More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0237 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0499  DNA polymerase III, alpha subunit  42.84 
 
 		 1029 aa  769    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1741  DNA polymerase III, alpha subunit  43 
 
 		 1047 aa  760    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0237  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1003 aa  2081    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0516  DNA polymerase III, alpha subunit  41.4 
 
 		 1079 aa  766    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0929  DNA polymerase III, alpha subunit  46.94 
 
 		 1003 aa  831    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  33.08 
 
 		 1156 aa  488  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  30.93 
 
 		 1145 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  31.29 
 
 		 1075 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  32.82 
 
 		 1139 aa  466  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6872  DNA polymerase III, alpha subunit  31.55 
 
 		 982 aa  469  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  29.4 
 
 		 1181 aa  466  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3769  DNA polymerase III, alpha subunit  32.38 
 
 		 1018 aa  462  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3569  DNA polymerase III, alpha subunit  32.05 
 
 		 1017 aa  455  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  30.22 
 
 		 1134 aa  456  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1371  DNA polymerase III, alpha subunit  32.55 
 
 		 979 aa  449  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.940819 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  30.08 
 
 		 1127 aa  445  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  29.75 
 
 		 1145 aa  444  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  30.68 
 
 		 1132 aa  444  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4916  DNA polymerase III, alpha subunit  32.13 
 
 		 989 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188475  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  29.16 
 
 		 1159 aa  433  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  31.62 
 
 		 1165 aa  432  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1148 aa  432  1e-119  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  29.93 
 
 		 1151 aa  432  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  29.21 
 
 		 1225 aa  432  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  29.2 
 
 		 1157 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  28.59 
 
 		 1149 aa  425  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  29.25 
 
 		 1139 aa  426  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  29.38 
 
 		 1156 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  29.63 
 
 		 1155 aa  425  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  28.94 
 
 		 1165 aa  421  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  29.79 
 
 		 1179 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  28.77 
 
 		 1194 aa  422  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  29.29 
 
 		 1184 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1009  DNA polymerase III, alpha subunit  32.35 
 
 		 1039 aa  422  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0533804  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  31.69 
 
 		 1167 aa  416  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.906306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  28.52 
 
 		 1165 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  29.43 
 
 		 1159 aa  415  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3236  DNA polymerase III, alpha subunit  30.55 
 
 		 980 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  28.45 
 
 		 1165 aa  415  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1461  DNA polymerase III, alpha subunit  31.69 
 
 		 1166 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  28.85 
 
 		 1170 aa  412  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  30.21 
 
 		 1173 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  31.94 
 
 		 1092 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  29.01 
 
 		 1156 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  28.25 
 
 		 1155 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  29.99 
 
 		 1171 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  28.43 
 
 		 1165 aa  413  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  29.99 
 
 		 1130 aa  410  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  28.85 
 
 		 1170 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  28.72 
 
 		 1165 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  29.36 
 
 		 1160 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  30.34 
 
 		 1172 aa  409  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1742  DNA polymerase III subunit alpha  30.22 
 
 		 1179 aa  409  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.209003  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  29.82 
 
 		 1168 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  29.9 
 
 		 1175 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  28.54 
 
 		 1167 aa  405  1e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3346  DNA polymerase III subunit alpha  31.33 
 
 		 1142 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0198  DNA polymerase III, alpha subunit  30.17 
 
 		 1272 aa  405  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0979698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  28.74 
 
 		 1164 aa  405  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4522  DNA polymerase III subunit alpha  30.27 
 
 		 1173 aa  405  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  28.72 
 
 		 1155 aa  403  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4434  DNA polymerase III DnaE  28.33 
 
 		 1110 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3270  DNA polymerase III subunit alpha  30.57 
 
 		 1151 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  27.61 
 
 		 1108 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4714  DNA polymerase III DnaE  27.51 
 
 		 1108 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4334  DNA polymerase III subunit alpha  29.57 
 
 		 1162 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  29.8 
 
 		 1168 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  28.26 
 
 		 1122 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0921  DNA polymerase III subunit alpha  29.36 
 
 		 1165 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  29.29 
 
 		 1104 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  28.03 
 
 		 1109 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1747  DNA polymerase III, alpha subunit  27.88 
 
 		 1122 aa  401  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  29.2 
 
 		 1170 aa  401  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  29.49 
 
 		 1171 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  27.83 
 
 		 1108 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  27.83 
 
 		 1108 aa  398  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  27.97 
 
 		 1108 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13406  error-prone DNA polymerase  31.17 
 
 		 1079 aa  399  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0998493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  29.36 
 
 		 1172 aa  397  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  27.83 
 
 		 1108 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  27.83 
 
 		 1108 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2601  DNA polymerase III subunit alpha  30.34 
 
 		 1151 aa  400  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  28.51 
 
 		 1148 aa  399  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0167  DNA polymerase III, alpha subunit  31.32 
 
 		 1077 aa  397  1e-109  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2858  DNA polymerase III subunit alpha  30.34 
 
 		 1151 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.813555  normal  0.262906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1530  error-prone DNA polymerase  29.89 
 
 		 1098 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94615 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  27.88 
 
 		 1108 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0592  DNA polymerase III subunit alpha  28.64 
 
 		 1161 aa  394  1e-108  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  27.83 
 
 		 1108 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0091  DNA polymerase III, alpha subunit  29.83 
 
 		 1279 aa  395  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483462  normal  0.136645 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  30.11 
 
 		 1182 aa  393  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1283  DNA polymerase III subunit alpha  29.22 
 
 		 1165 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197401  normal  0.0648697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  30.44 
 
 		 1190 aa  395  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2499  DNA polymerase III, alpha subunit  30.5 
 
 		 1260 aa  393  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1375  DNA polymerase III subunit alpha  28.82 
 
 		 1165 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1210  error-prone DNA polymerase  29.91 
 
 		 1099 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0855057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4893  error-prone DNA polymerase  29.89 
 
 		 1087 aa  391  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0740584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1183  error-prone DNA polymerase  29.91 
 
 		 1099 aa  392  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2396  DNA polymerase III subunit alpha  29.79 
 
 		 1139 aa  391  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3197  DNA polymerase III, alpha subunit  29.23 
 
 		 1139 aa  392  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>