More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1741 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0499  DNA polymerase III, alpha subunit  59.5 
 
 		 1029 aa  1236    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0516  DNA polymerase III, alpha subunit  61.18 
 
 		 1079 aa  1062    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1741  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1047 aa  2169    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0237  DNA polymerase III, alpha subunit  43.1 
 
 		 1003 aa  772    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0929  DNA polymerase III, alpha subunit  45.65 
 
 		 1003 aa  841    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  31.24 
 
 		 1145 aa  489  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6872  DNA polymerase III, alpha subunit  32.23 
 
 		 982 aa  488  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  32.54 
 
 		 1139 aa  486  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4714  DNA polymerase III DnaE  31.05 
 
 		 1108 aa  482  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  30.86 
 
 		 1108 aa  478  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  31.48 
 
 		 1075 aa  478  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  30.68 
 
 		 1109 aa  473  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  30.76 
 
 		 1108 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1009  DNA polymerase III, alpha subunit  33.66 
 
 		 1039 aa  472  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0533804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  30.76 
 
 		 1108 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3769  DNA polymerase III, alpha subunit  32.34 
 
 		 1018 aa  472  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  30.57 
 
 		 1108 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  30.66 
 
 		 1108 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  30.54 
 
 		 1108 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  30.46 
 
 		 1122 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  30.66 
 
 		 1108 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4434  DNA polymerase III DnaE  30.67 
 
 		 1110 aa  466  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  30.57 
 
 		 1108 aa  466  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  31.43 
 
 		 1134 aa  463  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3569  DNA polymerase III, alpha subunit  31.51 
 
 		 1017 aa  463  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  30.25 
 
 		 1181 aa  464  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  30.73 
 
 		 1225 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  31.22 
 
 		 1127 aa  460  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  32.04 
 
 		 1156 aa  462  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  31.43 
 
 		 1130 aa  459  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  31.8 
 
 		 1159 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  31.86 
 
 		 1151 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  31.06 
 
 		 1157 aa  450  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  29.96 
 
 		 1139 aa  452  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  30.58 
 
 		 1155 aa  453  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  30.11 
 
 		 1156 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3236  DNA polymerase III, alpha subunit  32.06 
 
 		 980 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1371  DNA polymerase III, alpha subunit  31.63 
 
 		 979 aa  446  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.940819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  31.22 
 
 		 1155 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  32.68 
 
 		 1092 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4916  DNA polymerase III, alpha subunit  31.59 
 
 		 989 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188475  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1148 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  29.43 
 
 		 1145 aa  438  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  30.59 
 
 		 1155 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  31.89 
 
 		 1182 aa  439  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  30.49 
 
 		 1164 aa  436  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  30.2 
 
 		 1149 aa  436  1e-120  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  31.33 
 
 		 1176 aa  433  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  30.52 
 
 		 1156 aa  436  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  28.95 
 
 		 1159 aa  436  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  30.24 
 
 		 1170 aa  432  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  28.93 
 
 		 1148 aa  431  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  30.93 
 
 		 1132 aa  431  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  29.92 
 
 		 1170 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  31.34 
 
 		 1182 aa  428  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  31.4 
 
 		 1184 aa  429  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  30.4 
 
 		 1173 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  30.25 
 
 		 1143 aa  424  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  31.03 
 
 		 1158 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  29.54 
 
 		 1170 aa  420  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3197  DNA polymerase III, alpha subunit  31.74 
 
 		 1139 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1461  DNA polymerase III, alpha subunit  31.55 
 
 		 1166 aa  422  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  31.55 
 
 		 1167 aa  422  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.906306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4284  DNA polymerase III subunit alpha  31.43 
 
 		 1150 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.166792 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  30.63 
 
 		 1158 aa  422  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  31.03 
 
 		 1158 aa  422  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  30.83 
 
 		 1158 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  30.38 
 
 		 1143 aa  421  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  31 
 
 		 1190 aa  422  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2499  DNA polymerase III, alpha subunit  30.3 
 
 		 1260 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  28.38 
 
 		 1186 aa  422  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  30.43 
 
 		 1165 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3552  DNA polymerase III, alpha subunit  29.73 
 
 		 1217 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.658792  hitchhiker  0.00874617 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0177  DNA polymerase III subunit alpha  30.8 
 
 		 1160 aa  418  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  30.77 
 
 		 1165 aa  419  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  30.87 
 
 		 1179 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  30.78 
 
 		 1157 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1363  DNA polymerase III subunit alpha  30.78 
 
 		 1157 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  30.66 
 
 		 1175 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  30.7 
 
 		 1160 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  30.7 
 
 		 1160 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0592  DNA polymerase III subunit alpha  29.72 
 
 		 1161 aa  416  1e-114  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  30.84 
 
 		 1158 aa  415  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  30.7 
 
 		 1160 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  29.28 
 
 		 1180 aa  414  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0195  DNA polymerase III subunit alpha  30.61 
 
 		 1160 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  30.7 
 
 		 1160 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00181  hypothetical protein  30.7 
 
 		 1160 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.466902  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1285  DNA polymerase III subunit alpha  30.64 
 
 		 1158 aa  413  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.876044  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  30.43 
 
 		 1160 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  30.34 
 
 		 1165 aa  411  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1460  DNA polymerase III subunit alpha  30.84 
 
 		 1157 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0194  DNA polymerase III subunit alpha  30.7 
 
 		 1160 aa  412  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  30.28 
 
 		 1165 aa  412  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  30.29 
 
 		 1104 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1569  DNA polymerase III subunit alpha  30.5 
 
 		 1159 aa  412  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.840877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2887  DNA polymerase III subunit alpha  30.78 
 
 		 1157 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0886013 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  28.05 
 
 		 1194 aa  412  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3476  DNA polymerase III subunit alpha  30.61 
 
 		 1160 aa  412  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0843038  normal  0.113533 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0153  DNA polymerase III subunit alpha  29.81 
 
 		 1193 aa  412  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>