More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4205 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.42 
 
 		 226 aa  265  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7025  short chain dehydrogenase  60.54 
 
 		 229 aa  245  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0854  short chain dehydrogenase  55.71 
 
 		 225 aa  235  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.21 
 
 		 227 aa  232  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0180181  normal  0.277757 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6051  short chain dehydrogenase  53.64 
 
 		 221 aa  230  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0202908  normal  0.993323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1778  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  56.56 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39280  short chain dehydrogenase  52.68 
 
 		 230 aa  208  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5387  short chain dehydrogenase  54.3 
 
 		 222 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5476  short chain dehydrogenase  54.3 
 
 		 222 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0679291  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5763  short chain dehydrogenase  54.3 
 
 		 222 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 251 aa  182  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0974  short chain dehydrogenase  44.14 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0177058  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1729  short chain dehydrogenase  44.34 
 
 		 227 aa  164  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25540  short-chain alcohol dehydrogenase  48.46 
 
 		 255 aa  161  7e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.78 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91873  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.28 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 242 aa  124  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  34.04 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.24 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.48 
 
 		 264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3934  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 		 261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.71 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 		 248 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.04 
 
 		 264 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 241 aa  111  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.04 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.04 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.04 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  31.49 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.6 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.04 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  34.19 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  31.06 
 
 		 242 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.04 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  37.02 
 
 		 245 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 		 282 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  32.6 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 		 244 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  35.34 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.99 
 
 		 261 aa  108  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0323  clavaldehyde dehydrogenase  32.61 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.869868 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.52 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224966  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06330  oxidoreductase  29.29 
 
 		 243 aa  106  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.646831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.19 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.04 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02630  short-chain alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 		 293 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  0.058004 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 259 aa  105  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.16 
 
 		 241 aa  105  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 		 264 aa  104  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.89 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.57 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.31881  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8710  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity-like protein  38 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00230  short-chain alcohol dehydrogenase  39.73 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61312  predicted protein  30.36 
 
 		 253 aa  102  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243713  normal  0.492851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  32.08 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4937  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.21 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0112  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  32.05 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05381  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3168  short chain dehydrogenase  40.43 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.273274  normal  0.685188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 250 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 253 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 		 252 aa  101  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0691773  normal  0.0221679 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.13 
 
 		 246 aa  101  9e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126746  normal  0.0331408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1192  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.96 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>