More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4047 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2837  error-prone DNA polymerase  38.63 
 
 		 1071 aa  663    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1210  error-prone DNA polymerase  43.39 
 
 		 1099 aa  768    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0855057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4576  DNA polymerase III, alpha subunit  39.47 
 
 		 1071 aa  681    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.427966 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1119  DNA polymerase III, alpha subunit  42.49 
 
 		 1196 aa  645    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0282531  normal  0.883779 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5159  DNA polymerase III, alpha subunit  39.76 
 
 		 1087 aa  718    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.572913  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3119  error-prone DNA polymerase  39.61 
 
 		 1026 aa  682    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3239  error-prone DNA polymerase  41.27 
 
 		 1124 aa  694    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.023295  normal  0.114564 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02868  DNA polymerase III alpha chain  36.73 
 
 		 1024 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2164  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  39.21 
 
 		 1047 aa  688    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0800  error-prone DNA polymerase  39.4 
 
 		 1075 aa  681    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.338798 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3292  DNA polymerase III, alpha subunit  39.65 
 
 		 1082 aa  716    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0677218  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0069  error-prone DNA polymerase  39.35 
 
 		 1077 aa  700    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2795  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  40.04 
 
 		 1031 aa  712    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0590978  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3998  DNA polymerase III, alpha subunit  38 
 
 		 1116 aa  649    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1474  error-prone DNA polymerase  38.57 
 
 		 1063 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2902  error-prone DNA polymerase  38.57 
 
 		 1063 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3145  error-prone DNA polymerase  38.57 
 
 		 1063 aa  641    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5201  DNA polymerase III, alpha subunit  38.32 
 
 		 1053 aa  663    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0149235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4053  DNA polymerase III, alpha subunit  45.88 
 
 		 1116 aa  928    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2732  DNA polymerase III, alpha subunit  39.94 
 
 		 1044 aa  655    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.421518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2523  error-prone DNA polymerase  40.35 
 
 		 1031 aa  706    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494212  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4841  error-prone DNA polymerase  40.21 
 
 		 1024 aa  689    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1942  DNA polymerase III, alpha subunit  40.34 
 
 		 1027 aa  695    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0322539 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1546  DNA polymerase III, alpha subunit  39.66 
 
 		 1020 aa  666    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297592 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0828  DNA polymerase III, alpha subunit  42.59 
 
 		 1023 aa  716    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1071  DNA polymerase III, alpha subunit  38.18 
 
 		 1145 aa  661    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1934  error-prone DNA polymerase  40.15 
 
 		 1026 aa  701    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0139985  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1970  DNA polymerase III, alpha subunit  39.94 
 
 		 1049 aa  690    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0692  error-prone DNA polymerase  38.84 
 
 		 1072 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310882  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0808  DNA polymerase III, alpha subunit  39.91 
 
 		 1059 aa  688    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.881912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0510  error-prone DNA polymerase  38.84 
 
 		 1072 aa  645    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3149  error-prone DNA polymerase  40.15 
 
 		 1025 aa  720    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2380  error-prone DNA polymerase  38.66 
 
 		 1036 aa  690    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2428  error-prone DNA polymerase  39.44 
 
 		 1026 aa  686    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2672  DNA polymerase III, alpha subunit  39.94 
 
 		 1076 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087577 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6156  error-prone DNA polymerase  38.33 
 
 		 1068 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80972  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1532  DNA polymerase III, alpha subunit  38.62 
 
 		 1099 aa  652    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0291245  normal  0.633763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2006  error-prone DNA polymerase  41.69 
 
 		 1195 aa  659    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2598  error-prone DNA polymerase  39.74 
 
 		 1026 aa  689    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3021  DNA polymerase III, alpha subunit  38.62 
 
 		 1116 aa  677    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2802  DNA polymerase III, alpha subunit  38.71 
 
 		 1090 aa  695    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.549156 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5094  DNA polymerase III, alpha subunit  39.81 
 
 		 1070 aa  678    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2599  DNA polymerase III, alpha subunit  39.41 
 
 		 1040 aa  698    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2744  error-prone DNA polymerase  38.63 
 
 		 1071 aa  656    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1871  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  39.66 
 
 		 1015 aa  665    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1612  DNA polymerase III, alpha subunit  46.76 
 
 		 1132 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.929723  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3563  error-prone DNA polymerase  37.05 
 
 		 1165 aa  658    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.863163  normal  0.552046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1538  DNA polymerase III, alpha subunit  39.55 
 
 		 1078 aa  666    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1558  DNA polymerase III, alpha subunit  37.78 
 
 		 1097 aa  645    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1227  DNA polymerase III, alpha subunit  39.24 
 
 		 1084 aa  660    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1028  pantoate-beta-alanine ligase  36.07 
 
 		 1029 aa  637    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6269  DNA polymerase III, alpha subunit  38.63 
 
 		 1049 aa  679    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1733  error-prone DNA polymerase  38.72 
 
 		 1112 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.647587  hitchhiker  0.00382273 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0527  error-prone DNA polymerase  38.84 
 
 		 1072 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3890  DNA polymerase III, alpha subunit  37.15 
 
 		 1150 aa  661    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227818  normal  0.0207545 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1331  DNA polymerase III, alpha subunit  37.95 
 
 		 1049 aa  650    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0114  error-prone DNA polymerase  38.57 
 
 		 1063 aa  641    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1903  error-prone DNA polymerase  38.53 
 
 		 1110 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.989909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3147  DNA polymerase III, alpha subunit  39.91 
 
 		 1059 aa  691    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4488  error-prone DNA polymerase  38.36 
 
 		 1079 aa  660    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458186  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3765  DNA polymerase III, alpha subunit  39.87 
 
 		 1087 aa  709    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02092  error-prone DNA polymerase  39.5 
 
 		 1083 aa  668    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1948  DNA polymerase III, alpha subunit  39.45 
 
 		 1075 aa  676    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4047  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1070 aa  2205    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0175  DNA polymerase III, alpha subunit  38.58 
 
 		 1126 aa  641    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0477  error-prone DNA polymerase  38.41 
 
 		 1071 aa  647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5036  DNA polymerase III, alpha subunit  39.15 
 
 		 1071 aa  677    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.38358  normal  0.080697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4893  error-prone DNA polymerase  43.27 
 
 		 1087 aa  769    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0740584 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2213  error-prone DNA polymerase  38.81 
 
 		 1071 aa  664    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271039  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1183  error-prone DNA polymerase  43.39 
 
 		 1099 aa  769    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13406  error-prone DNA polymerase  44.04 
 
 		 1079 aa  762    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0998493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4496  DNA polymerase III, alpha subunit  38.84 
 
 		 1075 aa  667    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964877  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0619  DNA polymerase III, alpha subunit  39.94 
 
 		 1033 aa  729    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.130808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3263  DNA polymerase III, alpha subunit  39.25 
 
 		 1126 aa  703    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3809  DNA polymerase III, alpha subunit  38.41 
 
 		 1096 aa  667    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.595243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2738  error-prone DNA polymerase  39.53 
 
 		 1026 aa  699    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1175  DNA polymerase III, alpha subunit  40.76 
 
 		 1025 aa  704    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286001  normal  0.0989959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  38.82 
 
 		 1109 aa  679    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279122 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6769  DNA polymerase III, alpha subunit  38.51 
 
 		 1049 aa  658    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1831  DNA polymerase III, alpha subunit  39.87 
 
 		 1093 aa  694    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.715135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0463  DNA polymerase III, alpha subunit  39.07 
 
 		 1044 aa  659    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2886  error-prone DNA polymerase  38.59 
 
 		 1071 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.811803  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3466  error-prone DNA polymerase  40.88 
 
 		 1124 aa  697    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14636  decreased coverage  0.00222326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55610  error-prone DNA polymerase  40.35 
 
 		 1031 aa  699    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0362545 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2336  DNA polymerase III, alpha subunit  47.01 
 
 		 1142 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2826  error-prone DNA polymerase  38.81 
 
 		 1071 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27708  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0932  DNA polymerase III, alpha subunit  41.27 
 
 		 1093 aa  728    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966242  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6871  DNA polymerase III, alpha subunit  38.42 
 
 		 1049 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451671  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2014  DNA polymerase III, alpha subunit  39.09 
 
 		 1096 aa  647    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202336  normal  0.139953 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2531  DNA polymerase III, alpha subunit  39.4 
 
 		 1085 aa  711    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465943 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0995  error-prone DNA polymerase  41.39 
 
 		 1090 aa  701    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1967  DNA polymerase III, alpha subunit  39.49 
 
 		 1064 aa  649    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785197  normal  0.846182 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0079  error-prone DNA polymerase  39.66 
 
 		 1077 aa  707    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4291  DNA polymerase III, alpha subunit  39.21 
 
 		 1077 aa  679    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1897  error-prone DNA polymerase  38.59 
 
 		 1145 aa  660    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211762  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2248  DNA polymerase III, alpha subunit  47.14 
 
 		 1133 aa  640    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.649933  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1863  DNA-directed DNA polymerase  37.85 
 
 		 1030 aa  649    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0330088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1200  error-prone DNA polymerase  43.39 
 
 		 1099 aa  769    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1530  error-prone DNA polymerase  43.23 
 
 		 1098 aa  764    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0202  DNA polymerase III, alpha subunit  38.79 
 
 		 1043 aa  672    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0663239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>