More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1655 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
218 aa  436  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.393099  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2154  biopolymer transport protein (ExbB)-like  28.78 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1737  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.38 
 
 
201 aa  105  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.46 
 
 
208 aa  95.1  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3974  biopolymer transport exbB protein  34.09 
 
 
175 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  34.22 
 
 
474 aa  85.5  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.33 
 
 
214 aa  85.1  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0847  biopolymer transport protein  37.91 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.63454  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.86 
 
 
488 aa  82  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2815  biopolymer transport proteins-like  37.29 
 
 
464 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00525326  hitchhiker  0.00000294383 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.3 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.16 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0608  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.65 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00236146  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.18 
 
 
253 aa  79  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
576 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0870  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.95 
 
 
178 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  42.02 
 
 
470 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.04 
 
 
480 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.53 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.34 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.66 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.25 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  51.39 
 
 
465 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.05 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.98 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.02 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.24 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.61 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  41.94 
 
 
451 aa  68.6  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0869  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42 
 
 
462 aa  68.2  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.22 
 
 
455 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2624  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.27 
 
 
175 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000822503  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.84 
 
 
173 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.641565  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3523  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.72 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.5 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  29.1 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.5 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.97 
 
 
469 aa  67  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297335  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  40.86 
 
 
455 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.78 
 
 
457 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0517  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.77 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  26.61 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  26.61 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.53 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06758  hypothetical protein  31.21 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.82 
 
 
478 aa  65.1  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03434  putative Tol protein  41.05 
 
 
454 aa  65.5  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.14 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399285  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2716  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.14 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00531183  decreased coverage  0.0000000102251 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1519  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.14 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.12 
 
 
469 aa  65.1  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.28 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0454  biopolymer transport proteins-like  42.86 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0552876  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.57 
 
 
449 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40 
 
 
453 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0436  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.77 
 
 
403 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0887055  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.07 
 
 
457 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.11 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2476  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.58 
 
 
175 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.428605  hitchhiker  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.11 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1642  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.57 
 
 
175 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188502  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1256  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.7 
 
 
175 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.80948  hitchhiker  0.000146738 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  43.59 
 
 
453 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03433  TonB system biopolymer transport component  37.36 
 
 
132 aa  63.2  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.79 
 
 
218 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000846  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  31.36 
 
 
184 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2423  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25 
 
 
175 aa  63.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00161058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1664  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.57 
 
 
175 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0648284  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0113  TonB system transport protein ExbB2  29.95 
 
 
169 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2532  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.71 
 
 
175 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0137546  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2624  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.71 
 
 
175 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00200443  hitchhiker  0.00000116003 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35 
 
 
252 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2462  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.57 
 
 
175 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.055341  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  25.71 
 
 
235 aa  62.4  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.13 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35 
 
 
255 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4211  TonB-system energizer ExbB type-1  25.52 
 
 
323 aa  61.6  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0591  tonB-system energizer ExbB  25.87 
 
 
237 aa  61.6  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0437  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.55 
 
 
165 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383605  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08070  ExbB proton channel  26.27 
 
 
236 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  28.5 
 
 
206 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  26.27 
 
 
236 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2650  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.14 
 
 
174 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.026005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21700  ExbB proton channel  26.27 
 
 
236 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.798679  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1740  transcription elongation factor GreA  34.09 
 
 
135 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.97626  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.09 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001858  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  38.2 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.57 
 
 
218 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  27.32 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1573  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.14 
 
 
174 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119512  hitchhiker  0.00360168 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3131  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.98 
 
 
274 aa  60.1  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.11 
 
 
339 aa  60.1  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  26.67 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  26.67 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.74 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00635  biopolymer transport protein  38.55 
 
 
175 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>