More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0995 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2531  DNA polymerase III, alpha subunit  39.58 
 
 
1085 aa  691    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.465943 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3147  DNA polymerase III, alpha subunit  40.94 
 
 
1059 aa  655    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2428  error-prone DNA polymerase  42.72 
 
 
1026 aa  689    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370616  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3119  error-prone DNA polymerase  42.65 
 
 
1026 aa  710    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0808  DNA polymerase III, alpha subunit  40.69 
 
 
1059 aa  653    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.881912  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3292  DNA polymerase III, alpha subunit  39.75 
 
 
1082 aa  677    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0677218  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2164  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  42.87 
 
 
1047 aa  706    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4536  DNA polymerase III, alpha subunit  42.66 
 
 
1040 aa  704    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0510  error-prone DNA polymerase  41.09 
 
 
1072 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0069  error-prone DNA polymerase  40.04 
 
 
1077 aa  679    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3021  DNA polymerase III, alpha subunit  40.66 
 
 
1116 aa  669    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2795  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  40.43 
 
 
1031 aa  677    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0590978  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1934  error-prone DNA polymerase  41.95 
 
 
1026 aa  680    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0139985  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3145  error-prone DNA polymerase  40.85 
 
 
1063 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2523  error-prone DNA polymerase  40.43 
 
 
1031 aa  684    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494212  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1474  error-prone DNA polymerase  40.85 
 
 
1063 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1942  DNA polymerase III, alpha subunit  41.96 
 
 
1027 aa  685    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0322539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4893  error-prone DNA polymerase  60.13 
 
 
1087 aa  1256    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0740584 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1948  DNA polymerase III, alpha subunit  43.55 
 
 
1075 aa  655    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0828  DNA polymerase III, alpha subunit  43.99 
 
 
1023 aa  699    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2014  DNA polymerase III, alpha subunit  40.13 
 
 
1096 aa  659    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202336  normal  0.139953 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4053  DNA polymerase III, alpha subunit  41.49 
 
 
1116 aa  701    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0692  error-prone DNA polymerase  41.09 
 
 
1072 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310882  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3149  error-prone DNA polymerase  40.9 
 
 
1025 aa  672    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2248  DNA polymerase III, alpha subunit  43.49 
 
 
1133 aa  719    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.649933  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1970  DNA polymerase III, alpha subunit  41.81 
 
 
1049 aa  704    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6156  error-prone DNA polymerase  40.96 
 
 
1068 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80972  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3998  DNA polymerase III, alpha subunit  39.82 
 
 
1116 aa  640    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0463  DNA polymerase III, alpha subunit  41.53 
 
 
1044 aa  656    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2738  error-prone DNA polymerase  43.15 
 
 
1026 aa  709    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201336  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6269  DNA polymerase III, alpha subunit  41.54 
 
 
1049 aa  694    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338143  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5393  DNA polymerase III, alpha subunit  38.03 
 
 
1074 aa  682    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1331  DNA polymerase III, alpha subunit  40.94 
 
 
1049 aa  687    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235182  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3466  error-prone DNA polymerase  62.33 
 
 
1124 aa  1304    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14636  decreased coverage  0.00222326 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  40.37 
 
 
1109 aa  662    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279122 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2599  DNA polymerase III, alpha subunit  40.86 
 
 
1040 aa  679    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6769  DNA polymerase III, alpha subunit  41.46 
 
 
1049 aa  667    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2336  DNA polymerase III, alpha subunit  43.33 
 
 
1142 aa  721    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479232  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1612  DNA polymerase III, alpha subunit  50.13 
 
 
1132 aa  669    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.929723  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1210  error-prone DNA polymerase  59.6 
 
 
1099 aa  1258    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0855057 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0527  error-prone DNA polymerase  41.09 
 
 
1072 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2287  DNA polymerase III, alpha subunit  54.96 
 
 
1194 aa  1154    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361309  normal  0.995988 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2380  error-prone DNA polymerase  40.62 
 
 
1036 aa  657    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106216  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1558  DNA polymerase III, alpha subunit  38.86 
 
 
1097 aa  676    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1227  DNA polymerase III, alpha subunit  41.41 
 
 
1084 aa  678    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1028  pantoate-beta-alanine ligase  37.65 
 
 
1029 aa  651    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1733  error-prone DNA polymerase  39.55 
 
 
1112 aa  651    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.647587  hitchhiker  0.00382273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2388  DNA polymerase III, alpha subunit  39.8 
 
 
1068 aa  639    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743991  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2294  DNA polymerase III alpha chain  36.92 
 
 
1097 aa  642    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5159  DNA polymerase III, alpha subunit  37.48 
 
 
1087 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.572913  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1903  error-prone DNA polymerase  39.78 
 
 
1110 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.989909  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0114  error-prone DNA polymerase  40.85 
 
 
1063 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0202  DNA polymerase III, alpha subunit  41.17 
 
 
1043 aa  679    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0663239 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3765  DNA polymerase III, alpha subunit  40.53 
 
 
1087 aa  706    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5036  DNA polymerase III, alpha subunit  40.11 
 
 
1071 aa  652    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.38358  normal  0.080697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2598  error-prone DNA polymerase  42.69 
 
 
1026 aa  717    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254359  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1546  DNA polymerase III, alpha subunit  41.12 
 
 
1020 aa  655    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297592 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4047  DNA polymerase III, alpha subunit  41.39 
 
 
1070 aa  723    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0175  DNA polymerase III, alpha subunit  39.46 
 
 
1126 aa  635    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1071  DNA polymerase III, alpha subunit  40.37 
 
 
1145 aa  678    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049044 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1611  DNA polymerase III, alpha subunit  53.83 
 
 
1053 aa  998    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2213  error-prone DNA polymerase  41 
 
 
1071 aa  638    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271039  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1183  error-prone DNA polymerase  59.69 
 
 
1099 aa  1259    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4461  DNA polymerase III, alpha subunit  38.36 
 
 
1117 aa  644    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5201  DNA polymerase III, alpha subunit  39.09 
 
 
1053 aa  639    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0149235  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0619  DNA polymerase III, alpha subunit  41.05 
 
 
1033 aa  708    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.130808 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1767  DNA polymerase III, alpha subunit  42.31 
 
 
1061 aa  663    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3809  DNA polymerase III, alpha subunit  40.7 
 
 
1096 aa  680    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.595243  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2744  error-prone DNA polymerase  40.83 
 
 
1071 aa  637    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13406  error-prone DNA polymerase  60.9 
 
 
1079 aa  1235    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0998493  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1175  DNA polymerase III, alpha subunit  43.23 
 
 
1025 aa  695    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286001  normal  0.0989959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3239  error-prone DNA polymerase  61.8 
 
 
1124 aa  1309    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.023295  normal  0.114564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4496  DNA polymerase III, alpha subunit  41.74 
 
 
1075 aa  672    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964877  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2200  DNA polymerase III, alpha subunit  50.32 
 
 
1197 aa  641    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.846036  normal  0.413997 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1831  DNA polymerase III, alpha subunit  43.52 
 
 
1093 aa  719    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.715135  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1871  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  41.12 
 
 
1015 aa  654    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55610  error-prone DNA polymerase  42.74 
 
 
1031 aa  701    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0362545 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2826  error-prone DNA polymerase  41 
 
 
1071 aa  638    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27708  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6832  DNA polymerase III, alpha subunit  41.84 
 
 
961 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.905572  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6871  DNA polymerase III, alpha subunit  41.92 
 
 
1049 aa  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5240  DNA polymerase III, alpha subunit  53.8 
 
 
1127 aa  1097    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104039  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2902  error-prone DNA polymerase  40.85 
 
 
1063 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0079  error-prone DNA polymerase  39.72 
 
 
1077 aa  670    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0995  error-prone DNA polymerase  100 
 
 
1090 aa  2195    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4841  error-prone DNA polymerase  42.72 
 
 
1024 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2398  DNA polymerase III, alpha subunit  39.26 
 
 
1045 aa  697    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.800911 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4291  DNA polymerase III, alpha subunit  40 
 
 
1077 aa  666    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271094  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1897  error-prone DNA polymerase  55.38 
 
 
1145 aa  1157    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211762  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2345  DNA polymerase III, alpha subunit  39.14 
 
 
1076 aa  697    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.818037  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5157  DNA polymerase III, alpha subunit  40.48 
 
 
1072 aa  660    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1200  error-prone DNA polymerase  59.69 
 
 
1099 aa  1259    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1530  error-prone DNA polymerase  60.62 
 
 
1098 aa  1280    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.94615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4576  DNA polymerase III, alpha subunit  40.49 
 
 
1071 aa  655    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.427966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0973  DNA polymerase III, alpha subunit  39.98 
 
 
1039 aa  662    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.309607  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5094  DNA polymerase III, alpha subunit  40.96 
 
 
1070 aa  637    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695828  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2802  DNA polymerase III, alpha subunit  39.55 
 
 
1090 aa  675    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.549156 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2672  DNA polymerase III, alpha subunit  42.88 
 
 
1076 aa  640    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.087577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2732  DNA polymerase III, alpha subunit  43.03 
 
 
1044 aa  698    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.421518  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4896  DNA polymerase III, alpha subunit  41.71 
 
 
1041 aa  658    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71874  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1967  DNA polymerase III, alpha subunit  42.46 
 
 
1064 aa  657    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785197  normal  0.846182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>