More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00230 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00230  short-chain alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 223 aa  433  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1729  short chain dehydrogenase  43.38 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39280  short chain dehydrogenase  43.69 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25540  short-chain alcohol dehydrogenase  44.2 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0974  short chain dehydrogenase  44.34 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0177058  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.27 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0180181  normal  0.277757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.56 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.73 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91873  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7025  short chain dehydrogenase  40.97 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1778  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  44.25 
 
 		 228 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 		 241 aa  105  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  34.1 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3934  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05991  short chain dehydrogenase  28.63 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  34.1 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05611  short chain dehydrogenase  25.75 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.713488  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 		 266 aa  101  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6051  short chain dehydrogenase  35.81 
 
 		 221 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0202908  normal  0.993323 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09810  short-chain alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0913042  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05911  short chain dehydrogenase  26.5 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 		 250 aa  98.6  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 233 aa  98.6  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.89 
 
 		 230 aa  98.2  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1309  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.86 
 
 		 236 aa  96.7  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 		 285 aa  96.3  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.209414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0854  short chain dehydrogenase  35.65 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 		 252 aa  96.3  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 		 244 aa  95.5  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.14 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 251 aa  95.5  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 		 244 aa  95.5  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0960196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 		 250 aa  95.5  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.13 
 
 		 264 aa  95.1  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6322  putative short-chain dehydrogenase  33.51 
 
 		 252 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72840  putative short-chain dehydrogenase  33.51 
 
 		 252 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  31.48 
 
 		 241 aa  95.1  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 248 aa  94.7  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.057049  hitchhiker  0.000702749 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.51 
 
 		 269 aa  94.7  9e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.69 
 
 		 264 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  29.69 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.09 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3784  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0333055  hitchhiker  0.00262398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224966  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000709968  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.61 
 
 		 264 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.56 
 
 		 291 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.526015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.56 
 
 		 291 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389698  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.56 
 
 		 291 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0648553 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.26 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 		 231 aa  92.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  39.66 
 
 		 275 aa  92.8  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.26 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0535  short chain dehydrogenase  25.32 
 
 		 244 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 		 231 aa  92.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.26 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.61 
 
 		 264 aa  92.4  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0169  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 		 289 aa  92  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.13 
 
 		 264 aa  92  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 263 aa  92  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188706  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.88 
 
 		 249 aa  91.7  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.956154 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.13 
 
 		 264 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1596  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 		 245 aa  91.7  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 		 257 aa  91.7  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 		 256 aa  90.9  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.76 
 
 		 264 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.62 
 
 		 265 aa  90.9  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 		 262 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09940  short-chain alcohol dehydrogenase  35 
 
 		 264 aa  90.1  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.920602  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 260 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.563613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914697  normal  0.657506 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.88847  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 250 aa  90.1  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 338 aa  90.1  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12520  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  37.22 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 		 273 aa  90.5  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 314 aa  89.4  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 278 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126746  normal  0.0331408 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  32.7 
 
 		 281 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4082  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.95 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.858342  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1414  short chain dehydrogenase  37.23 
 
 		 270 aa  89  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4364  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.05 
 
 		 256 aa  88.6  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 		 267 aa  88.6  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>