More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0802 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
259 aa  518  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10492  short-chain type oxidoreductase  71.25 
 
 
251 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.94 
 
 
251 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.94 
 
 
251 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60736  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.94 
 
 
251 aa  329  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.14 
 
 
252 aa  328  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02630  short-chain alcohol dehydrogenase  69.33 
 
 
243 aa  327  8e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.09 
 
 
243 aa  327  9e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.67 
 
 
252 aa  326  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.34 
 
 
250 aa  279  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.58 
 
 
248 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.89 
 
 
255 aa  265  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.68 
 
 
248 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  55.7 
 
 
245 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.17 
 
 
254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.1 
 
 
261 aa  245  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.51 
 
 
254 aa  245  6.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.38 
 
 
254 aa  241  9e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.24 
 
 
261 aa  236  4e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.1 
 
 
250 aa  229  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.8 
 
 
251 aa  229  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295469  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.65 
 
 
262 aa  227  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23940  short-chain alcohol dehydrogenase  54.66 
 
 
280 aa  225  7e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.393654  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2571  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.12 
 
 
252 aa  218  7.999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.83336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.53 
 
 
254 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24130  short-chain alcohol dehydrogenase  52.34 
 
 
266 aa  216  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.39 
 
 
264 aa  208  6e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.25 
 
 
253 aa  208  8e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.659943  normal  0.282121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
257 aa  206  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.07 
 
 
227 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0791624  normal  0.128025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
253 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000671935 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09810  short-chain alcohol dehydrogenase  48.13 
 
 
261 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0913042  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.53 
 
 
261 aa  203  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2400  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2127  Serine 3-dehydrogenase  44.54 
 
 
255 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.247906  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 
250 aa  193  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0676  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.56 
 
 
253 aa  192  3e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.153885 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
257 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.64 
 
 
254 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00727999  normal  0.180483 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  40.32 
 
 
257 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0362  hypothetical protein  39.92 
 
 
257 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
254 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495407 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09940  short-chain alcohol dehydrogenase  44.71 
 
 
264 aa  186  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.920602  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
252 aa  185  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1841  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.93 
 
 
250 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2450  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
248 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
258 aa  178  9e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0189644  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  38.21 
 
 
258 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
250 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0091  putative serine dehydrogenase  40.42 
 
 
252 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
248 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
248 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
250 aa  175  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 
251 aa  175  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00179  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G11240)  43.03 
 
 
313 aa  174  9e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.983253  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295991  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.565969  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1378  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.7 
 
 
248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73447  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3198  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.11 
 
 
248 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
252 aa  172  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2076  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.11 
 
 
248 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3251  putative short-chain dehydrogenase  42.11 
 
 
248 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3236  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.11 
 
 
248 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.964469  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1944  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.11 
 
 
248 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1696  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.8 
 
 
258 aa  172  5e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.817291  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0832  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.11 
 
 
248 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2666  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.11 
 
 
248 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99175  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 
253 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01250  short-chain dehydrogenase, putative  41.08 
 
 
282 aa  171  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.32 
 
 
253 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
254 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00671569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
256 aa  168  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292404 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0197  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.06 
 
 
254 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
248 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445367  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
250 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3894  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
248 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0557  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000797066  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 
251 aa  166  4e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0363598  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4862  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.24 
 
 
254 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000522303  unclonable  0.000000385865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.24 
 
 
254 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000261149  unclonable  0.000000000503217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
254 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.24 
 
 
255 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155421  hitchhiker  0.00000000000159857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0679  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22723  normal  0.897045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
255 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000309791  hitchhiker  0.00252207 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1864  3-hydroxy acid dehydrogenase  38.87 
 
 
249 aa  165  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.612513  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1976  3-hydroxy acid dehydrogenase  38.87 
 
 
249 aa  165  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02915  serine 3-dehydrogenase  40.5 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0730  oxidoreductase protein  41.37 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00618  conserved hypothetical protein  40.94 
 
 
268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.767704 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05450  oxidoreductase, putative  39.92 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64840  putative short-chain dehydrogenase  39.34 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000142595  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4914  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  39.17 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0602  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.17 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0114024  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5631  putative short-chain dehydrogenase  39.34 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>