 
 
199 aa  61.2  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2815  biopolymer transport proteins-like  35.29 
 
 
464 aa  60.8  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00525326  hitchhiker  0.00000294383 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  34 
 
 
201 aa  59.3  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.41 
 
 
221 aa  58.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  38.64 
 
 
229 aa  58.2  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.2 
 
 
238 aa  57.8  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0782  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.26 
 
 
270 aa  57  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.54 
 
 
243 aa  57.4  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>