More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0668 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
251 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
251 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60736  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  99.6 
 
 
251 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.85 
 
 
252 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.8 
 
 
252 aa  434  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10492  short-chain type oxidoreductase  76.95 
 
 
251 aa  377  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.24 
 
 
259 aa  337  8e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.03 
 
 
243 aa  315  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02630  short-chain alcohol dehydrogenase  65.29 
 
 
243 aa  305  6e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.03 
 
 
250 aa  280  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  57.38 
 
 
245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.35 
 
 
248 aa  263  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.32 
 
 
255 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.96 
 
 
248 aa  245  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.19 
 
 
254 aa  238  9e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.62 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.73 
 
 
254 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.74 
 
 
250 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.82 
 
 
254 aa  225  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23940  short-chain alcohol dehydrogenase  53.39 
 
 
280 aa  218  7.999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.393654  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2571  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.22 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.83336 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24130  short-chain alcohol dehydrogenase  50.84 
 
 
266 aa  211  9e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.78 
 
 
253 aa  209  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000671935 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.46 
 
 
262 aa  208  5e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.6 
 
 
253 aa  208  6e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.659943  normal  0.282121 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.47 
 
 
261 aa  204  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.8 
 
 
227 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0791624  normal  0.128025 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09810  short-chain alcohol dehydrogenase  47.56 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0913042  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2400  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.44 
 
 
250 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
251 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
257 aa  192  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.2 
 
 
264 aa  191  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 
254 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
254 aa  186  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495407 
 
 
-
 
NC_002950  PG0676  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.24 
 
 
253 aa  181  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.153885 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
256 aa  178  7e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  36.61 
 
 
257 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2127  Serine 3-dehydrogenase  42.98 
 
 
255 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.247906  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0362  hypothetical protein  36.22 
 
 
257 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.04 
 
 
254 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00727999  normal  0.180483 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
253 aa  175  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0091  putative serine dehydrogenase  38.84 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09940  short-chain alcohol dehydrogenase  45.2 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.920602  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2450  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.04 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0197  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.81 
 
 
254 aa  171  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
248 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1378  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.77 
 
 
248 aa  169  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73447  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1841  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41 
 
 
250 aa  169  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.1 
 
 
251 aa  169  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 
250 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
252 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
250 aa  166  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3894  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 
248 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 
248 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445367  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01250  short-chain dehydrogenase, putative  41.22 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
258 aa  165  5e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0189644  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  36.78 
 
 
258 aa  165  5e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.35 
 
 
248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.35 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295991  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2076  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.24 
 
 
248 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1696  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.4 
 
 
258 aa  161  7e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.817291  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3251  putative short-chain dehydrogenase  39.24 
 
 
248 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1944  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.24 
 
 
248 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0832  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.24 
 
 
248 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2666  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.24 
 
 
248 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3198  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.24 
 
 
248 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3236  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.24 
 
 
248 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.964469  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 
251 aa  161  8.000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0363598  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1614  3-hydroxy acid dehydrogenase  38.82 
 
 
248 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.594866  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1660  3-hydroxy acid dehydrogenase  38.82 
 
 
248 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00687336  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1682  3-hydroxy acid dehydrogenase  38.82 
 
 
248 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97667  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1623  3-hydroxy acid dehydrogenase  38.82 
 
 
248 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1826  3-hydroxy acid dehydrogenase  38.82 
 
 
248 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0315451  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.35 
 
 
248 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
252 aa  159  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
256 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2155  3-hydroxy acid dehydrogenase  36.29 
 
 
248 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000180953  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01498  L-allo-threonine dehydrogenase, NAD(P)-binding  35.86 
 
 
248 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000675994  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
248 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000149507  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
248 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467056  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1748  3-hydroxy acid dehydrogenase  35.86 
 
 
248 aa  155  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124318  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1701  3-hydroxy acid dehydrogenase  35.86 
 
 
248 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649919  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1976  3-hydroxy acid dehydrogenase  37.55 
 
 
249 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01509  hypothetical protein  35.86 
 
 
248 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000865743  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1864  3-hydroxy acid dehydrogenase  37.55 
 
 
249 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.612513  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
250 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02915  serine 3-dehydrogenase  38.24 
 
 
251 aa  155  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0679  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
250 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22723  normal  0.897045 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1626  3-hydroxy acid dehydrogenase  35.86 
 
 
248 aa  155  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000177661  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1629  3-hydroxy acid dehydrogenase  35.44 
 
 
248 aa  155  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.5514199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
257 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.197802 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2119  3-hydroxy acid dehydrogenase  35.44 
 
 
248 aa  155  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000142813  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 
254 aa  154  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00671569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>