More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4604 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 232 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91873  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.48 
 
 		 231 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0974  short chain dehydrogenase  52.25 
 
 		 230 aa  197  7.999999999999999e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0177058  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 		 227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0180181  normal  0.277757 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39280  short chain dehydrogenase  50.45 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1729  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7025  short chain dehydrogenase  45.5 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6051  short chain dehydrogenase  45.05 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0202908  normal  0.993323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0854  short chain dehydrogenase  44.05 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25540  short-chain alcohol dehydrogenase  45.54 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1778  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  46.4 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.73 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 254 aa  134  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5763  short chain dehydrogenase  42.15 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5387  short chain dehydrogenase  42.15 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5476  short chain dehydrogenase  42.15 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0679291  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.16 
 
 		 280 aa  122  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3934  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00230  short-chain alcohol dehydrogenase  42.54 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  0.058004 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.9 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09810  short-chain alcohol dehydrogenase  36.64 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0913042  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 261 aa  105  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  33.19 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0679  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22723  normal  0.897045 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  33.05 
 
 		 1270 aa  99.8  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.57 
 
 		 250 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 		 252 aa  99.8  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.91 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 317 aa  99.8  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24130  short-chain alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 		 266 aa  99  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1596  short chain dehydrogenase  33.77 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  30 
 
 		 239 aa  97.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 		 270 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  34.24 
 
 		 276 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.33 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.33 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  29.34 
 
 		 239 aa  96.3  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 		 245 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23940  short-chain alcohol dehydrogenase  37.12 
 
 		 280 aa  96.3  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.393654  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 		 272 aa  96.3  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 314 aa  96.3  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 279 aa  96.3  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 252 aa  96.3  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0691773  normal  0.0221679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37020  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  36.16 
 
 		 279 aa  95.5  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.28 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1627  oxidoreductase  30.04 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.36 
 
 		 238 aa  95.1  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 270 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 252 aa  94.7  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2074  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.68 
 
 		 238 aa  94.7  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  32.96 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 338 aa  94  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 306 aa  93.6  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.88898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.406068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  35.45 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2069  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.73 
 
 		 243 aa  92.4  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10492  short-chain type oxidoreductase  36.73 
 
 		 251 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  30 
 
 		 275 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 		 272 aa  92.4  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 		 283 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820059  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 261 aa  92.4  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 		 249 aa  92.4  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 264 aa  92.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 		 242 aa  92.4  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.71 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.19 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 		 282 aa  92  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.36 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.78 
 
 		 254 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  32.26 
 
 		 276 aa  91.7  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.67 
 
 		 239 aa  91.7  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 		 254 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0091  putative serine dehydrogenase  29.24 
 
 		 252 aa  91.7  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.63 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  31.53 
 
 		 241 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7375  ribitol 2-dehydrogenase  29.52 
 
 		 242 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>