More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_6051 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_6051  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 221 aa  435  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0202908  normal  0.993323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0854  short chain dehydrogenase  91.36 
 
 		 225 aa  401  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5763  short chain dehydrogenase  82.43 
 
 		 222 aa  333  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5387  short chain dehydrogenase  82.43 
 
 		 222 aa  333  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5476  short chain dehydrogenase  82.43 
 
 		 222 aa  333  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0679291  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.36 
 
 		 226 aa  246  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.64 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.39 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0180181  normal  0.277757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7025  short chain dehydrogenase  52.49 
 
 		 229 aa  208  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39280  short chain dehydrogenase  50.22 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1778  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  53.18 
 
 		 228 aa  197  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0974  short chain dehydrogenase  50.68 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0177058  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 		 251 aa  190  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.27 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91873  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25540  short-chain alcohol dehydrogenase  43.36 
 
 		 255 aa  151  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1729  short chain dehydrogenase  43.64 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.81 
 
 		 254 aa  124  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 		 261 aa  118  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 293 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  0.058004 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3934  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 		 242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  34.21 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  34.21 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  35.65 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 		 248 aa  108  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  35.59 
 
 		 1270 aa  108  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 		 264 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 		 282 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.31881  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02630  short-chain alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 		 281 aa  104  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.39 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0818  short chain dehydrogenase  34.36 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.65 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 		 253 aa  101  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000671935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0091  putative serine dehydrogenase  32.92 
 
 		 252 aa  101  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.81 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  32.28 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.17 
 
 		 247 aa  99.4  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2400  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 253 aa  99  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 		 230 aa  98.6  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224966  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  32.62 
 
 		 252 aa  98.2  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.03 
 
 		 264 aa  98.2  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 270 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 		 295 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0977  NADP-dependent l-serine/l-allo-threonine dehydrogenase ydfg  30.34 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.616956  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.91 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 		 246 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 		 248 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  38.07 
 
 		 279 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 		 264 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10492  short-chain type oxidoreductase  32.61 
 
 		 251 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 		 247 aa  95.9  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  37.16 
 
 		 270 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.43 
 
 		 238 aa  95.5  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 		 266 aa  95.5  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  0.000000000383418 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 256 aa  95.9  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 		 277 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000182624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 263 aa  95.5  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.196422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 		 250 aa  95.5  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 281 aa  95.1  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0733  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 243 aa  95.1  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  38.2 
 
 		 270 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.68 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.33 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  39.34 
 
 		 276 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  31.5 
 
 		 295 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.95 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.81 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00230  short-chain alcohol dehydrogenase  35.81 
 
 		 223 aa  93.2  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 		 240 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 269 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 262 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.95 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  38.12 
 
 		 276 aa  93.6  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 		 256 aa  94  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0571  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.48 
 
 		 245 aa  92.8  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.653945  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0323  clavaldehyde dehydrogenase  30 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.869868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  38.27 
 
 		 279 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>