More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0519 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0939  DNA polymerase III DnaE  44.51 
 
 		 1034 aa  893    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0519  DNA polymerase III DnaE  100 
 
 		 1070 aa  2194    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1165  DNA polymerase III DnaE  43.59 
 
 		 1036 aa  891    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0750  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  34.95 
 
 		 1115 aa  620  1e-176  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  35.03 
 
 		 1104 aa  582  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0774  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  34.05 
 
 		 1112 aa  577  1.0000000000000001e-163  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  32.43 
 
 		 1108 aa  556  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4714  DNA polymerase III DnaE  32.52 
 
 		 1108 aa  558  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1266  DNA polymerase III, alpha subunit  33.04 
 
 		 1065 aa  554  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.502736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  32.19 
 
 		 1108 aa  555  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  32.28 
 
 		 1108 aa  553  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  32.19 
 
 		 1108 aa  554  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  32.19 
 
 		 1108 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  32.1 
 
 		 1108 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  32.01 
 
 		 1108 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  32.01 
 
 		 1108 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4434  DNA polymerase III DnaE  31.95 
 
 		 1110 aa  550  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  33.76 
 
 		 1092 aa  548  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  32.04 
 
 		 1109 aa  543  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0880  DNA polymerase III, alpha subunit  33.9 
 
 		 1038 aa  543  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191787  hitchhiker  0.00000000000153929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  31.55 
 
 		 1134 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  31.17 
 
 		 1139 aa  533  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1793  DNA polymerase III, alpha subunit  33.37 
 
 		 1065 aa  532  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1759  DNA polymerase III, alpha subunit  33.37 
 
 		 1065 aa  532  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.463991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  31.88 
 
 		 1145 aa  528  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1000  DNA polymerase III, alpha subunit  33.33 
 
 		 960 aa  527  1e-148  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  29.79 
 
 		 1156 aa  521  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  31.36 
 
 		 1181 aa  519  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  31.31 
 
 		 1148 aa  514  1e-144  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  32.18 
 
 		 1145 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  31.61 
 
 		 1156 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  30.94 
 
 		 1225 aa  506  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  32.21 
 
 		 1172 aa  499  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  31.74 
 
 		 1155 aa  502  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1612  DNA polymerase III, alpha subunit  30.84 
 
 		 1201 aa  498  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00506055  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  31.51 
 
 		 1148 aa  496  1e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  31.14 
 
 		 1156 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  30.55 
 
 		 1165 aa  494  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  32.84 
 
 		 1127 aa  494  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  32.85 
 
 		 1155 aa  492  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  30.39 
 
 		 1182 aa  491  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  31.82 
 
 		 1172 aa  491  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  30.98 
 
 		 1179 aa  490  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  31.54 
 
 		 1075 aa  491  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  32.12 
 
 		 1171 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  31.47 
 
 		 1165 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  31.73 
 
 		 1184 aa  493  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  31.31 
 
 		 1165 aa  488  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  30.91 
 
 		 1159 aa  487  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  31.66 
 
 		 1143 aa  486  1e-136  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  31.36 
 
 		 1143 aa  488  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  30.84 
 
 		 1170 aa  486  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  31.15 
 
 		 1168 aa  485  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  30.91 
 
 		 1170 aa  486  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  30.86 
 
 		 1165 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  31.73 
 
 		 1157 aa  480  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  31.73 
 
 		 1190 aa  480  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  31.26 
 
 		 1165 aa  483  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0921  DNA polymerase III subunit alpha  31.13 
 
 		 1165 aa  478  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  31.07 
 
 		 1155 aa  478  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  35.86 
 
 		 1171 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  31.19 
 
 		 1168 aa  476  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  31.24 
 
 		 1173 aa  478  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  32.3 
 
 		 1122 aa  477  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  29.61 
 
 		 1164 aa  476  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1283  DNA polymerase III subunit alpha  31.54 
 
 		 1165 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197401  normal  0.0648697 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  30.92 
 
 		 1132 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  31.5 
 
 		 1175 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0842  DNA polymerase III, alpha subunit  31.75 
 
 		 1262 aa  471  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.888931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4334  DNA polymerase III subunit alpha  31.36 
 
 		 1162 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  30.83 
 
 		 1130 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  31.18 
 
 		 1159 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1375  DNA polymerase III subunit alpha  31.37 
 
 		 1165 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3270  DNA polymerase III subunit alpha  30.41 
 
 		 1151 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  31.06 
 
 		 1172 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  30.97 
 
 		 1172 aa  469  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2601  DNA polymerase III subunit alpha  30.9 
 
 		 1151 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1742  DNA polymerase III subunit alpha  31.86 
 
 		 1179 aa  468  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.209003  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2433  DNA polymerase III subunit alpha  31.32 
 
 		 1185 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.184139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2858  DNA polymerase III subunit alpha  30.72 
 
 		 1151 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.813555  normal  0.262906 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1179  DNA polymerase III, alpha subunit  31.03 
 
 		 1162 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  30.47 
 
 		 1182 aa  467  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0780  DNA polymerase III, alpha subunit  31.29 
 
 		 1109 aa  464  1e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.493984  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2396  DNA polymerase III subunit alpha  31.03 
 
 		 1139 aa  466  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  30.79 
 
 		 1165 aa  465  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2126  DNA polymerase III subunit alpha  31.06 
 
 		 1257 aa  464  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.794686  normal  0.520943 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1770  DNA polymerase III, alpha subunit  30.69 
 
 		 1215 aa  466  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183542  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  32.15 
 
 		 1151 aa  463  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1255  DNA polymerase III subunit alpha  31.24 
 
 		 1172 aa  465  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0872  DNA polymerase III subunit alpha  31.34 
 
 		 1161 aa  465  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.224124  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4284  DNA polymerase III subunit alpha  31.68 
 
 		 1150 aa  463  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.166792 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  36.2 
 
 		 1165 aa  466  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4522  DNA polymerase III subunit alpha  31.01 
 
 		 1173 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl583  DNA polymerase III alpha subunit  30.43 
 
 		 992 aa  461  9.999999999999999e-129  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  36.98 
 
 		 1139 aa  461  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  30.8 
 
 		 1168 aa  462  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0825  DNA polymerase III subunit alpha  31.23 
 
 		 1163 aa  458  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1596  DNA polymerase III, alpha subunit  30.23 
 
 		 1159 aa  459  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  35.29 
 
 		 1186 aa  456  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  34.59 
 
 		 1170 aa  457  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>