More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1485 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  100 
 
 
217 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1200  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
217 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138334 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.79 
 
 
225 aa  168  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2299  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  51.79 
 
 
225 aa  168  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2613  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.78 
 
 
215 aa  158  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3003  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.78 
 
 
215 aa  158  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1917  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.1 
 
 
227 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2270  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.1 
 
 
227 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2273  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.78 
 
 
230 aa  149  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.78 
 
 
230 aa  149  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.95 
 
 
234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0768  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.95 
 
 
234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.85 
 
 
223 aa  142  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314635  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3610  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.18 
 
 
221 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302219  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1189  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.38 
 
 
223 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.46 
 
 
227 aa  89  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2300  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.17 
 
 
215 aa  88.6  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  31.9 
 
 
214 aa  88.2  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.76 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4594  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.31 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.89 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708114  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.78 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  31.58 
 
 
474 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3344  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.27 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.16 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.77 
 
 
218 aa  68.2  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.53 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.26 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.62 
 
 
246 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.24 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.14 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  39.39 
 
 
470 aa  65.1  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.25 
 
 
480 aa  65.1  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  29.07 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  33.33 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.23 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.25 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.29 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0873  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
240 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362466  normal  0.116747 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.28 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  33.02 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.23 
 
 
146 aa  63.9  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  33.02 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.31 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.14 
 
 
576 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.12 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.61 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.61 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2098  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.28 
 
 
245 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211471  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.47 
 
 
478 aa  62.4  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.37 
 
 
277 aa  62.4  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0347861  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0735  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.36 
 
 
145 aa  62.4  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.02 
 
 
230 aa  62  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0443122 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  26.5 
 
 
246 aa  62  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.81 
 
 
230 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.24 
 
 
206 aa  61.6  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0585  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37 
 
 
263 aa  61.6  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127539  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.24 
 
 
206 aa  61.6  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  27.95 
 
 
231 aa  61.6  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  30.81 
 
 
465 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4034  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.09 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.133642  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  28.57 
 
 
453 aa  60.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.42 
 
 
241 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.51 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  29.57 
 
 
455 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.65 
 
 
457 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  31.58 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.84 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  30.65 
 
 
234 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.11 
 
 
229 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265292  hitchhiker  0.00010169 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  32.65 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.43 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.07 
 
 
243 aa  59.7  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0782  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.67 
 
 
270 aa  59.7  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.63 
 
 
224 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.95 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.21 
 
 
238 aa  59.3  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.63 
 
 
224 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.95 
 
 
230 aa  59.3  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.23 
 
 
209 aa  59.3  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.63 
 
 
224 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0877  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.82 
 
 
249 aa  59.3  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0394331  normal  0.0815705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1021  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.82 
 
 
249 aa  59.3  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00477503  normal  0.0346927 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.46 
 
 
213 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.371589 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  30.72 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.84 
 
 
469 aa  59.3  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.65 
 
 
227 aa  58.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.57 
 
 
251 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  31.03 
 
 
232 aa  58.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.48 
 
 
224 aa  58.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1426  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.91 
 
 
286 aa  58.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3906  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.03 
 
 
196 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.286845  normal  0.293846 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  31.82 
 
 
257 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  25.85 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.73 
 
 
247 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.51 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.03 
 
 
244 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  31.82 
 
 
257 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>