More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5952 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
250 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.28 
 
 
254 aa  332  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.88 
 
 
254 aa  330  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.66 
 
 
250 aa  310  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.9 
 
 
248 aa  310  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  61.85 
 
 
245 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.31 
 
 
254 aa  290  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.75 
 
 
261 aa  286  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.02 
 
 
255 aa  280  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.45 
 
 
248 aa  280  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23940  short-chain alcohol dehydrogenase  59.84 
 
 
280 aa  271  8.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.393654  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2571  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.67 
 
 
252 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.83336 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09810  short-chain alcohol dehydrogenase  55.92 
 
 
261 aa  251  7e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0913042  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10492  short-chain type oxidoreductase  56.43 
 
 
251 aa  249  4e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.1 
 
 
253 aa  246  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000671935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.03 
 
 
243 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2400  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.21 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24130  short-chain alcohol dehydrogenase  57.02 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.38 
 
 
262 aa  242  3e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.08 
 
 
253 aa  240  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.659943  normal  0.282121 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.1 
 
 
259 aa  240  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02630  short-chain alcohol dehydrogenase  55.42 
 
 
243 aa  240  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.19 
 
 
252 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.81 
 
 
252 aa  235  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.74 
 
 
251 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.74 
 
 
251 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60736  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.33 
 
 
251 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.06 
 
 
264 aa  227  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09940  short-chain alcohol dehydrogenase  52.8 
 
 
264 aa  222  3e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.920602  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.07 
 
 
227 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0791624  normal  0.128025 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.2 
 
 
261 aa  206  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 
251 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295469  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1378  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.2 
 
 
248 aa  185  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73447  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2127  Serine 3-dehydrogenase  44 
 
 
255 aa  185  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.247906  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.6 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445367  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
248 aa  181  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.8 
 
 
248 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295991  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
248 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.8 
 
 
248 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.8 
 
 
248 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2450  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
248 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2076  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.16 
 
 
248 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3251  putative short-chain dehydrogenase  45.16 
 
 
248 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1944  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.16 
 
 
248 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3198  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.16 
 
 
248 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3236  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.16 
 
 
248 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.964469  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0832  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.16 
 
 
248 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2666  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.16 
 
 
248 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99175  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
249 aa  179  4.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3894  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
248 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0091  putative serine dehydrogenase  39.75 
 
 
252 aa  176  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1976  3-hydroxy acid dehydrogenase  42 
 
 
249 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1864  3-hydroxy acid dehydrogenase  42 
 
 
249 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.612513  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
248 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467056  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.26 
 
 
252 aa  171  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0691773  normal  0.0221679 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
261 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
251 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2050  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.36 
 
 
249 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01250  short-chain dehydrogenase, putative  40.44 
 
 
282 aa  168  7e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0676  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.43 
 
 
253 aa  167  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.153885 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2351  3-hydroxy acid dehydrogenase  38.55 
 
 
249 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11526  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
256 aa  166  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1841  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.71 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0679  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22723  normal  0.897045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 
254 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00727999  normal  0.180483 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 
250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1939  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.04 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
250 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2155  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.44 
 
 
248 aa  162  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000180953  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1614  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.84 
 
 
248 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.594866  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1660  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.84 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00687336  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1682  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.84 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97667  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1826  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.84 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0315451  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1623  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.84 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01498  L-allo-threonine dehydrogenase, NAD(P)-binding  39.04 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000675994  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000149507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0488  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.91 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.596302  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1748  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.04 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124318  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01509  hypothetical protein  39.04 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000865743  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1626  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.04 
 
 
248 aa  162  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000177661  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5631  putative short-chain dehydrogenase  39.92 
 
 
253 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2290  3-hydroxy acid dehydrogenase  38.31 
 
 
249 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2130  3-hydroxy acid dehydrogenase  38.91 
 
 
249 aa  161  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1629  3-hydroxy acid dehydrogenase  38.65 
 
 
248 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.5514199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2119  3-hydroxy acid dehydrogenase  38.65 
 
 
248 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000142813  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1968  glucose/ribitol dehydrogenase  39.33 
 
 
250 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
253 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64840  putative short-chain dehydrogenase  39.53 
 
 
253 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000142595  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1701  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.04 
 
 
248 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649919  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
256 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.565969  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 
250 aa  159  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0530041  hitchhiker  0.00231678 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1696  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.04 
 
 
258 aa  159  6e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.817291  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  34.11 
 
 
257 aa  158  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>