More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_25540 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_25540  short-chain alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 255 aa  496  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39280  short chain dehydrogenase  52.63 
 
 		 230 aa  206  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7025  short chain dehydrogenase  53.95 
 
 		 229 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.54 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0180181  normal  0.277757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1778  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  52.65 
 
 		 228 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0974  short chain dehydrogenase  46.7 
 
 		 230 aa  176  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0177058  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.44 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.46 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6051  short chain dehydrogenase  43.36 
 
 		 221 aa  158  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0202908  normal  0.993323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0854  short chain dehydrogenase  44 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.54 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91873  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1729  short chain dehydrogenase  43.95 
 
 		 227 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.33 
 
 		 231 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5763  short chain dehydrogenase  43.17 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5387  short chain dehydrogenase  43.17 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5476  short chain dehydrogenase  43.17 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0679291  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00230  short-chain alcohol dehydrogenase  44.2 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 		 254 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 		 280 aa  119  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37020  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  44.38 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3934  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 		 261 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.2 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4937  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.51 
 
 		 239 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1156  short chain dehydrogenase  36.6 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1270  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3160  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140307  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3022  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.515629  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 265 aa  99.4  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0206025  normal  0.910086 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1596  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 246 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.71 
 
 		 284 aa  99.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  32.62 
 
 		 241 aa  99  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 338 aa  98.2  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 		 282 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  33.6 
 
 		 1270 aa  96.7  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05911  short chain dehydrogenase  25.96 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  30.21 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 		 293 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  0.058004 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 		 241 aa  95.9  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 		 236 aa  95.5  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0563281  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.6 
 
 		 238 aa  95.1  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 317 aa  95.1  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.64 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0535  short chain dehydrogenase  28.07 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1121  short chain dehydrogenase  35.6 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0921359  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.78 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0324454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  30.67 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_002950  PG2069  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.2 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 		 252 aa  93.2  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0691773  normal  0.0221679 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  38.67 
 
 		 276 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1053  short chain dehydrogenase  36.46 
 
 		 258 aa  92.4  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05611  short chain dehydrogenase  25.88 
 
 		 244 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.713488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.11 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05381  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.85 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1049  short chain dehydrogenase  35.62 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20980  putative short chain dehydrogenas  39.47 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 		 291 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0664  cylG protein  29.35 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3194  short chain dehydrogenase  36.67 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234456  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.45 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 287 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.06 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.83 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.9 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 293 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8710  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity-like protein  35.56 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1820  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  35.36 
 
 		 276 aa  89.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 		 266 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4057  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.36 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 300 aa  89.4  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0898899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10780  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 		 275 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  40.34 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01319  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 		 275 aa  89  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 		 252 aa  89  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00800542  normal  0.26199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  38.95 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 		 265 aa  88.6  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>