More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0939 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0939  DNA polymerase III DnaE  100 
 
 		 1034 aa  2133    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0519  DNA polymerase III DnaE  44.51 
 
 		 1070 aa  866    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1165  DNA polymerase III DnaE  61.39 
 
 		 1036 aa  1325    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0750  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  35.65 
 
 		 1115 aa  606  9.999999999999999e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  35.13 
 
 		 1104 aa  589  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0774  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  35.08 
 
 		 1112 aa  592  1e-167  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  32.97 
 
 		 1108 aa  587  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4714  DNA polymerase III DnaE  32.97 
 
 		 1108 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  33.15 
 
 		 1109 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  33.46 
 
 		 1108 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  33.46 
 
 		 1108 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  33.55 
 
 		 1108 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  33.46 
 
 		 1108 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  33.46 
 
 		 1108 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  33 
 
 		 1108 aa  580  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  33 
 
 		 1108 aa  582  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4434  DNA polymerase III DnaE  33.3 
 
 		 1110 aa  581  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  32.87 
 
 		 1092 aa  562  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1266  DNA polymerase III, alpha subunit  34.9 
 
 		 1065 aa  544  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.502736  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0880  DNA polymerase III, alpha subunit  35.36 
 
 		 1038 aa  545  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191787  hitchhiker  0.00000000000153929 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  31.58 
 
 		 1156 aa  542  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  33.03 
 
 		 1127 aa  534  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  31.54 
 
 		 1134 aa  518  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  31.87 
 
 		 1075 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1793  DNA polymerase III, alpha subunit  33.53 
 
 		 1065 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1759  DNA polymerase III, alpha subunit  33.53 
 
 		 1065 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.463991  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  32.71 
 
 		 1151 aa  506  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  31.46 
 
 		 1145 aa  502  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  31.51 
 
 		 1171 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  30.98 
 
 		 1171 aa  499  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  30.48 
 
 		 1225 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  33.01 
 
 		 1139 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1000  DNA polymerase III, alpha subunit  33.33 
 
 		 960 aa  493  9.999999999999999e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  31.84 
 
 		 1165 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  31.55 
 
 		 1164 aa  491  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4334  DNA polymerase III subunit alpha  31.03 
 
 		 1162 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  31.49 
 
 		 1172 aa  489  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  31.96 
 
 		 1165 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  31.51 
 
 		 1165 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  30.95 
 
 		 1139 aa  488  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  31.03 
 
 		 1148 aa  486  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  31.63 
 
 		 1132 aa  485  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  32.33 
 
 		 1122 aa  481  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  30.78 
 
 		 1165 aa  480  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  30.76 
 
 		 1149 aa  477  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  32.03 
 
 		 1148 aa  476  1e-133  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  31.38 
 
 		 1148 aa  477  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  31.16 
 
 		 1172 aa  478  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  31.49 
 
 		 1165 aa  476  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  31.84 
 
 		 1148 aa  476  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  31.3 
 
 		 1165 aa  476  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  31.28 
 
 		 1130 aa  473  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  32.87 
 
 		 1145 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  30 
 
 		 1156 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  31.13 
 
 		 1175 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  29.82 
 
 		 1181 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  31.58 
 
 		 1159 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  30.33 
 
 		 1184 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  30.87 
 
 		 1170 aa  468  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  31.24 
 
 		 1170 aa  469  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  30.12 
 
 		 1172 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  31.06 
 
 		 1173 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  30.32 
 
 		 1143 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0592  DNA polymerase III subunit alpha  33.49 
 
 		 1161 aa  463  1e-129  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  30.46 
 
 		 1172 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  30.4 
 
 		 1170 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl583  DNA polymerase III alpha subunit  31.5 
 
 		 992 aa  462  9.999999999999999e-129  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  31.56 
 
 		 1159 aa  462  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  29.15 
 
 		 1182 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  32.77 
 
 		 1190 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  29.85 
 
 		 1179 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  30.11 
 
 		 1143 aa  459  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  29.72 
 
 		 1167 aa  454  1.0000000000000001e-126  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  29.85 
 
 		 1157 aa  456  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  31.97 
 
 		 1158 aa  456  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  30.07 
 
 		 1160 aa  456  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  31.58 
 
 		 1155 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1742  DNA polymerase III subunit alpha  30.73 
 
 		 1179 aa  450  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.209003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  30.42 
 
 		 1155 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  30.42 
 
 		 1168 aa  451  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  29.29 
 
 		 1156 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1747  DNA polymerase III, alpha subunit  32.31 
 
 		 1122 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  29.76 
 
 		 1158 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  28.95 
 
 		 1155 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1638  DNA polymerase III, alpha subunit  30.36 
 
 		 1189 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  29.47 
 
 		 1186 aa  445  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2601  DNA polymerase III subunit alpha  29.38 
 
 		 1151 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2858  DNA polymerase III subunit alpha  29.18 
 
 		 1151 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.813555  normal  0.262906 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2396  DNA polymerase III subunit alpha  30.52 
 
 		 1139 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1612  DNA polymerase III, alpha subunit  30.26 
 
 		 1201 aa  442  9.999999999999999e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00506055  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1255  DNA polymerase III subunit alpha  29.61 
 
 		 1172 aa  442  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  29.23 
 
 		 1165 aa  439  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3240  DNA polymerase III, alpha subunit  30.19 
 
 		 1190 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860175 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  29.91 
 
 		 1159 aa  438  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0921  DNA polymerase III subunit alpha  33.14 
 
 		 1165 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  29.85 
 
 		 1174 aa  433  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2402  DNA polymerase III subunit alpha  30 
 
 		 1163 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1499  DNA polymerase III subunit alpha  29.08 
 
 		 1185 aa  436  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  29.6 
 
 		 1190 aa  435  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1538  DNA polymerase III subunit alpha  30.33 
 
 		 1213 aa  436  1e-120  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>