More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0847 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0847  biopolymer transport protein  100 
 
 
211 aa  427  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.63454  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2154  biopolymer transport protein (ExbB)-like  38.46 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1737  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.64 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.91 
 
 
218 aa  104  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.393099  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  50.53 
 
 
474 aa  95.5  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  48.6 
 
 
465 aa  94  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2815  biopolymer transport proteins-like  50.57 
 
 
464 aa  90.1  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00525326  hitchhiker  0.00000294383 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.56 
 
 
488 aa  88.2  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.22 
 
 
480 aa  87.8  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  40.87 
 
 
470 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.28 
 
 
478 aa  86.7  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.46 
 
 
576 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  51.69 
 
 
453 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  51.69 
 
 
453 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.33 
 
 
218 aa  79  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.41 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34.68 
 
 
457 aa  75.5  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0353  TonB system biopolymer transport component  42.71 
 
 
460 aa  75.5  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.899068  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.24 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.51 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.87 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  32.82 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.75 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  32.82 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.75 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.89 
 
 
457 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.24 
 
 
469 aa  72.8  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297335  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.66 
 
 
455 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  35.07 
 
 
455 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.4 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.99 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.74 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  37.6 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  34.03 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.85 
 
 
199 aa  71.2  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.67 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.5 
 
 
469 aa  70.9  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.51 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1825  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34.71 
 
 
451 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3523  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.95 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  42.39 
 
 
451 aa  70.5  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0608  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.94 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00236146  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.86 
 
 
451 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00501831  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0869  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.42 
 
 
462 aa  70.1  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2651  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.88 
 
 
451 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12619  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2477  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.71 
 
 
451 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.373641  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.17 
 
 
451 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0356539  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.67 
 
 
449 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2424  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.71 
 
 
450 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00633842  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1255  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.38 
 
 
451 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  unclonable  0.0000153929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1518  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.61 
 
 
451 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.298092  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0870  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.14 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03434  putative Tol protein  45.24 
 
 
454 aa  69.3  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2625  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.61 
 
 
451 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000348965  hitchhiker  0.00000191471 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2463  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.61 
 
 
451 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080951  hitchhiker  0.00000350745 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2533  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.61 
 
 
451 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0106655  unclonable  0.0000291193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1626  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.61 
 
 
451 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.171295  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.61 
 
 
451 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0125203  decreased coverage  0.0000000188451 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0436  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  46.25 
 
 
403 aa  68.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0887055  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3755  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.38 
 
 
449 aa  68.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2625  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.61 
 
 
451 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00264646  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1641  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.61 
 
 
451 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0893157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3974  biopolymer transport exbB protein  28.11 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.66 
 
 
247 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1663  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.61 
 
 
451 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204687  normal  0.14505 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.6 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.87 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03433  TonB system biopolymer transport component  43.18 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  30.66 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  30.66 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  41.18 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.18 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.14 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.75 
 
 
173 aa  67  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.641565  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.49 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.14 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.65 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.98 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.89 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.98 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.98 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.27 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  30.39 
 
 
232 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.35 
 
 
469 aa  64.3  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.13 
 
 
680 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.27 
 
 
206 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.37 
 
 
235 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  41.9 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0454  biopolymer transport proteins-like  33.84 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0552876  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00635  biopolymer transport protein  28.65 
 
 
175 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0354  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.84 
 
 
175 aa  63.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0226486  normal  0.429001 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001858  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  28.49 
 
 
175 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  27.18 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  35.29 
 
 
220 aa  62.8  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  41.35 
 
 
213 aa  62.8  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.43 
 
 
235 aa  62.4  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.26 
 
 
232 aa  62.4  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3077  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.36 
 
 
175 aa  62  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00037771  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>