More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0929 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1741  DNA polymerase III, alpha subunit  45.45 
 
 		 1047 aa  827    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0516  DNA polymerase III, alpha subunit  48.18 
 
 		 1079 aa  775    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0929  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1003 aa  2049    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0499  DNA polymerase III, alpha subunit  45.86 
 
 		 1029 aa  865    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0237  DNA polymerase III, alpha subunit  46.94 
 
 		 1003 aa  831    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  34.12 
 
 		 1156 aa  530  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  31.9 
 
 		 1145 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  32.93 
 
 		 1075 aa  513  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  35.32 
 
 		 1139 aa  516  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  31.77 
 
 		 1225 aa  506  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  30.53 
 
 		 1134 aa  501  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  31.8 
 
 		 1127 aa  498  1e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  30.81 
 
 		 1122 aa  498  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  30 
 
 		 1139 aa  492  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  30.2 
 
 		 1181 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  30.93 
 
 		 1130 aa  470  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  30.39 
 
 		 1145 aa  469  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  31.16 
 
 		 1170 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  28.11 
 
 		 1148 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  31.47 
 
 		 1174 aa  459  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  30.94 
 
 		 1170 aa  458  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  30.28 
 
 		 1156 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  30.29 
 
 		 1164 aa  458  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  30.88 
 
 		 1170 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  29.35 
 
 		 1149 aa  455  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  30.09 
 
 		 1157 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  30.23 
 
 		 1159 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  30.35 
 
 		 1155 aa  452  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  29.31 
 
 		 1109 aa  450  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0198  DNA polymerase III, alpha subunit  31.16 
 
 		 1272 aa  449  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0979698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  32.6 
 
 		 1167 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.906306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2499  DNA polymerase III, alpha subunit  30.39 
 
 		 1260 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  29.27 
 
 		 1155 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1461  DNA polymerase III, alpha subunit  32.6 
 
 		 1166 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  31.49 
 
 		 1182 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  32.23 
 
 		 1182 aa  449  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0091  DNA polymerase III, alpha subunit  30.91 
 
 		 1279 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483462  normal  0.136645 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  30.75 
 
 		 1155 aa  443  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  30.73 
 
 		 1158 aa  445  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1009  DNA polymerase III, alpha subunit  33.5 
 
 		 1039 aa  444  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0533804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1742  DNA polymerase III subunit alpha  30.33 
 
 		 1179 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.209003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  29.99 
 
 		 1108 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  31.36 
 
 		 1132 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  29.47 
 
 		 1156 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  28.36 
 
 		 1167 aa  442  9.999999999999999e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1375  DNA polymerase III subunit alpha  29.76 
 
 		 1165 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  29.69 
 
 		 1159 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  29.9 
 
 		 1160 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  29.9 
 
 		 1160 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0195  DNA polymerase III subunit alpha  29.99 
 
 		 1160 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1283  DNA polymerase III subunit alpha  29.8 
 
 		 1165 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197401  normal  0.0648697 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  30.03 
 
 		 1108 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  31.74 
 
 		 1159 aa  438  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  30.13 
 
 		 1108 aa  439  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  30.13 
 
 		 1108 aa  439  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  30.13 
 
 		 1108 aa  439  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  29.9 
 
 		 1160 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4714  DNA polymerase III DnaE  29.99 
 
 		 1108 aa  438  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3146  DNA polymerase III subunit alpha  30.94 
 
 		 1157 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  30.68 
 
 		 1165 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  30.13 
 
 		 1108 aa  439  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  27.6 
 
 		 1186 aa  438  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2601  DNA polymerase III subunit alpha  30.84 
 
 		 1151 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  30.13 
 
 		 1108 aa  439  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  29.93 
 
 		 1108 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1363  DNA polymerase III subunit alpha  30.32 
 
 		 1157 aa  439  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0750  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  29.55 
 
 		 1115 aa  436  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3857  DNA polymerase III, alpha subunit  29.84 
 
 		 1296 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3236  DNA polymerase III, alpha subunit  30.81 
 
 		 980 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  29.9 
 
 		 1160 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  28.69 
 
 		 1165 aa  439  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3476  DNA polymerase III subunit alpha  29.99 
 
 		 1160 aa  437  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0843038  normal  0.113533 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  29.57 
 
 		 1180 aa  438  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3769  DNA polymerase III, alpha subunit  30.22 
 
 		 1018 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00181  hypothetical protein  29.9 
 
 		 1160 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.466902  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2412  DNA polymerase III subunit alpha  30.51 
 
 		 1159 aa  439  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1836  DNA polymerase III subunit alpha  29.86 
 
 		 1164 aa  434  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  30.72 
 
 		 1168 aa  434  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3266  DNA polymerase III subunit alpha  30.45 
 
 		 1157 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.440143 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  31.26 
 
 		 1158 aa  434  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  31.2 
 
 		 1173 aa  435  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6872  DNA polymerase III, alpha subunit  29.42 
 
 		 982 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2858  DNA polymerase III subunit alpha  30.74 
 
 		 1151 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.813555  normal  0.262906 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0194  DNA polymerase III subunit alpha  29.81 
 
 		 1160 aa  434  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  31.81 
 
 		 1165 aa  436  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4916  DNA polymerase III, alpha subunit  32.33 
 
 		 989 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188475  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0177  DNA polymerase III subunit alpha  29.97 
 
 		 1160 aa  435  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  29.93 
 
 		 1151 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4522  DNA polymerase III subunit alpha  31.04 
 
 		 1173 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0592  DNA polymerase III subunit alpha  29.13 
 
 		 1161 aa  431  1e-119  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  30.13 
 
 		 1158 aa  431  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  32.4 
 
 		 1092 aa  432  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  30.52 
 
 		 1168 aa  431  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1460  DNA polymerase III subunit alpha  30.48 
 
 		 1157 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  30.23 
 
 		 1158 aa  432  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1496  DNA polymerase III subunit alpha  30.51 
 
 		 1157 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0921  DNA polymerase III subunit alpha  29.69 
 
 		 1165 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0872  DNA polymerase III subunit alpha  29.57 
 
 		 1161 aa  432  1e-119  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.224124  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1569  DNA polymerase III subunit alpha  30.2 
 
 		 1159 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.840877  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  31 
 
 		 1168 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>