More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0880 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1266  DNA polymerase III, alpha subunit  38.98 
 
 		 1065 aa  642    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.502736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  39.55 
 
 		 1108 aa  712    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4434  DNA polymerase III DnaE  39.33 
 
 		 1110 aa  704    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  37.48 
 
 		 1134 aa  667    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  39.55 
 
 		 1108 aa  708    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  39.55 
 
 		 1108 aa  707    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  39.55 
 
 		 1108 aa  706    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4714  DNA polymerase III DnaE  39.67 
 
 		 1108 aa  716    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0750  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  44.79 
 
 		 1115 aa  831    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  39.55 
 
 		 1108 aa  708    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  39.57 
 
 		 1108 aa  713    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  39.55 
 
 		 1108 aa  709    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  37.95 
 
 		 1092 aa  649    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  38.1 
 
 		 1127 aa  654    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  40.14 
 
 		 1104 aa  691    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  39.55 
 
 		 1108 aa  708    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0880  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1038 aa  2125    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191787  hitchhiker  0.00000000000153929 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0774  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  41.88 
 
 		 1112 aa  753    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  38.77 
 
 		 1109 aa  706    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  36.48 
 
 		 1132 aa  629  1e-179  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  36.24 
 
 		 1139 aa  629  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  36.7 
 
 		 1156 aa  629  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  36.16 
 
 		 1075 aa  629  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1759  DNA polymerase III, alpha subunit  37.48 
 
 		 1065 aa  623  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.463991  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1793  DNA polymerase III, alpha subunit  37.48 
 
 		 1065 aa  623  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  36.27 
 
 		 1139 aa  622  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  36.28 
 
 		 1130 aa  617  1e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  35.28 
 
 		 1225 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  34.75 
 
 		 1165 aa  612  1e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  35 
 
 		 1165 aa  611  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  35.97 
 
 		 1145 aa  609  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  35.64 
 
 		 1175 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  34.6 
 
 		 1165 aa  605  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  34.92 
 
 		 1165 aa  605  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  36.81 
 
 		 1145 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  34.91 
 
 		 1165 aa  605  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  35.89 
 
 		 1148 aa  602  1e-170  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4334  DNA polymerase III subunit alpha  35.38 
 
 		 1162 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  34.34 
 
 		 1171 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  34.42 
 
 		 1181 aa  588  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  34.82 
 
 		 1160 aa  586  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  35.1 
 
 		 1156 aa  588  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  35.23 
 
 		 1155 aa  586  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  35.11 
 
 		 1173 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  33.64 
 
 		 1172 aa  583  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  33.21 
 
 		 1172 aa  584  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  34.57 
 
 		 1210 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  34.09 
 
 		 1164 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  34.49 
 
 		 1174 aa  580  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  34.68 
 
 		 1159 aa  580  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  35.87 
 
 		 1149 aa  576  1.0000000000000001e-163  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  34.21 
 
 		 1172 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  33.73 
 
 		 1171 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3593  DNA polymerase III, alpha subunit  34.26 
 
 		 1210 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  34.12 
 
 		 1172 aa  575  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  34.12 
 
 		 1155 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1165  DNA polymerase III DnaE  36.01 
 
 		 1036 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3525  DNA polymerase III, alpha subunit  34.17 
 
 		 1210 aa  572  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  35.31 
 
 		 1151 aa  566  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  33.68 
 
 		 1148 aa  566  1e-160  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  35.11 
 
 		 1156 aa  567  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  33.21 
 
 		 1186 aa  568  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  34.35 
 
 		 1165 aa  569  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  34.65 
 
 		 1170 aa  566  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  34.76 
 
 		 1157 aa  567  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  34.95 
 
 		 1184 aa  567  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01387  DNA polymerase III subunit alpha  33.71 
 
 		 1154 aa  565  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3197  DNA polymerase III, alpha subunit  33.9 
 
 		 1139 aa  565  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  34.97 
 
 		 1158 aa  565  1.0000000000000001e-159  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  34.84 
 
 		 1122 aa  565  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  34.37 
 
 		 1170 aa  560  1e-158  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  33.49 
 
 		 1148 aa  562  1e-158  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2412  DNA polymerase III subunit alpha  34.31 
 
 		 1159 aa  561  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  33.62 
 
 		 1155 aa  560  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  34.46 
 
 		 1170 aa  561  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  33.99 
 
 		 1155 aa  556  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2356  DNA polymerase III, alpha subunit  36.69 
 
 		 992 aa  557  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3552  DNA polymerase III, alpha subunit  33.52 
 
 		 1217 aa  558  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.658792  hitchhiker  0.00874617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  34.34 
 
 		 1168 aa  557  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3146  DNA polymerase III subunit alpha  33.83 
 
 		 1157 aa  556  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156717 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  35.15 
 
 		 1190 aa  557  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3270  DNA polymerase III subunit alpha  34.46 
 
 		 1151 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0592  DNA polymerase III subunit alpha  35.96 
 
 		 1161 aa  558  1e-157  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1747  DNA polymerase III, alpha subunit  33.2 
 
 		 1122 aa  557  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2396  DNA polymerase III subunit alpha  34.41 
 
 		 1139 aa  553  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  33.65 
 
 		 1159 aa  555  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2126  DNA polymerase III subunit alpha  33.6 
 
 		 1257 aa  555  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.794686  normal  0.520943 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2870  DNA polymerase III subunit alpha  33.61 
 
 		 1177 aa  553  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.91064  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  31.9 
 
 		 1173 aa  553  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  31.87 
 
 		 1168 aa  555  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  33.12 
 
 		 1182 aa  555  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3420  DNA polymerase III subunit alpha  33.11 
 
 		 1171 aa  553  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  33.46 
 
 		 1167 aa  552  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.906306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1461  DNA polymerase III, alpha subunit  33.46 
 
 		 1166 aa  552  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  34.99 
 
 		 1165 aa  551  1e-155  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1028  DNA polymerase III subunit alpha  33.11 
 
 		 1160 aa  552  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2965  DNA polymerase III subunit alpha  33.4 
 
 		 1160 aa  552  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  34.48 
 
 		 1179 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1538  DNA polymerase III subunit alpha  34.46 
 
 		 1213 aa  552  1e-155  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  33.62 
 
 		 1157 aa  552  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>