More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000847 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  100 
 
 
455 aa  912    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  88.57 
 
 
455 aa  822    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  65.8 
 
 
457 aa  538  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  63.96 
 
 
453 aa  533  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  63.06 
 
 
451 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.9 
 
 
453 aa  290  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  39.06 
 
 
453 aa  282  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1518  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.51 
 
 
451 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.298092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.61 
 
 
451 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0356539  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2651  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.6 
 
 
451 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12619  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03434  putative Tol protein  38.39 
 
 
454 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.19 
 
 
478 aa  270  5e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2477  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.07 
 
 
451 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.373641  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.42 
 
 
449 aa  262  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1641  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.91 
 
 
451 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0893157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1626  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.91 
 
 
451 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.171295  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1663  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.69 
 
 
451 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204687  normal  0.14505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2463  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.61 
 
 
451 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080951  hitchhiker  0.00000350745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2625  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.61 
 
 
451 aa  256  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000348965  hitchhiker  0.00000191471 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.47 
 
 
451 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0125203  decreased coverage  0.0000000188451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.74 
 
 
469 aa  256  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297335  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2533  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.39 
 
 
451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0106655  unclonable  0.0000291193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.21 
 
 
451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00501831  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.14 
 
 
457 aa  254  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2424  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.85 
 
 
450 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00633842  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2625  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.08 
 
 
451 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00264646  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1255  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.83 
 
 
451 aa  249  7e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  unclonable  0.0000153929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1825  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.7 
 
 
451 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0869  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.29 
 
 
462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3755  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34 
 
 
449 aa  243  7e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2989  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.98 
 
 
450 aa  230  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.347147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.63 
 
 
469 aa  216  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02813  TonB system biopolymer transport component  38.86 
 
 
343 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000924577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0353  TonB system biopolymer transport component  32.24 
 
 
460 aa  203  6e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.899068  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0436  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.83 
 
 
403 aa  192  9e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0887055  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.42 
 
 
576 aa  156  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  29.84 
 
 
474 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  34.78 
 
 
470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  30.64 
 
 
465 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.43 
 
 
480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.4 
 
 
488 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.75 
 
 
469 aa  107  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2815  biopolymer transport proteins-like  31.66 
 
 
464 aa  106  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00525326  hitchhiker  0.00000294383 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.38 
 
 
241 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2154  biopolymer transport protein (ExbB)-like  33 
 
 
208 aa  94  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.04 
 
 
253 aa  90.5  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.4 
 
 
218 aa  87  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.69 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.7 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.85 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.27 
 
 
238 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.61 
 
 
206 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.61 
 
 
206 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.52 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000846  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  33.52 
 
 
184 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.35 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  37.5 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0349  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.19 
 
 
226 aa  79.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.931428  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06758  hypothetical protein  34.08 
 
 
184 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1152  TonB system transport protein ExbB2  46.51 
 
 
180 aa  79  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0113  TonB system transport protein ExbB2  41.07 
 
 
169 aa  78.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0903  TonB system transport protein ExbB3  41.84 
 
 
177 aa  77.4  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1737  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.7 
 
 
201 aa  77  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.94 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  41.74 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  35.04 
 
 
211 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  35.04 
 
 
211 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0608  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.89 
 
 
174 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00236146  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0782  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.48 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.94 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.04 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.16 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2130  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.22 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0769434  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  36.5 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.14 
 
 
324 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00635  biopolymer transport protein  41.57 
 
 
175 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  38.38 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.98 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.82 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0437  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.71 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383605  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  31.28 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.33 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2957  biopolymer transport proteins-like  30.61 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001858  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  42.05 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.66 
 
 
201 aa  69.7  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  35 
 
 
234 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.4 
 
 
202 aa  68.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.58 
 
 
230 aa  68.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728472  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.11 
 
 
236 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.84 
 
 
243 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.1 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
238 aa  68.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  34.81 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.22 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.393099  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2155  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.64 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.41 
 
 
671 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.84 
 
 
173 aa  67.8  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.641565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>