More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02630 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_02630  short-chain alcohol dehydrogenase  100 
 
 
243 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.38 
 
 
243 aa  361  5.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.33 
 
 
259 aa  341  5e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.94 
 
 
252 aa  323  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.2 
 
 
252 aa  318  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10492  short-chain type oxidoreductase  66.53 
 
 
251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.29 
 
 
251 aa  311  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.29 
 
 
251 aa  311  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60736  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.29 
 
 
251 aa  311  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.78 
 
 
250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.23 
 
 
255 aa  278  6e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.2 
 
 
248 aa  265  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.51 
 
 
254 aa  258  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  53.09 
 
 
245 aa  251  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.96 
 
 
248 aa  248  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.78 
 
 
254 aa  248  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.44 
 
 
251 aa  246  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295469  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.2 
 
 
261 aa  239  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.41 
 
 
261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.76 
 
 
227 aa  238  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0791624  normal  0.128025 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.39 
 
 
254 aa  238  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.42 
 
 
250 aa  236  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23940  short-chain alcohol dehydrogenase  53.31 
 
 
280 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.393654  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2571  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.85 
 
 
252 aa  230  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.83336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.43 
 
 
257 aa  228  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
261 aa  223  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.43 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.43 
 
 
254 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2400  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.58 
 
 
253 aa  215  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.85 
 
 
253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.659943  normal  0.282121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.87 
 
 
264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24130  short-chain alcohol dehydrogenase  47.54 
 
 
266 aa  209  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 
249 aa  206  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
253 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000671935 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
257 aa  203  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09810  short-chain alcohol dehydrogenase  47.76 
 
 
261 aa  201  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0913042  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2127  Serine 3-dehydrogenase  44.58 
 
 
255 aa  198  7e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.247906  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
250 aa  193  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1841  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.95 
 
 
250 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
254 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495407 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09940  short-chain alcohol dehydrogenase  47.01 
 
 
264 aa  186  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.920602  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 
248 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0676  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.59 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.153885 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  40.71 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0362  hypothetical protein  40.48 
 
 
257 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
250 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
254 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00727999  normal  0.180483 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0091  putative serine dehydrogenase  38.55 
 
 
252 aa  179  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2450  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
248 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1696  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.1 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.817291  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
252 aa  179  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
248 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1378  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.03 
 
 
248 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73447  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
248 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
248 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
248 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295991  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
248 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0197  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.2 
 
 
254 aa  175  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3236  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.67 
 
 
248 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.964469  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1944  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.67 
 
 
248 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2076  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.67 
 
 
248 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3251  putative short-chain dehydrogenase  44.67 
 
 
248 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3198  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.67 
 
 
248 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0832  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.67 
 
 
248 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2666  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.67 
 
 
248 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99175  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
248 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445367  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
248 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467056  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3894  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
248 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
258 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0189644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
253 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
256 aa  169  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292404 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05450  oxidoreductase, putative  39.61 
 
 
304 aa  169  4e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
252 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01250  short-chain dehydrogenase, putative  41.98 
 
 
282 aa  169  5e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
256 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.565969  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80053  NADP(+)-dependent dehydrogenase acts on serine, L-allo-threonine, and other 3-hydroxy acids  37.89 
 
 
269 aa  167  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00179  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G11240)  38.76 
 
 
313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.983253  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
253 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
254 aa  165  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00671569  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2351  3-hydroxy acid dehydrogenase  40.57 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11526  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00618  conserved hypothetical protein  37.55 
 
 
268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.767704 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64840  putative short-chain dehydrogenase  38.65 
 
 
253 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000142595  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5631  putative short-chain dehydrogenase  38.65 
 
 
253 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
252 aa  161  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0691773  normal  0.0221679 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2050  3-hydroxy acid dehydrogenase  40.16 
 
 
249 aa  161  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
250 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241835 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0971  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.55 
 
 
248 aa  160  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
251 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0363598  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0977  NADP-dependent l-serine/l-allo-threonine dehydrogenase ydfg  36.33 
 
 
248 aa  160  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.616956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
254 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
250 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3915  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
248 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
254 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
257 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.197802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>