More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0898 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  34.16 
 
 		 1160 aa  659    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  34.08 
 
 		 1160 aa  657    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  35.5 
 
 		 1182 aa  691    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  37.71 
 
 		 1170 aa  707    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  37.4 
 
 		 1155 aa  706    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  34.16 
 
 		 1160 aa  659    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  36.09 
 
 		 1228 aa  727    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  38.12 
 
 		 1149 aa  709    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  38.25 
 
 		 1179 aa  699    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  38.61 
 
 		 1172 aa  716    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2376  DNA polymerase III subunit alpha  34.94 
 
 		 1178 aa  706    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51094 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0145  DNA polymerase III subunit alpha  35.62 
 
 		 1185 aa  784    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.789646  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0818  DNA polymerase III subunit alpha  37.56 
 
 		 1200 aa  636    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3187  DNA polymerase III subunit alpha  36.43 
 
 		 1180 aa  789    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.527295 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  34.13 
 
 		 1160 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.783595 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0506  DNA polymerase III subunit alpha  37.82 
 
 		 1201 aa  649    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1784  DNA polymerase III subunit alpha  35.64 
 
 		 1177 aa  779    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195815 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  37.23 
 
 		 1171 aa  707    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  35.81 
 
 		 1167 aa  675    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3107  DNA polymerase III subunit alpha  35.11 
 
 		 1191 aa  697    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.438164  normal  0.971034 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0374  DNA polymerase III, alpha subunit  34.6 
 
 		 1174 aa  709    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  36.87 
 
 		 1075 aa  793    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0198  DNA polymerase III, alpha subunit  36.17 
 
 		 1272 aa  640    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0979698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3476  DNA polymerase III subunit alpha  34.08 
 
 		 1160 aa  657    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0843038  normal  0.113533 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  39.05 
 
 		 1134 aa  781    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0047  DNA polymerase III subunit alpha  36.18 
 
 		 1188 aa  708    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.55181  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  38.7 
 
 		 1172 aa  716    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1028  DNA polymerase III subunit alpha  34.13 
 
 		 1160 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3525  DNA polymerase III, alpha subunit  34.21 
 
 		 1210 aa  655    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  34.59 
 
 		 1148 aa  677    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1496  DNA polymerase III subunit alpha  35.7 
 
 		 1157 aa  643    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1465  DNA polymerase III subunit alpha  35.61 
 
 		 1157 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  37.31 
 
 		 1156 aa  728    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  36.19 
 
 		 1165 aa  695    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1538  DNA polymerase III subunit alpha  37.35 
 
 		 1213 aa  650    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  38.96 
 
 		 1172 aa  712    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3552  DNA polymerase III, alpha subunit  35.69 
 
 		 1217 aa  685    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.658792  hitchhiker  0.00874617 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  35.51 
 
 		 1172 aa  708    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  35.97 
 
 		 1155 aa  755    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  36.74 
 
 		 1165 aa  718    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2092  DNA polymerase III, alpha subunit  32.9 
 
 		 1271 aa  652    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.346877  normal  0.0514777 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  36.32 
 
 		 1186 aa  727    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0910  DNA polymerase III subunit alpha  35.17 
 
 		 1186 aa  660    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.689093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  36.4 
 
 		 1165 aa  701    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11580  DNA polymerase III subunit alpha  35.07 
 
 		 1184 aa  713    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1363  DNA polymerase III subunit alpha  35.98 
 
 		 1157 aa  639    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  39.03 
 
 		 1156 aa  761    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  34.08 
 
 		 1160 aa  657    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  33.95 
 
 		 1210 aa  654    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4082  DNA polymerase III subunit alpha  34.11 
 
 		 1183 aa  734    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4168  DNA polymerase III subunit alpha  34.11 
 
 		 1249 aa  733    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1836  DNA polymerase III subunit alpha  34.03 
 
 		 1164 aa  669    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  40.02 
 
 		 1181 aa  793    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0269  DNA polymerase III subunit alpha  34.13 
 
 		 1160 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.814092 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  37.99 
 
 		 1157 aa  726    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0177  DNA polymerase III subunit alpha  34.16 
 
 		 1160 aa  654    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  38.57 
 
 		 1225 aa  787    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  35.14 
 
 		 1156 aa  741    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2412  DNA polymerase III subunit alpha  35.14 
 
 		 1159 aa  637    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0257  DNA polymerase III subunit alpha  33.98 
 
 		 1160 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.988974 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1288  DNA polymerase III subunit alpha  37.87 
 
 		 1200 aa  638    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  39.16 
 
 		 1145 aa  775    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1460  DNA polymerase III subunit alpha  35.87 
 
 		 1157 aa  648    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  35.16 
 
 		 1159 aa  749    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  38.53 
 
 		 1171 aa  721    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  35.55 
 
 		 1510 aa  655    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  36.7 
 
 		 1165 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3087  DNA polymerase III subunit alpha  35.11 
 
 		 1191 aa  697    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714026  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  36.89 
 
 		 1165 aa  757    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1081  DNA polymerase III subunit alpha  34.29 
 
 		 1171 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.990862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3420  DNA polymerase III subunit alpha  34.13 
 
 		 1171 aa  640    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  35.8 
 
 		 1194 aa  658    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  33.65 
 
 		 1158 aa  645    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  36.19 
 
 		 1158 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  36.27 
 
 		 1158 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01387  DNA polymerase III subunit alpha  35.2 
 
 		 1154 aa  659    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0272  DNA polymerase III subunit alpha  34.05 
 
 		 1160 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218941  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  40.27 
 
 		 1130 aa  756    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0091  DNA polymerase III, alpha subunit  35.84 
 
 		 1279 aa  649    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483462  normal  0.136645 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  33.44 
 
 		 1160 aa  640    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0195  DNA polymerase III subunit alpha  34 
 
 		 1160 aa  658    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1581  DNA polymerase III subunit alpha  36.13 
 
 		 1185 aa  740    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305928  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  36.13 
 
 		 1165 aa  692    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  38.29 
 
 		 1164 aa  745    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  36.01 
 
 		 1195 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  36.19 
 
 		 1158 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  37 
 
 		 1190 aa  775    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1238  DNA polymerase III subunit alpha  37.1 
 
 		 1331 aa  654    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  38.07 
 
 		 1184 aa  721    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1798  DNA polymerase III subunit alpha  35.44 
 
 		 1177 aa  772    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3050  DNA polymerase III subunit alpha  36.26 
 
 		 1183 aa  713    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  35.36 
 
 		 1157 aa  659    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3147  DNA polymerase III subunit alpha  35.11 
 
 		 1191 aa  697    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0480917  normal  0.366201 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  37.46 
 
 		 1170 aa  717    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2777  DNA polymerase III subunit alpha  35.06 
 
 		 1182 aa  710    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.91865  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  35.84 
 
 		 1162 aa  659    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  37.9 
 
 		 1175 aa  699    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3636  DNA polymerase III subunit alpha  34.58 
 
 		 1183 aa  693    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  37.09 
 
 		 1165 aa  716    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  34.05 
 
 		 1160 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.791308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>