156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0314 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
171 aa  340  5.999999999999999e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  75.31 
 
 
212 aa  245  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.73 
 
 
206 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  45.12 
 
 
206 aa  134  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.12 
 
 
206 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.46 
 
 
206 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.9 
 
 
210 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  40.85 
 
 
213 aa  121  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.68 
 
 
231 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.61 
 
 
221 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.11 
 
 
208 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.51 
 
 
201 aa  114  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  40.12 
 
 
201 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.27 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.35 
 
 
212 aa  104  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.35 
 
 
212 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.21 
 
 
210 aa  104  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.14 
 
 
202 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.72 
 
 
216 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.27 
 
 
204 aa  101  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.59 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.09 
 
 
214 aa  92  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.29 
 
 
207 aa  88.6  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.55 
 
 
210 aa  88.2  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2947  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.36 
 
 
212 aa  87.8  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.73 
 
 
253 aa  86.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.22 
 
 
209 aa  87  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  37.95 
 
 
211 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  37.95 
 
 
211 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.14 
 
 
206 aa  85.1  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34.32 
 
 
204 aa  84  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.33 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  33.95 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.95 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.5 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.73 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.54 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  32.53 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.14 
 
 
210 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.9 
 
 
216 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.43 
 
 
206 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.43 
 
 
206 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.47 
 
 
211 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.91 
 
 
200 aa  61.6  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0542744  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.29 
 
 
224 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1898  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.29 
 
 
224 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000558815 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.94 
 
 
238 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0966  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.08 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271628  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.29 
 
 
224 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.13 
 
 
211 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.37 
 
 
218 aa  58.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.08 
 
 
218 aa  57.8  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  26.4 
 
 
474 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.79 
 
 
233 aa  57.4  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.25 
 
 
214 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.45 
 
 
209 aa  55.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.29 
 
 
217 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3579  biopolymer transport protein  31.21 
 
 
234 aa  53.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.159406  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  29.71 
 
 
229 aa  53.9  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.11 
 
 
238 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  29.49 
 
 
214 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.45 
 
 
247 aa  52  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.82 
 
 
218 aa  52  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.45 
 
 
221 aa  51.2  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2815  biopolymer transport proteins-like  30 
 
 
464 aa  50.8  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00525326  hitchhiker  0.00000294383 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.32 
 
 
339 aa  50.8  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.38 
 
 
480 aa  50.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1917  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.45 
 
 
227 aa  50.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2270  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.45 
 
 
227 aa  50.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.39 
 
 
232 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.57 
 
 
576 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2273  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.26 
 
 
230 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1848  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.41 
 
 
239 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.775268  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.88 
 
 
257 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.26 
 
 
230 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.61 
 
 
206 aa  48.5  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4034  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.62 
 
 
233 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.133642  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32 
 
 
222 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.63 
 
 
251 aa  48.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.62 
 
 
233 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.62 
 
 
233 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143236  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3610  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.45 
 
 
221 aa  47.8  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302219  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.45 
 
 
223 aa  47.8  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5123  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.11 
 
 
234 aa  47.8  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  28.15 
 
 
220 aa  47.4  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0349  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.59 
 
 
226 aa  47.4  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.931428  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.32 
 
 
235 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.6 
 
 
234 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  21.68 
 
 
236 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0768  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.6 
 
 
234 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.23 
 
 
469 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001354  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  30.32 
 
 
232 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024242  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05243  biopolymer transport protein  29.49 
 
 
232 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.29 
 
 
478 aa  45.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.08 
 
 
313 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2957  biopolymer transport proteins-like  25.58 
 
 
242 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0436  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.33 
 
 
403 aa  45.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0887055  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.59 
 
 
225 aa  45.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.88 
 
 
200 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.82 
 
 
199 aa  45.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>