More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0516 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0516  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1079 aa  2227    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0237  DNA polymerase III, alpha subunit  41.4 
 
 		 1003 aa  766    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1741  DNA polymerase III, alpha subunit  61.18 
 
 		 1047 aa  1053    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0499  DNA polymerase III, alpha subunit  91.29 
 
 		 1029 aa  2003    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0929  DNA polymerase III, alpha subunit  48.18 
 
 		 1003 aa  775    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3569  DNA polymerase III, alpha subunit  32.89 
 
 		 1017 aa  446  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3769  DNA polymerase III, alpha subunit  33.73 
 
 		 1018 aa  445  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  31.72 
 
 		 1139 aa  441  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6872  DNA polymerase III, alpha subunit  31.96 
 
 		 982 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  32.72 
 
 		 1145 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  32.72 
 
 		 1075 aa  422  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  31.74 
 
 		 1127 aa  418  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1009  DNA polymerase III, alpha subunit  33.46 
 
 		 1039 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0533804  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3236  DNA polymerase III, alpha subunit  32.1 
 
 		 980 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  32.09 
 
 		 1130 aa  409  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4916  DNA polymerase III, alpha subunit  32.47 
 
 		 989 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188475  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  32.47 
 
 		 1156 aa  403  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  31.73 
 
 		 1134 aa  405  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  29.5 
 
 		 1155 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  30.37 
 
 		 1139 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  29.12 
 
 		 1156 aa  399  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1371  DNA polymerase III, alpha subunit  31.82 
 
 		 979 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.940819 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  30.76 
 
 		 1225 aa  396  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0750  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  27.67 
 
 		 1115 aa  394  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  30.75 
 
 		 1159 aa  395  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  32.76 
 
 		 1092 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  28.29 
 
 		 1173 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  31.36 
 
 		 1108 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  28.7 
 
 		 1181 aa  388  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  30.98 
 
 		 1109 aa  388  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4714  DNA polymerase III DnaE  31.6 
 
 		 1108 aa  388  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4434  DNA polymerase III DnaE  28.7 
 
 		 1110 aa  388  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  30.81 
 
 		 1108 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  31.24 
 
 		 1108 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  30.58 
 
 		 1108 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  29.45 
 
 		 1122 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  32.86 
 
 		 1132 aa  386  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  30.93 
 
 		 1108 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  30.36 
 
 		 1157 aa  386  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  30.81 
 
 		 1108 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  31.24 
 
 		 1108 aa  383  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1148 aa  383  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  30.81 
 
 		 1108 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  27.01 
 
 		 1186 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0973  DNA polymerase III, alpha subunit  29.66 
 
 		 1039 aa  382  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.309607  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3552  DNA polymerase III, alpha subunit  28.31 
 
 		 1217 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.658792  hitchhiker  0.00874617 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0880  DNA polymerase III, alpha subunit  29.68 
 
 		 1038 aa  379  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191787  hitchhiker  0.00000000000153929 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  28.75 
 
 		 1184 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  30.79 
 
 		 1151 aa  375  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4047  DNA polymerase III, alpha subunit  31.39 
 
 		 1070 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  29.06 
 
 		 1179 aa  376  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  30.85 
 
 		 1165 aa  370  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  30.71 
 
 		 1155 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  28.79 
 
 		 1159 aa  370  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  32.45 
 
 		 1454 aa  369  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1095  DNA polymerase III, alpha subunit  29.59 
 
 		 1044 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  28.57 
 
 		 1145 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  30.55 
 
 		 1143 aa  368  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  30.55 
 
 		 1143 aa  369  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1747  DNA polymerase III, alpha subunit  27.3 
 
 		 1122 aa  369  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  31.09 
 
 		 1164 aa  370  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  28.02 
 
 		 1170 aa  369  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  28.47 
 
 		 1148 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  32.01 
 
 		 1182 aa  365  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  29.68 
 
 		 1168 aa  364  4e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  30.54 
 
 		 1155 aa  362  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  30.21 
 
 		 1158 aa  362  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3197  DNA polymerase III, alpha subunit  31.85 
 
 		 1139 aa  362  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  30.47 
 
 		 1182 aa  361  3e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1266  DNA polymerase III, alpha subunit  29.79 
 
 		 1065 aa  361  5e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.502736  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  29.18 
 
 		 1149 aa  360  6e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  28.87 
 
 		 1167 aa  360  6e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  27.74 
 
 		 1165 aa  360  7e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  30.5 
 
 		 1168 aa  359  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3593  DNA polymerase III, alpha subunit  28.68 
 
 		 1210 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  31.89 
 
 		 1104 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1285  DNA polymerase III subunit alpha  28.13 
 
 		 1158 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.876044  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  27.37 
 
 		 1194 aa  357  5.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2620  DNA polymerase III subunit alpha  28.27 
 
 		 1157 aa  357  8.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0893  DNA polymerase III, alpha subunit  27.35 
 
 		 1189 aa  356  1e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323768  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  30.14 
 
 		 1165 aa  356  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3525  DNA polymerase III, alpha subunit  28.83 
 
 		 1210 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  28.19 
 
 		 1174 aa  354  4e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0898  DNA polymerase III, alpha subunit  29.58 
 
 		 1278 aa  354  4e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.816492  normal  0.53056 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  28.33 
 
 		 1160 aa  354  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3146  DNA polymerase III subunit alpha  27.56 
 
 		 1157 aa  353  8.999999999999999e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156717 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1612  DNA polymerase III, alpha subunit  33.04 
 
 		 1132 aa  352  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.929723  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  29.98 
 
 		 1176 aa  352  2e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  30.16 
 
 		 1190 aa  351  3e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  29.03 
 
 		 1510 aa  351  4e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1296  DNA polymerase III, alpha subunit  30.17 
 
 		 1181 aa  351  5e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  29.65 
 
 		 1156 aa  351  5e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0538  DNA polymerase III, alpha subunit  29 
 
 		 1163 aa  350  7e-95  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  31.18 
 
 		 1167 aa  349  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.906306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1461  DNA polymerase III, alpha subunit  31.18 
 
 		 1166 aa  350  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  28.38 
 
 		 1165 aa  348  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01387  DNA polymerase III subunit alpha  29.61 
 
 		 1154 aa  347  5e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  27.91 
 
 		 1476 aa  347  5e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0371  DNA polymerase III, alpha subunit  29.28 
 
 		 1485 aa  347  5e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12030  DNA-directed DNA polymerase III PolC  28.24 
 
 		 1165 aa  347  8e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>