More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4517 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 247 aa  500  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18690  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  48.56 
 
 		 244 aa  216  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 		 249 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.243265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.68 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.87 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.64 
 
 		 230 aa  112  8.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.38 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0783167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.51 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.51 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.36 
 
 		 265 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.162957 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  37.75 
 
 		 248 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.563613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 251 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.75 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0481676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 		 255 aa  108  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.51 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07831  short chain dehydrogenase  33.65 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.956383 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17071  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily  30.4 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.267297 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2860  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.82 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.981149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.63 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.82 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 		 248 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0429  short chain dehydrogenase  37.69 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.33 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235547  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4481  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.44 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643643  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 		 254 aa  105  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.73 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  30.7 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1381  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.85 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.049098  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  30.7 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3539  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1596  short chain dehydrogenase  31.95 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.47 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3818  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.2 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000182624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.30567  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198108  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2064  oxidoreductase ( short-chain dehydrogenase)  27.98 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.694867  normal  0.0846624 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  34.87 
 
 		 272 aa  102  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1239  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.92 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.95 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.69 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.092001  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 242 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3009  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.78 
 
 		 261 aa  102  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0803108 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2063  short-chain dehydrogenase  29.17 
 
 		 261 aa  102  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247773  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0620  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.8 
 
 		 250 aa  101  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.890979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1887  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.96 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0166984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2989  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.88 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0851531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0818  short chain dehydrogenase  29.79 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0938  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.51 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 		 241 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.91 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>