More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3906 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3906  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
196 aa  390  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.286845  normal  0.293846 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  35.15 
 
 
213 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.16 
 
 
210 aa  97.8  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.61 
 
 
206 aa  91.7  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.11 
 
 
204 aa  90.5  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.16 
 
 
221 aa  90.1  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.11 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.43 
 
 
192 aa  87.8  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.11 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.16 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.76 
 
 
216 aa  86.3  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.26 
 
 
203 aa  85.5  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  28.65 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  32.12 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1865  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.41 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.646793 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.17 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.86 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.08 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.53 
 
 
204 aa  82  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.43 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.7 
 
 
210 aa  82  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.43 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.14 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.52 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.12 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.04 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.93 
 
 
231 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2947  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.39 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.9 
 
 
324 aa  77.8  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05243  biopolymer transport protein  30.59 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.37 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.49 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  31.22 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.84 
 
 
576 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  32.28 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  29.44 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  29.44 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001354  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  30.95 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024242  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.49 
 
 
208 aa  72  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
209 aa  72  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.74 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  30.65 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.15 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.65 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.55 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.68 
 
 
480 aa  69.7  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.79 
 
 
238 aa  68.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.87 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708114  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1318  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.55 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.42 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.69 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4594  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.96 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1060  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.55 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.962837 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.69 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.11 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  30.77 
 
 
465 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0857  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.18 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.15 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  24.58 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2300  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.23 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  37.76 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  33.33 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  37.76 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.15 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.78 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1395  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33 
 
 
228 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.57 
 
 
220 aa  64.7  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.67 
 
 
210 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  25.12 
 
 
229 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  38.78 
 
 
225 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.12 
 
 
237 aa  63.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  27 
 
 
474 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3967  tonB-system energizer ExbB  36.15 
 
 
303 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.06 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  39.29 
 
 
455 aa  62.8  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.29 
 
 
455 aa  62.8  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1737  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.23 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2815  biopolymer transport proteins-like  27.72 
 
 
464 aa  62  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00525326  hitchhiker  0.00000294383 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  31.34 
 
 
227 aa  62  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.38 
 
 
469 aa  62  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.21 
 
 
478 aa  60.5  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.37 
 
 
263 aa  61.2  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.426551  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4004  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.51 
 
 
267 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.894756  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0349  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.67 
 
 
226 aa  60.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.931428  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.82 
 
 
555 aa  59.7  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.29 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.53 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  39.29 
 
 
453 aa  60.1  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.89 
 
 
224 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2155  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.02 
 
 
296 aa  59.7  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
257 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1240  TonB-system energizer ExbB  34.62 
 
 
142 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0869  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.88 
 
 
462 aa  59.7  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  32.74 
 
 
223 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1241  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.12 
 
 
266 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175098  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.76 
 
 
457 aa  59.3  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.02 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  38.75 
 
 
451 aa  58.9  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.63 
 
 
488 aa  58.9  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>