More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2356 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  39.32 
 
 		 1122 aa  670    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  40.97 
 
 		 1181 aa  690    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  39.26 
 
 		 1170 aa  645    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  42.18 
 
 		 1155 aa  673    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  38.34 
 
 		 1174 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  39.06 
 
 		 1149 aa  643    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1048  DNA polymerase III, alpha subunit  40.67 
 
 		 1173 aa  640    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  decreased coverage  0.00537835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  40.67 
 
 		 1173 aa  639    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  42.09 
 
 		 1139 aa  724    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  42.28 
 
 		 1145 aa  720    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  44.6 
 
 		 1108 aa  765    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1161  DNA polymerase III subunit alpha  38.87 
 
 		 1174 aa  635    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0775975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1742  DNA polymerase III subunit alpha  43.46 
 
 		 1179 aa  662    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.209003  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0825  DNA polymerase III subunit alpha  44.42 
 
 		 1163 aa  675    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  41.38 
 
 		 1182 aa  650    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  38.11 
 
 		 1173 aa  638    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  44.82 
 
 		 1108 aa  765    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  44.71 
 
 		 1108 aa  761    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  44.82 
 
 		 1108 aa  763    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3270  DNA polymerase III subunit alpha  44.54 
 
 		 1151 aa  684    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  39.74 
 
 		 1156 aa  676    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  42.26 
 
 		 1167 aa  643    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.906306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  38.31 
 
 		 1173 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  41.08 
 
 		 1157 aa  676    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4067  DNA polymerase III subunit alpha  39.26 
 
 		 1174 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1283  DNA polymerase III subunit alpha  43.03 
 
 		 1165 aa  666    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197401  normal  0.0648697 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  41.29 
 
 		 1159 aa  655    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  38.36 
 
 		 1176 aa  651    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  44.82 
 
 		 1108 aa  766    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  39.44 
 
 		 1179 aa  644    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  43.93 
 
 		 1168 aa  697    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2356  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 992 aa  1984    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  41.73 
 
 		 1132 aa  674    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3553  DNA polymerase III subunit alpha  42.52 
 
 		 1163 aa  643    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  41.58 
 
 		 1156 aa  665    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  45.31 
 
 		 1134 aa  807    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4434  DNA polymerase III DnaE  44.71 
 
 		 1110 aa  760    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0819  DNA polymerase III subunit alpha  44.31 
 
 		 1163 aa  672    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4714  DNA polymerase III DnaE  44.94 
 
 		 1108 aa  768    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  42.18 
 
 		 1155 aa  670    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  38.83 
 
 		 1170 aa  637    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3949  DNA polymerase III subunit alpha  42.64 
 
 		 1163 aa  646    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  unclonable  0.0040384  normal  0.125075 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  44.82 
 
 		 1108 aa  765    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0995  DNA polymerase III, alpha subunit  40.68 
 
 		 1173 aa  644    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.207111 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2402  DNA polymerase III subunit alpha  45.35 
 
 		 1163 aa  688    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  38.22 
 
 		 1186 aa  647    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  42.42 
 
 		 1173 aa  649    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  42.92 
 
 		 1156 aa  674    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3346  DNA polymerase III subunit alpha  43.48 
 
 		 1142 aa  640    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  41.14 
 
 		 1159 aa  670    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1596  DNA polymerase III, alpha subunit  43.05 
 
 		 1159 aa  647    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2034  DNA polymerase III, alpha subunit  42.5 
 
 		 1172 aa  648    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2601  DNA polymerase III subunit alpha  43.6 
 
 		 1151 aa  672    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  38.58 
 
 		 1148 aa  692    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  40.77 
 
 		 1155 aa  671    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1375  DNA polymerase III subunit alpha  44.28 
 
 		 1165 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  44.71 
 
 		 1108 aa  765    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38840  DNA polymerase III subunit alpha  39.42 
 
 		 1176 aa  648    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  41.34 
 
 		 1151 aa  647    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2433  DNA polymerase III subunit alpha  43.76 
 
 		 1185 aa  673    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.184139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  41.03 
 
 		 1149 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  44.94 
 
 		 1108 aa  768    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3197  DNA polymerase III, alpha subunit  43.42 
 
 		 1139 aa  655    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2858  DNA polymerase III subunit alpha  43.27 
 
 		 1151 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.813555  normal  0.262906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  38.89 
 
 		 1168 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  44.53 
 
 		 1168 aa  689    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3236  DNA polymerase III subunit alpha  42.52 
 
 		 1163 aa  643    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.040942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  46.51 
 
 		 1139 aa  730    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4171  DNA polymerase III subunit alpha  38.24 
 
 		 1174 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  40.77 
 
 		 1159 aa  674    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0500  DNA polymerase III subunit alpha  40.42 
 
 		 1166 aa  641    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0751072  normal  0.378075 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  42.68 
 
 		 1145 aa  719    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1698  DNA polymerase III, alpha subunit  42.97 
 
 		 1152 aa  665    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  40.51 
 
 		 1165 aa  641    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1499  DNA polymerase III subunit alpha  38.8 
 
 		 1185 aa  651    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1255  DNA polymerase III subunit alpha  44.15 
 
 		 1172 aa  674    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4522  DNA polymerase III subunit alpha  43.5 
 
 		 1173 aa  678    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5992  DNA polymerase III, alpha subunit  42.31 
 
 		 1168 aa  652    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32354  normal  0.0431794 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0921  DNA polymerase III subunit alpha  44.58 
 
 		 1165 aa  675    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  44.06 
 
 		 1104 aa  722    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  42.6 
 
 		 1127 aa  733    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  40.88 
 
 		 1130 aa  676    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1378  DNA polymerase III subunit alpha  43.25 
 
 		 1147 aa  654    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.450591  normal  0.182438 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  42.42 
 
 		 1190 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  39.01 
 
 		 1173 aa  655    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  41.7 
 
 		 1225 aa  707    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1461  DNA polymerase III, alpha subunit  42.26 
 
 		 1166 aa  643    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  42.65 
 
 		 1164 aa  681    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  46.86 
 
 		 1092 aa  708    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  44.98 
 
 		 1109 aa  762    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  40.51 
 
 		 1159 aa  649    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  39.26 
 
 		 1170 aa  642    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  39.74 
 
 		 1184 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1762  DNA polymerase III subunit alpha  42.68 
 
 		 1156 aa  639    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.402462  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4284  DNA polymerase III subunit alpha  43.89 
 
 		 1150 aa  672    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.166792 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2808  DNA polymerase III subunit alpha  43.54 
 
 		 1143 aa  650    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.30719  normal  0.975511 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  41.29 
 
 		 1175 aa  644    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7295  DNA polymerase III, alpha subunit  42.49 
 
 		 1158 aa  657    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20831  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0872  DNA polymerase III subunit alpha  42.04 
 
 		 1161 aa  661    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.224124  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  44.94 
 
 		 1075 aa  712    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>