More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1729 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1729  short chain dehydrogenase  100 
 
 
227 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0974  short chain dehydrogenase  57.14 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0177058  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 
251 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91873  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.34 
 
 
225 aa  164  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
231 aa  156  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.36 
 
 
227 aa  155  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0180181  normal  0.277757 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39280  short chain dehydrogenase  45.5 
 
 
230 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
280 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.42 
 
 
226 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6051  short chain dehydrogenase  43.64 
 
 
221 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0202908  normal  0.993323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7025  short chain dehydrogenase  46.52 
 
 
229 aa  148  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0854  short chain dehydrogenase  42.6 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25540  short-chain alcohol dehydrogenase  43.95 
 
 
255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1778  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  42.92 
 
 
228 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
254 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00230  short-chain alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3934  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
261 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5387  short chain dehydrogenase  40.27 
 
 
222 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5763  short chain dehydrogenase  40.27 
 
 
222 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5476  short chain dehydrogenase  40.27 
 
 
222 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0679291  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  33.92 
 
 
242 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  32.91 
 
 
241 aa  111  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 
242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  31.49 
 
 
247 aa  109  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
223 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.209414  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1596  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 
245 aa  106  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 
241 aa  105  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
247 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.8 
 
 
239 aa  105  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
338 aa  105  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.07 
 
 
323 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.132666  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 
242 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
317 aa  102  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
233 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
233 aa  101  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
242 aa  101  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
242 aa  101  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
242 aa  101  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
242 aa  101  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
242 aa  101  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
239 aa  101  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
239 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
239 aa  101  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
239 aa  101  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
239 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
249 aa  101  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4937  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.57 
 
 
239 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
243 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
252 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
293 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  0.058004 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
241 aa  99.4  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0535  short chain dehydrogenase  26.84 
 
 
244 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  31.33 
 
 
246 aa  99  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
274 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.33 
 
 
248 aa  98.6  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37020  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  39.55 
 
 
279 aa  98.2  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05381  short chain dehydrogenase  29.82 
 
 
235 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.16 
 
 
241 aa  98.2  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.94 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
253 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000671935 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1627  oxidoreductase  30.64 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0466  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  31.8 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.34924  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05911  short chain dehydrogenase  25.88 
 
 
244 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0924  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.91 
 
 
232 aa  96.3  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
269 aa  96.7  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
252 aa  96.3  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 
242 aa  96.3  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00246779  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.55 
 
 
230 aa  95.9  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
261 aa  95.9  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
255 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 
285 aa  95.1  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0506  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
281 aa  95.1  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4004  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
259 aa  95.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132038  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.83 
 
 
261 aa  94.7  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.38 
 
 
231 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.38 
 
 
231 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0409  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.95 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.832513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.9 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.563613  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4057  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
239 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
244 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
354 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.718494 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05611  short chain dehydrogenase  25.54 
 
 
244 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.713488  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 
265 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
255 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.48 
 
 
238 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 
247 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09810  short-chain alcohol dehydrogenase  37.18 
 
 
261 aa  94  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0913042  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07831  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 
241 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.956383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0958  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
263 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 
264 aa  93.2  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
291 aa  93.2  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>