More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2571 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2571  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
252 aa  489  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.83336 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23940  short-chain alcohol dehydrogenase  70.49 
 
 
280 aa  323  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.393654  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.33 
 
 
253 aa  297  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.659943  normal  0.282121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24130  short-chain alcohol dehydrogenase  60.49 
 
 
266 aa  275  7e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.89 
 
 
254 aa  261  8e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.77 
 
 
254 aa  257  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2400  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.58 
 
 
253 aa  254  9e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.77 
 
 
254 aa  252  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.82 
 
 
264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.38 
 
 
250 aa  250  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
248 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.67 
 
 
250 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.66 
 
 
253 aa  249  4e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000671935 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.92 
 
 
248 aa  246  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  54.73 
 
 
245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.2 
 
 
261 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09810  short-chain alcohol dehydrogenase  54 
 
 
261 aa  240  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0913042  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.39 
 
 
255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10492  short-chain type oxidoreductase  56.36 
 
 
251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02630  short-chain alcohol dehydrogenase  52.85 
 
 
243 aa  219  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.12 
 
 
259 aa  218  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.36 
 
 
243 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09940  short-chain alcohol dehydrogenase  50.2 
 
 
264 aa  209  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.920602  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.69 
 
 
252 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.81 
 
 
251 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.81 
 
 
251 aa  208  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.81 
 
 
251 aa  208  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60736  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
252 aa  208  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.51 
 
 
227 aa  202  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0791624  normal  0.128025 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.74 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 
261 aa  188  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
257 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.51 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2450  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.04 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.51 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.51 
 
 
248 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.12 
 
 
248 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1378  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.1 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73447  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0091  putative serine dehydrogenase  37.66 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 
248 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295991  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2076  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.92 
 
 
248 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3251  putative short-chain dehydrogenase  42.92 
 
 
248 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0832  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.92 
 
 
248 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2666  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.92 
 
 
248 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3198  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.92 
 
 
248 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3236  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.92 
 
 
248 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.964469  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1944  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.92 
 
 
248 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.77 
 
 
254 aa  158  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00727999  normal  0.180483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2127  Serine 3-dehydrogenase  39.51 
 
 
255 aa  158  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.247906  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3894  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.51 
 
 
248 aa  158  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
249 aa  158  9e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 
248 aa  158  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445367  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05450  oxidoreductase, putative  38.28 
 
 
304 aa  157  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 
258 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
254 aa  155  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495407 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
256 aa  155  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 
248 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.17 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1696  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.14 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.817291  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
257 aa  152  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
253 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
252 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.77 
 
 
254 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.77 
 
 
254 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0676  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.48 
 
 
253 aa  148  7e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.153885 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
250 aa  148  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241835 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1841  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.66 
 
 
250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  36.69 
 
 
257 aa  145  6e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4914  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  36.9 
 
 
254 aa  144  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.96 
 
 
254 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0362  hypothetical protein  36.29 
 
 
257 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
255 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155421  hitchhiker  0.00000000000159857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4862  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.63 
 
 
254 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000522303  unclonable  0.000000385865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
255 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000309791  hitchhiker  0.00252207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
253 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
254 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000261149  unclonable  0.000000000503217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0557  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
254 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000797066  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0488  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.4 
 
 
253 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.596302  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01250  short-chain dehydrogenase, putative  37.08 
 
 
282 aa  141  8e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
250 aa  141  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0602  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
254 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0114024  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64840  putative short-chain dehydrogenase  36.67 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000142595  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292404 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
248 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467056  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0189644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5631  putative short-chain dehydrogenase  36.67 
 
 
253 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0679  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
250 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22723  normal  0.897045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
253 aa  135  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 
252 aa  135  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0691773  normal  0.0221679 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1976  3-hydroxy acid dehydrogenase  35.56 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1864  3-hydroxy acid dehydrogenase  35.56 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.612513  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
256 aa  135  9e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3915  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.0896324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>