More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0774 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  36.6 
 
 		 1104 aa  692    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  34.75 
 
 		 1145 aa  663    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  37.39 
 
 		 1108 aa  731    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  37.21 
 
 		 1108 aa  728    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  32.93 
 
 		 1139 aa  638    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  37.32 
 
 		 1109 aa  741    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  37.48 
 
 		 1108 aa  733    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  37.39 
 
 		 1108 aa  731    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  37.39 
 
 		 1108 aa  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4714  DNA polymerase III DnaE  37.31 
 
 		 1108 aa  723    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  37.48 
 
 		 1108 aa  733    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  37.3 
 
 		 1108 aa  729    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4434  DNA polymerase III DnaE  36.81 
 
 		 1110 aa  712    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  34.5 
 
 		 1145 aa  644    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0750  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  43.93 
 
 		 1115 aa  914    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  37.31 
 
 		 1108 aa  724    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  36.38 
 
 		 1092 aa  685    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  34.9 
 
 		 1134 aa  673    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1000  DNA polymerase III, alpha subunit  37.74 
 
 		 960 aa  653    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0880  DNA polymerase III, alpha subunit  41.88 
 
 		 1038 aa  753    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191787  hitchhiker  0.00000000000153929 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0774  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  100 
 
 		 1112 aa  2278    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  33.22 
 
 		 1156 aa  633  1e-180  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1759  DNA polymerase III, alpha subunit  36.61 
 
 		 1065 aa  633  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.463991  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1793  DNA polymerase III, alpha subunit  36.61 
 
 		 1065 aa  633  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1266  DNA polymerase III, alpha subunit  35.98 
 
 		 1065 aa  624  1e-177  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.502736  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1165  DNA polymerase III DnaE  35.68 
 
 		 1036 aa  623  1e-177  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  34.67 
 
 		 1184 aa  622  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  34.25 
 
 		 1075 aa  615  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  34.52 
 
 		 1165 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  33.87 
 
 		 1165 aa  611  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  35.06 
 
 		 1171 aa  612  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  34.55 
 
 		 1130 aa  611  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  34.83 
 
 		 1165 aa  608  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  32.85 
 
 		 1225 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4334  DNA polymerase III subunit alpha  33.54 
 
 		 1162 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  33.19 
 
 		 1156 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  33.48 
 
 		 1127 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  34.72 
 
 		 1179 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  31.18 
 
 		 1181 aa  600  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  35.31 
 
 		 1165 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  33.25 
 
 		 1165 aa  601  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  33.66 
 
 		 1132 aa  597  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  33.05 
 
 		 1159 aa  596  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  34.07 
 
 		 1172 aa  596  1e-168  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  32.08 
 
 		 1174 aa  593  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  32 
 
 		 1164 aa  593  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  32.39 
 
 		 1175 aa  590  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0939  DNA polymerase III DnaE  35.08 
 
 		 1034 aa  592  1e-167  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0592  DNA polymerase III subunit alpha  34.1 
 
 		 1161 aa  589  1e-167  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  34.11 
 
 		 1172 aa  592  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  33.33 
 
 		 1156 aa  590  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  30.93 
 
 		 1139 aa  587  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  34.3 
 
 		 1157 aa  587  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  34.01 
 
 		 1171 aa  588  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  32.59 
 
 		 1159 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  33.64 
 
 		 1160 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  33.81 
 
 		 1155 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  34.7 
 
 		 1172 aa  582  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  34.64 
 
 		 1172 aa  582  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  32.7 
 
 		 1155 aa  579  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  33.55 
 
 		 1173 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  32.26 
 
 		 1122 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  32.27 
 
 		 1149 aa  574  1.0000000000000001e-162  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  31.85 
 
 		 1148 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  32.65 
 
 		 1182 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  33.66 
 
 		 1165 aa  575  1.0000000000000001e-162  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  33.33 
 
 		 1151 aa  572  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  33.83 
 
 		 1182 aa  571  1e-161  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.836983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  33.02 
 
 		 1159 aa  571  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  33.4 
 
 		 1170 aa  566  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  33.51 
 
 		 1155 aa  567  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  32.71 
 
 		 1158 aa  569  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  32.88 
 
 		 1148 aa  565  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  32.43 
 
 		 1165 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  33.8 
 
 		 1190 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  33.3 
 
 		 1170 aa  562  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  32.71 
 
 		 1148 aa  561  1e-158  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  32.99 
 
 		 1170 aa  561  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  34.22 
 
 		 1148 aa  561  1e-158  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  34.24 
 
 		 1167 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.906306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1461  DNA polymerase III, alpha subunit  34.24 
 
 		 1166 aa  562  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  33.12 
 
 		 1174 aa  557  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3552  DNA polymerase III, alpha subunit  31.67 
 
 		 1217 aa  559  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.658792  hitchhiker  0.00874617 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  32.1 
 
 		 1159 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  29.79 
 
 		 1186 aa  554  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0538  DNA polymerase III, alpha subunit  32.14 
 
 		 1163 aa  553  1e-156  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0485  DNA polymerase III subunit alpha  33.49 
 
 		 1203 aa  553  1e-156  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1747  DNA polymerase III, alpha subunit  31.75 
 
 		 1122 aa  554  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0519  DNA polymerase III DnaE  34.05 
 
 		 1070 aa  553  1e-156  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3593  DNA polymerase III, alpha subunit  31.95 
 
 		 1210 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  32.09 
 
 		 1143 aa  551  1e-155  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  33.74 
 
 		 1143 aa  552  1e-155  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  31.83 
 
 		 1168 aa  552  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1538  DNA polymerase III subunit alpha  33.49 
 
 		 1213 aa  547  1e-154  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0583  DNA polymerase III, alpha subunit  33.49 
 
 		 1168 aa  547  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3525  DNA polymerase III, alpha subunit  31.86 
 
 		 1210 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1238  DNA polymerase III subunit alpha  33.79 
 
 		 1331 aa  547  1e-154  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  30.58 
 
 		 1173 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  31.78 
 
 		 1210 aa  546  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  31.3 
 
 		 1173 aa  545  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>