More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1011 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
258 aa  529  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.53 
 
 
261 aa  316  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.14 
 
 
261 aa  313  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.83 
 
 
264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.67 
 
 
260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.71 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  46.03 
 
 
275 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
260 aa  204  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.63 
 
 
275 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.63 
 
 
259 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.95 
 
 
269 aa  203  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.79 
 
 
262 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.79 
 
 
262 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.79 
 
 
262 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
269 aa  198  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.33 
 
 
264 aa  198  9e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
264 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
271 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
259 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 
262 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
271 aa  187  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  48.44 
 
 
258 aa  187  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
273 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
263 aa  185  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.91 
 
 
257 aa  183  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
263 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.82 
 
 
259 aa  175  5e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 
256 aa  175  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.22 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.327148 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2063  short-chain dehydrogenase  37.3 
 
 
261 aa  172  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247773  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3621  short-chain dehydrogenase  40.35 
 
 
258 aa  172  5.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
262 aa  171  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  39.22 
 
 
266 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.22 
 
 
259 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.65 
 
 
266 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 
286 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00749167  decreased coverage  0.00042824 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  40.8 
 
 
267 aa  169  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.18 
 
 
257 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 
298 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  41.74 
 
 
258 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
263 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
263 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
255 aa  166  4e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2064  oxidoreductase ( short-chain dehydrogenase)  43.52 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.694867  normal  0.0846624 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.859893  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 
273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
267 aa  162  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
262 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
259 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.996462  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
257 aa  159  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.57 
 
 
258 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
263 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
255 aa  156  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0274  short chain dehydrogenase/reductase family protein  38.4 
 
 
259 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
267 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
360 aa  155  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.68 
 
 
266 aa  155  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1969  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.49 
 
 
260 aa  155  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 
264 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036497  normal  0.609933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
259 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
259 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
260 aa  154  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.563613  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
259 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
259 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
267 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
267 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 
258 aa  153  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00673203  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 
256 aa  153  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.82 
 
 
255 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.28 
 
 
262 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.05 
 
 
344 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227726  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
262 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.04 
 
 
263 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  44.04 
 
 
321 aa  150  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
292 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.858349  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
256 aa  148  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  40.08 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000113464  decreased coverage  0.000120518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000430049  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
262 aa  146  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
266 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0353  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.97 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.45647  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
283 aa  145  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
266 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0344  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  31.97 
 
 
265 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
266 aa  143  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.197421 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  31.05 
 
 
259 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  31.45 
 
 
259 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
259 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.07 
 
 
268 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.39 
 
 
265 aa  144  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0206025  normal  0.910086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.07 
 
 
269 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.56 
 
 
257 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  0.87927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>