More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1266 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1266  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1065 aa  2198    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.502736  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  36.45 
 
 		 1145 aa  684    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  41.95 
 
 		 1108 aa  782    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1793  DNA polymerase III, alpha subunit  70.61 
 
 		 1065 aa  1567    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  41.95 
 
 		 1108 aa  791    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  41.85 
 
 		 1108 aa  791    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  41.95 
 
 		 1108 aa  791    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  36.46 
 
 		 1181 aa  660    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  41.56 
 
 		 1108 aa  781    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  41.54 
 
 		 1104 aa  746    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  41.85 
 
 		 1108 aa  788    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  36.05 
 
 		 1155 aa  657    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  41.95 
 
 		 1108 aa  791    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  36.22 
 
 		 1145 aa  647    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  41.75 
 
 		 1109 aa  780    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4434  DNA polymerase III DnaE  42.35 
 
 		 1110 aa  791    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1759  DNA polymerase III, alpha subunit  70.61 
 
 		 1065 aa  1567    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.463991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  35.78 
 
 		 1156 aa  654    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  35.89 
 
 		 1159 aa  639    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  36.47 
 
 		 1139 aa  657    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4714  DNA polymerase III DnaE  41.56 
 
 		 1108 aa  780    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  41.95 
 
 		 1108 aa  791    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  37.01 
 
 		 1134 aa  666    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  36.1 
 
 		 1225 aa  660    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  36.16 
 
 		 1148 aa  644    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  37.65 
 
 		 1127 aa  662    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  35.77 
 
 		 1139 aa  652    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0750  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  36.19 
 
 		 1115 aa  650    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  35.09 
 
 		 1157 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0880  DNA polymerase III, alpha subunit  38.98 
 
 		 1038 aa  642    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191787  hitchhiker  0.00000000000153929 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  37.99 
 
 		 1092 aa  684    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  37.44 
 
 		 1190 aa  633  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  35.82 
 
 		 1164 aa  635  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  35.4 
 
 		 1184 aa  632  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  36.05 
 
 		 1155 aa  625  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  35.08 
 
 		 1159 aa  625  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  35.56 
 
 		 1159 aa  623  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0774  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  35.98 
 
 		 1112 aa  624  1e-177  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  35 
 
 		 1075 aa  623  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  35.57 
 
 		 1148 aa  618  1e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  35.48 
 
 		 1148 aa  618  1e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  34.43 
 
 		 1132 aa  618  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  35.73 
 
 		 1186 aa  616  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  35.37 
 
 		 1175 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  36.02 
 
 		 1143 aa  613  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  34.21 
 
 		 1156 aa  612  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  34.57 
 
 		 1156 aa  612  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  35.92 
 
 		 1143 aa  612  1e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  34.47 
 
 		 1130 aa  610  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  35.71 
 
 		 1179 aa  612  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  34.35 
 
 		 1155 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  34.54 
 
 		 1151 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  34.98 
 
 		 1182 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  34.57 
 
 		 1173 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  34.48 
 
 		 1165 aa  597  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  33.89 
 
 		 1176 aa  597  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  35.19 
 
 		 1158 aa  595  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  35.51 
 
 		 1158 aa  593  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  35.41 
 
 		 1122 aa  594  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1499  DNA polymerase III subunit alpha  34.73 
 
 		 1185 aa  595  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  34.54 
 
 		 1173 aa  595  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0257  DNA polymerase III subunit alpha  34.33 
 
 		 1160 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.988974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01387  DNA polymerase III subunit alpha  34.06 
 
 		 1154 aa  590  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  35.39 
 
 		 1170 aa  588  1e-166  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  34.13 
 
 		 1160 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.783595 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  32.92 
 
 		 1160 aa  586  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0583  DNA polymerase III, alpha subunit  33.48 
 
 		 1168 aa  587  1e-166  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0272  DNA polymerase III subunit alpha  34.13 
 
 		 1160 aa  589  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218941  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  34.13 
 
 		 1160 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.791308 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1461  DNA polymerase III, alpha subunit  34.33 
 
 		 1166 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0269  DNA polymerase III subunit alpha  34.13 
 
 		 1160 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.814092 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  33.71 
 
 		 1173 aa  586  1e-166  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  32.96 
 
 		 1174 aa  587  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  34.17 
 
 		 1160 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  34.1 
 
 		 1160 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  34.96 
 
 		 1149 aa  583  1.0000000000000001e-165  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  35.2 
 
 		 1170 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  34.1 
 
 		 1160 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0177  DNA polymerase III subunit alpha  33.98 
 
 		 1160 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  37.42 
 
 		 1170 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  34.33 
 
 		 1167 aa  585  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.906306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0195  DNA polymerase III subunit alpha  34.1 
 
 		 1160 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00181  hypothetical protein  34.17 
 
 		 1160 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.466902  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  32.73 
 
 		 1168 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  34.17 
 
 		 1160 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  32.72 
 
 		 1162 aa  580  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1176  DNA polymerase III, alpha subunit  33.51 
 
 		 1162 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0194  DNA polymerase III subunit alpha  34.17 
 
 		 1160 aa  582  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3476  DNA polymerase III subunit alpha  34.07 
 
 		 1160 aa  582  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0843038  normal  0.113533 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  35.18 
 
 		 1149 aa  581  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  33.18 
 
 		 1171 aa  582  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  32.33 
 
 		 1165 aa  582  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4067  DNA polymerase III subunit alpha  32.97 
 
 		 1174 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239215 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  34.2 
 
 		 1180 aa  581  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4522  DNA polymerase III subunit alpha  33.46 
 
 		 1173 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3345  DNA polymerase III subunit alpha  33.98 
 
 		 1160 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1287  DNA polymerase III, alpha subunit  33.81 
 
 		 1158 aa  578  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3420  DNA polymerase III subunit alpha  34.42 
 
 		 1171 aa  578  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1028  DNA polymerase III subunit alpha  34.42 
 
 		 1160 aa  578  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1081  DNA polymerase III subunit alpha  34.48 
 
 		 1171 aa  578  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.990862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>