More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0268 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 251 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0974  short chain dehydrogenase  54.22 
 
 		 230 aa  221  8e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0177058  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1729  short chain dehydrogenase  53.2 
 
 		 227 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.46 
 
 		 232 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91873  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.21 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0180181  normal  0.277757 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6051  short chain dehydrogenase  46.61 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0202908  normal  0.993323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1778  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  49.4 
 
 		 228 aa  188  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0854  short chain dehydrogenase  46.43 
 
 		 225 aa  188  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.42 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39280  short chain dehydrogenase  49 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7025  short chain dehydrogenase  46.15 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5763  short chain dehydrogenase  44.05 
 
 		 222 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5387  short chain dehydrogenase  44.05 
 
 		 222 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5476  short chain dehydrogenase  44.05 
 
 		 222 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0679291  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25540  short-chain alcohol dehydrogenase  41.77 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 280 aa  129  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  0.058004 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3934  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 		 261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00230  short-chain alcohol dehydrogenase  37.45 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 		 238 aa  98.6  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61312  predicted protein  30.89 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243713  normal  0.492851 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09357  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02370)  30.32 
 
 		 258 aa  94.4  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00364064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0389  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 		 270 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.45 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 		 291 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  32.02 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 244 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  32.05 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1627  oxidoreductase  27.69 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10780  short chain dehydrogenase  30.45 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.31 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09810  short-chain alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 		 261 aa  88.6  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0913042  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.23 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.18 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.71 
 
 		 238 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0112  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  32.03 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  32.03 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.31881  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.6 
 
 		 261 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  28.57 
 
 		 239 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  29.41 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 		 269 aa  86.3  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 		 344 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.46 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.25 
 
 		 240 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.77 
 
 		 254 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2063  short-chain dehydrogenase  28.51 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247773  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0441  short chain dehydrogenase  31.6 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.3 
 
 		 250 aa  85.5  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0530  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 		 248 aa  85.1  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.35 
 
 		 240 aa  85.1  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.65 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.21 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.91 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0438  short chain dehydrogenase  31.17 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  28.92 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.59 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000182624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.35 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0125509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.66 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2585  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.43 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102816  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05611  short chain dehydrogenase  23.51 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.713488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05911  short chain dehydrogenase  23.92 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1632  short chain dehydrogenase  29.18 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0924  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  28.74 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.77 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0358  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.53 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0323  clavaldehyde dehydrogenase  27.78 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.869868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00161492  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0818  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>