More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1747 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  36.18 
 
 		 1160 aa  704    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  36.18 
 
 		 1160 aa  704    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0832  DNA polymerase III subunit alpha  34.79 
 
 		 1237 aa  640    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  39.46 
 
 		 1170 aa  721    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  37.41 
 
 		 1155 aa  749    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  36.24 
 
 		 1174 aa  728    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  38.07 
 
 		 1149 aa  740    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  36 
 
 		 1165 aa  708    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0780  DNA polymerase III, alpha subunit  38.07 
 
 		 1109 aa  700    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.493984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  37.99 
 
 		 1108 aa  691    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1570  DNA polymerase III subunit alpha  35.41 
 
 		 1186 aa  695    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.749203  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0818  DNA polymerase III subunit alpha  37.53 
 
 		 1200 aa  658    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0825  DNA polymerase III subunit alpha  36.32 
 
 		 1163 aa  661    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  34.76 
 
 		 1158 aa  689    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  36.53 
 
 		 1173 aa  727    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  37.56 
 
 		 1108 aa  693    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  37.47 
 
 		 1108 aa  693    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  37.34 
 
 		 1108 aa  692    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  34.47 
 
 		 1171 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  36.55 
 
 		 1148 aa  691    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  36.55 
 
 		 1148 aa  687    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  36.7 
 
 		 1173 aa  731    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1465  DNA polymerase III subunit alpha  35.28 
 
 		 1157 aa  687    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  35.46 
 
 		 1172 aa  654    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  39.23 
 
 		 1170 aa  708    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  35.27 
 
 		 1172 aa  652    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0187  DNA polymerase III alpha subunit  38.19 
 
 		 1123 aa  671    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0858  DNA polymerase III, alpha subunit  35 
 
 		 1141 aa  674    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000342881  normal  0.701952 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  35.25 
 
 		 1168 aa  672    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  36.01 
 
 		 1158 aa  684    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  37.19 
 
 		 1173 aa  724    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2396  DNA polymerase III subunit alpha  35.07 
 
 		 1139 aa  650    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  37.87 
 
 		 1156 aa  759    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  41.98 
 
 		 1225 aa  794    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  35.11 
 
 		 1172 aa  657    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  35.6 
 
 		 1183 aa  674    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  35.39 
 
 		 1172 aa  641    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  37.9 
 
 		 1155 aa  774    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  40 
 
 		 1165 aa  752    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  37.75 
 
 		 1158 aa  703    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  37.56 
 
 		 1108 aa  693    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0819  DNA polymerase III subunit alpha  36.32 
 
 		 1163 aa  659    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  35.18 
 
 		 1165 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  35.86 
 
 		 1174 aa  656    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1582  DNA polymerase III subunit alpha  37.05 
 
 		 1170 aa  652    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  38.1 
 
 		 1156 aa  809    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1363  DNA polymerase III subunit alpha  35.28 
 
 		 1157 aa  700    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  35.4 
 
 		 1210 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2601  DNA polymerase III subunit alpha  36.03 
 
 		 1151 aa  646    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  36.38 
 
 		 1165 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  35.79 
 
 		 1160 aa  699    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0922  DNA polymerase III, alpha subunit  38.37 
 
 		 1120 aa  672    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  36.58 
 
 		 1176 aa  726    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1836  DNA polymerase III subunit alpha  36.18 
 
 		 1164 aa  704    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  36.18 
 
 		 1173 aa  703    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2433  DNA polymerase III subunit alpha  36.95 
 
 		 1185 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.184139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  36.09 
 
 		 1149 aa  657    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3292  DNA polymerase III subunit alpha  36.01 
 
 		 1193 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1569  DNA polymerase III subunit alpha  34.59 
 
 		 1159 aa  665    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.840877  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2858  DNA polymerase III subunit alpha  36.26 
 
 		 1151 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.813555  normal  0.262906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  37.99 
 
 		 1168 aa  714    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  35.65 
 
 		 1168 aa  659    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  35.25 
 
 		 1165 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0538  DNA polymerase III, alpha subunit  36.07 
 
 		 1163 aa  663    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  36.77 
 
 		 1159 aa  716    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0741  DNA polymerase III subunit alpha  37.63 
 
 		 1200 aa  662    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  38.14 
 
 		 1157 aa  773    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2620  DNA polymerase III subunit alpha  35.7 
 
 		 1157 aa  682    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  36.4 
 
 		 1165 aa  686    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  38.94 
 
 		 1155 aa  718    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1255  DNA polymerase III subunit alpha  35.64 
 
 		 1172 aa  664    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  34.17 
 
 		 1194 aa  642    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  34.85 
 
 		 1158 aa  674    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  35.59 
 
 		 1158 aa  692    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  35.7 
 
 		 1158 aa  694    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  35.47 
 
 		 1182 aa  715    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1285  DNA polymerase III subunit alpha  35.39 
 
 		 1158 aa  681    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.876044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  40.21 
 
 		 1130 aa  807    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1378  DNA polymerase III subunit alpha  36.39 
 
 		 1147 aa  637    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.450591  normal  0.182438 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  35.27 
 
 		 1165 aa  669    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  37.29 
 
 		 1173 aa  730    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1499  DNA polymerase III subunit alpha  37.15 
 
 		 1185 aa  731    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1460  DNA polymerase III subunit alpha  35.45 
 
 		 1157 aa  691    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  37.76 
 
 		 1164 aa  742    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  37.91 
 
 		 1195 aa  689    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  35.62 
 
 		 1158 aa  701    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  33.73 
 
 		 1190 aa  664    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1287  DNA polymerase III, alpha subunit  38.79 
 
 		 1158 aa  708    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  36.99 
 
 		 1184 aa  741    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3187  DNA polymerase III subunit alpha  33.11 
 
 		 1180 aa  647    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.527295 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1762  DNA polymerase III subunit alpha  36.63 
 
 		 1156 aa  636    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.402462  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2340  DNA polymerase III, alpha subunit  38.74 
 
 		 1155 aa  640    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  36.11 
 
 		 1157 aa  705    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2961  DNA polymerase III, alpha subunit  35.34 
 
 		 1173 aa  665    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.078928 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  37.93 
 
 		 1181 aa  747    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  36.01 
 
 		 1162 aa  723    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  39.13 
 
 		 1175 aa  719    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4171  DNA polymerase III subunit alpha  36.32 
 
 		 1174 aa  728    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0921  DNA polymerase III subunit alpha  34.76 
 
 		 1165 aa  643    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0872  DNA polymerase III subunit alpha  35.45 
 
 		 1161 aa  637    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.224124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>