More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1632 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1632  short chain dehydrogenase  100 
 
 
235 aa  472  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0731  short chain dehydrogenase  80.43 
 
 
235 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.510402  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05381  short chain dehydrogenase  65.96 
 
 
235 aa  335  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07831  short chain dehydrogenase  69.36 
 
 
241 aa  321  7e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.956383 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05911  short chain dehydrogenase  61.7 
 
 
240 aa  311  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.884282  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1866  short chain dehydrogenase  60.85 
 
 
240 aa  308  5.9999999999999995e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0671437  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05911  short chain dehydrogenase  53.02 
 
 
244 aa  278  7e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05991  short chain dehydrogenase  53.45 
 
 
254 aa  275  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05611  short chain dehydrogenase  52.59 
 
 
244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.713488  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0535  short chain dehydrogenase  53.88 
 
 
244 aa  271  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.14 
 
 
240 aa  208  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  44.59 
 
 
242 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  44.59 
 
 
242 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  43.78 
 
 
241 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1596  short chain dehydrogenase  45.76 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 
241 aa  183  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3351  short chain dehydrogenase  40.69 
 
 
242 aa  164  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2026  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.24 
 
 
227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.293852 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 
257 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0295505  normal  0.114297 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.9 
 
 
259 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
267 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 
249 aa  112  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  40.96 
 
 
275 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.02 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.14 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
258 aa  108  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.66 
 
 
238 aa  108  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
240 aa  108  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 
264 aa  108  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 
275 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.63 
 
 
230 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
265 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.15353 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
240 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1484  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 
238 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0301161  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
246 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
236 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.157663  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
236 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.14 
 
 
235 aa  106  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0764891  hitchhiker  0.00221105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4474  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
270 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000662369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
255 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
258 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
261 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.48 
 
 
239 aa  105  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 
270 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 
241 aa  105  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
260 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0409  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
248 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.832513  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
245 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
244 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
237 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
267 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  33.15 
 
 
255 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 
238 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
267 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1867  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.35 
 
 
247 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0330312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.78 
 
 
248 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
269 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.7 
 
 
223 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.209414  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
262 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
267 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
260 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  31.06 
 
 
239 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
239 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
261 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
244 aa  102  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
239 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.91 
 
 
244 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
239 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
239 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.66 
 
 
238 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
239 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
242 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
242 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
242 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
242 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
242 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
269 aa  102  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
261 aa  101  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38394  predicted protein  34.09 
 
 
276 aa  101  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00142595  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
261 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2716  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
265 aa  101  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 
256 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227726  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  28.05 
 
 
236 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
256 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
265 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0355963  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
244 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.64 
 
 
239 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2980  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
271 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
227 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0180181  normal  0.277757 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
223 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
255 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  30.52 
 
 
304 aa  99.8  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
270 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>