More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0974 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0974  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 230 aa  449  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0177058  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.5 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0180181  normal  0.277757 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.22 
 
 		 251 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1729  short chain dehydrogenase  57.14 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7025  short chain dehydrogenase  51.75 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39280  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6051  short chain dehydrogenase  50.68 
 
 		 221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0202908  normal  0.993323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1778  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  52.44 
 
 		 228 aa  194  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0854  short chain dehydrogenase  49.33 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.24 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91873  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.67 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.14 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25540  short-chain alcohol dehydrogenase  46.7 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.25 
 
 		 231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5763  short chain dehydrogenase  47.3 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5387  short chain dehydrogenase  47.3 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5476  short chain dehydrogenase  47.3 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0679291  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.99 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 280 aa  125  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00230  short-chain alcohol dehydrogenase  44.34 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3934  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  0.058004 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.96 
 
 		 243 aa  105  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 260 aa  104  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00917144  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.65 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.162957 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7375  ribitol 2-dehydrogenase  35.65 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  32.05 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 		 305 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0783167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.28 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 		 264 aa  99.4  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3704  ribitol 2-dehydrogenase  34.89 
 
 		 242 aa  98.6  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0194179  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.87 
 
 		 239 aa  98.2  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 		 245 aa  98.2  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.89 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.432228  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  31.2 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.71 
 
 		 291 aa  97.1  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 284 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4057  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.25 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.88898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 284 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 		 260 aa  95.9  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.563613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 		 237 aa  95.5  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 		 244 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 		 253 aa  94.7  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.01 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0571  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.64 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.653945  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  33.6 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0389  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 		 270 aa  93.6  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10780  short chain dehydrogenase  32.13 
 
 		 275 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 		 263 aa  93.2  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.196422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  31.14 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.73 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.82 
 
 		 257 aa  92.8  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0323  clavaldehyde dehydrogenase  31.91 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.869868 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 314 aa  92.8  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 		 243 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138701 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  37.99 
 
 		 279 aa  92  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 		 256 aa  92  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0274  short chain dehydrogenase/reductase family protein  35.62 
 
 		 259 aa  92.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0676  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.96 
 
 		 253 aa  92  7e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.153885 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1991  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 242 aa  92  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 		 242 aa  92  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.07 
 
 		 249 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 		 239 aa  91.7  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 		 245 aa  92  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  30.7 
 
 		 242 aa  91.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0458  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.64 
 
 		 245 aa  91.7  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.03 
 
 		 261 aa  91.7  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 230 aa  91.7  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224966  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.64 
 
 		 245 aa  91.7  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.82564  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.9 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 		 246 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 244 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1571  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  28.09 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 		 244 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.27 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 		 275 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  32.29 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37020  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  40.11 
 
 		 279 aa  90.5  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 		 268 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.48902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>