More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1778 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1778  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  100 
 
 
228 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.11 
 
 
227 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0180181  normal  0.277757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7025  short chain dehydrogenase  67.86 
 
 
229 aa  284  7e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39280  short chain dehydrogenase  66.08 
 
 
230 aa  273  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.89 
 
 
226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.56 
 
 
225 aa  224  6e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0854  short chain dehydrogenase  54.02 
 
 
225 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6051  short chain dehydrogenase  53.18 
 
 
221 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0202908  normal  0.993323 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0974  short chain dehydrogenase  52.44 
 
 
230 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0177058  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 
251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5387  short chain dehydrogenase  53.85 
 
 
222 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5476  short chain dehydrogenase  53.85 
 
 
222 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0679291  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5763  short chain dehydrogenase  53.85 
 
 
222 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25540  short-chain alcohol dehydrogenase  52.65 
 
 
255 aa  177  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.76 
 
 
232 aa  159  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91873  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1729  short chain dehydrogenase  42.92 
 
 
227 aa  148  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.26 
 
 
231 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
280 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
254 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00230  short-chain alcohol dehydrogenase  44.25 
 
 
223 aa  109  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 
246 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
250 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 
244 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09357  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02370)  34.52 
 
 
258 aa  102  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00364064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  31.8 
 
 
236 aa  102  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
252 aa  99  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0530  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 
248 aa  98.6  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 
244 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
234 aa  95.9  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  31.06 
 
 
241 aa  95.5  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.84 
 
 
238 aa  95.9  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
261 aa  95.5  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  35.5 
 
 
245 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37020  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  40 
 
 
279 aa  95.1  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  32.9 
 
 
239 aa  95.1  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
240 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
254 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.64 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  31.36 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.74 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  31.36 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.78 
 
 
243 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
240 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0323  clavaldehyde dehydrogenase  32.03 
 
 
245 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.869868 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06330  oxidoreductase  28.81 
 
 
243 aa  92.8  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.646831  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  32.44 
 
 
268 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3934  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
248 aa  92.8  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
248 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61312  predicted protein  30.96 
 
 
253 aa  92.4  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243713  normal  0.492851 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  32.9 
 
 
239 aa  92  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
240 aa  91.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  normal  0.85584 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  33.47 
 
 
1270 aa  91.3  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 
241 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  35.03 
 
 
270 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.82 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.67 
 
 
272 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  33.05 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
264 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.7 
 
 
239 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05381  short chain dehydrogenase  29.36 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.7 
 
 
239 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0112  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
244 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.7 
 
 
239 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.7 
 
 
239 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.7 
 
 
239 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.7 
 
 
242 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.7 
 
 
242 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.7 
 
 
242 aa  89.4  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.7 
 
 
242 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1049  short chain dehydrogenase  34.67 
 
 
272 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.7 
 
 
242 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.91 
 
 
239 aa  89.4  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07831  short chain dehydrogenase  29.79 
 
 
241 aa  89.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.956383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 
278 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0125509  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
245 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3961  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
236 aa  89  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  35.87 
 
 
276 aa  88.6  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 
243 aa  88.6  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
251 aa  88.2  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295469  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 
269 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
263 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.196422  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  35.39 
 
 
279 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.34 
 
 
239 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
260 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 
252 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 
259 aa  87  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>