More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1000 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1000  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 960 aa  1952    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0774  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  37.74 
 
 		 1112 aa  653    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0750  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  35.89 
 
 		 1115 aa  605  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  33.85 
 
 		 1092 aa  561  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  35.44 
 
 		 1104 aa  548  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1165  DNA polymerase III DnaE  35.65 
 
 		 1036 aa  531  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0880  DNA polymerase III, alpha subunit  33.72 
 
 		 1038 aa  516  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191787  hitchhiker  0.00000000000153929 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  32.14 
 
 		 1108 aa  514  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  32.24 
 
 		 1108 aa  513  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  32.24 
 
 		 1108 aa  513  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  32.04 
 
 		 1108 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  32.04 
 
 		 1108 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  32.04 
 
 		 1108 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  32.14 
 
 		 1108 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4714  DNA polymerase III DnaE  31.91 
 
 		 1108 aa  509  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  31.82 
 
 		 1108 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  31.57 
 
 		 1109 aa  509  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl583  DNA polymerase III alpha subunit  35.39 
 
 		 992 aa  503  1e-141  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  33.37 
 
 		 1127 aa  504  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0519  DNA polymerase III DnaE  33.33 
 
 		 1070 aa  504  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  31.36 
 
 		 1139 aa  496  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  32.55 
 
 		 1139 aa  497  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  35.65 
 
 		 1134 aa  494  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0939  DNA polymerase III DnaE  33.33 
 
 		 1034 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  32.07 
 
 		 1148 aa  486  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  31.95 
 
 		 1145 aa  484  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  29.69 
 
 		 1165 aa  483  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1266  DNA polymerase III, alpha subunit  32.36 
 
 		 1065 aa  480  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.502736  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1793  DNA polymerase III, alpha subunit  32.26 
 
 		 1065 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4434  DNA polymerase III DnaE  36.2 
 
 		 1110 aa  481  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1759  DNA polymerase III, alpha subunit  32.26 
 
 		 1065 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.463991  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  30.55 
 
 		 1159 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  35.47 
 
 		 1075 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  34.71 
 
 		 1156 aa  470  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0583  DNA polymerase III, alpha subunit  30.38 
 
 		 1168 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  31.04 
 
 		 1122 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  34.25 
 
 		 1225 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  29.82 
 
 		 1182 aa  463  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  30.82 
 
 		 1164 aa  466  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4067  DNA polymerase III subunit alpha  31.09 
 
 		 1174 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1179  DNA polymerase III, alpha subunit  30.04 
 
 		 1162 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  34.48 
 
 		 1145 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  30.58 
 
 		 1143 aa  456  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  30.68 
 
 		 1168 aa  458  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0637  DNA-directed DNA polymerase III (polc)  33.77 
 
 		 986 aa  456  1e-127  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0459907  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  34.72 
 
 		 1132 aa  456  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  30.48 
 
 		 1143 aa  457  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1148 aa  457  1e-127  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  33.76 
 
 		 1149 aa  453  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  31.4 
 
 		 1173 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1499  DNA polymerase III subunit alpha  30.22 
 
 		 1185 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  35.38 
 
 		 1174 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1161  DNA polymerase III subunit alpha  30.43 
 
 		 1174 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0775975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  35.84 
 
 		 1130 aa  455  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  30.31 
 
 		 1173 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  30.15 
 
 		 1174 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4171  DNA polymerase III subunit alpha  30.24 
 
 		 1174 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1830  DNA polymerase III, alpha subunit  29.73 
 
 		 1187 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.575666  normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  30.58 
 
 		 1173 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1375  DNA polymerase III subunit alpha  34.94 
 
 		 1165 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  30.58 
 
 		 1173 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1898  DNA polymerase III, alpha subunit  29.73 
 
 		 1179 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  30.38 
 
 		 1182 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0592  DNA polymerase III subunit alpha  36.71 
 
 		 1161 aa  446  1.0000000000000001e-124  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  33.58 
 
 		 1168 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0921  DNA polymerase III subunit alpha  35.62 
 
 		 1165 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3949  DNA polymerase III subunit alpha  29.67 
 
 		 1163 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  unclonable  0.0040384  normal  0.125075 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  29.76 
 
 		 1171 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  35.45 
 
 		 1186 aa  444  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  30.78 
 
 		 1151 aa  446  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  34.29 
 
 		 1165 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3236  DNA polymerase III subunit alpha  29.21 
 
 		 1163 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.040942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  36.9 
 
 		 1182 aa  442  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.836983  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  29.29 
 
 		 1172 aa  442  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  33.53 
 
 		 1181 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  29.75 
 
 		 1173 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  34.11 
 
 		 1158 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3553  DNA polymerase III subunit alpha  29.49 
 
 		 1163 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  34.87 
 
 		 1176 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1283  DNA polymerase III subunit alpha  34.51 
 
 		 1165 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197401  normal  0.0648697 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  35.18 
 
 		 1173 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2433  DNA polymerase III subunit alpha  36.28 
 
 		 1185 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.184139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1176  DNA polymerase III, alpha subunit  30.06 
 
 		 1162 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239797  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  34.68 
 
 		 1168 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  33.09 
 
 		 1183 aa  442  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1836  DNA polymerase III subunit alpha  29.58 
 
 		 1164 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  32.62 
 
 		 1165 aa  438  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  34.35 
 
 		 1162 aa  436  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  33.29 
 
 		 1159 aa  437  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  34.25 
 
 		 1165 aa  438  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  32.08 
 
 		 1165 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  32.62 
 
 		 1165 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3197  DNA polymerase III, alpha subunit  33.79 
 
 		 1139 aa  439  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  29.29 
 
 		 1172 aa  439  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  35.29 
 
 		 1165 aa  438  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1742  DNA polymerase III subunit alpha  34.88 
 
 		 1179 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.209003  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38840  DNA polymerase III subunit alpha  34.05 
 
 		 1176 aa  439  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  30.75 
 
 		 1190 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3240  DNA polymerase III, alpha subunit  34.29 
 
 		 1190 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860175 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  31.36 
 
 		 1149 aa  435  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>